SAXSdb — 7qup

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1 chain

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 65	Tubulin beta-1 chain × 26 （Q24560） GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 39 MAGNESIUM ION × 39 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBA1_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 10A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 10C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 10E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 11A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 11C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 11E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 12A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 12C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 12E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 13A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 13C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 13E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 1A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 1C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 1E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 2A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 2C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 2E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 3A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 3C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 3E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 4A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 4C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 4E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 5A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 5C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 5E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 6A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 6C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 6E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 7A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 7C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 7E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 8A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 8C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 8E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 9A； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 9C； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436 作者链 9E； PDB构建体 26–461； UniProt 1–436

Tubulin beta-1 chain

物种未注明

UniProt Q24560

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 65	Tubulin alpha-1 chain × 39 （P06603） GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 39 MAGNESIUM ION × 39 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBB1_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 10B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 10D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 11B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 11D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 12B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 12D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 13B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 13D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 1B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 1D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 2B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 2D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 3B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 3D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 4B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 4D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 5B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 5D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 6B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 6D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 7B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 7D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 8B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 8D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 9B； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426 作者链 9D； PDB构建体 1–425； UniProt 2–426

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7qup
沉积日期 deposition_date	2022-01-18
结构标题 title	D. melanogaster 13-protofilament microtubule
关键词 keywords	Cytyoskeleton, microtubules, cytomotive filaments, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7qup__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7qup__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7qup__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	135.90 Å
总 Rg	135.90 Å
原子数	219271
残基数	27664
排除体积	3874600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7qup__assembly_1__model_1`	65-meric （65）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tubulin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	52772.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	39

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	10A,10C,10E,11A,11C,11E,12A,12C,12E,13A,13C,13E,1A,1C,1E,2A,2C,2E,3A,3C,3E,4A,4C,4E,5A,5C,5E,6A,6C,6E,7A,7C,7E,8A,8C,8E,9A,9C,9E
原子数 atom_count	219271

MHHHHHHEDQVDPRLIDGKGGGGRPMRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTVGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVVDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIVDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLIFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFAIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLVTYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCMLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALEKDYEEVGMDSGDGEGEGAEEY

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Drosophila melanogaster

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tubulin beta-1 chain
分子量 formula_weight	47681.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	10B,10D,11B,11D,12B,12D,13B,13D,1B,1D,2B,2D,3B,3D,4B,4D,5B,5D,6B,6D,7B,7D,8B,8D,9B,9D

REIVHIQAGQCGNQIGAKFWEIISDEHGIDATGAYHGDSDLQLERINVYYNEASGGKYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTYSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNIQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQ

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	39

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	39

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	39594

D. melanogaster 13-protofilament microtubule

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin beta-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7qup__assembly_1__model_1

7qup__assembly_1__model_1 | I(q)

7qup__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

D. melanogaster 13-protofilament microtubule

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin beta-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7qup__assembly_1__model_1

7qup__assembly_1__model_1 | I(q)

7qup__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)