SAXSdb — 7qvm

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin × 1 （P01178） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A1W2PS82_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–57； UniProt 1–57

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

Homo sapiens

UniProt B3KP89

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin × 1 （P01178） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	B3KP89_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 66–115； UniProt 182–231

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

Homo sapiens

UniProt P09471

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin × 1 （P01178） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GNAO_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 116–227； UniProt 242–353

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1

Homo sapiens

UniProt P62873

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ; × 1 （A0A1W2PS82,B3KP89,P09471） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin × 1 （P01178） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GBB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 16–354； UniProt 2–340

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2

Homo sapiens

UniProt P59768

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ; × 1 （A0A1W2PS82,B3KP89,P09471） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Oxytocin × 1 （P01178） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GBG2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

Oxytocin

物种未注明

UniProt P01178

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ; × 1 （A0A1W2PS82,B3KP89,P09471） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin receptor × 1 （P30559） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NEU1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–9； UniProt 20–28

Oxytocin receptor

Homo sapiens

UniProt P30559

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ; × 1 （A0A1W2PS82,B3KP89,P09471） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62873） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 （P59768） Oxytocin × 1 （P01178） Antibody fragment scFv16 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	OXYR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–359； UniProt 1–359

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7qvm
沉积日期 deposition_date	2022-01-21
结构标题 title	Human Oxytocin receptor (OTR) oxytocin Gq chimera (mGoqi) complex
关键词 keywords	GPCR, OTR, G protein, OT, scFv16, mGoqi, oxytocin, membrane protein, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7qvm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7qvm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7qvm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.36 Å
Rg（电子密度）	37.28 Å
总 Rg	37.58 Å
原子数	8528
残基数	1094
排除体积	152570 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7qvm__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;
分子量 formula_weight	25650.4 kDa
突变 mutation	E9D,R10K,L13V,A18M,I344L,A345Q,N346L,G350E,C351Y,G352N,Y354V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8528

MGCTLSAEDKAAVERSKMIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGADNSGKSTIVKQMKIIHGGSGGSGGTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVDLSDYNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDAAAYIQAQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNAQVIFDAVTDIILQMNLREYNLV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1
分子量 formula_weight	39086.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MHHHHHHHHHHGSSGSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2
分子量 formula_weight	7861.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Oxytocin
分子量 formula_weight	1008.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

CYIQNCPLGX

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Oxytocin receptor
分子量 formula_weight	39777.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MEGALAANWSAEAANASAAPPGAEGNRTAGPPRRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNACVLLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRTYRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFSLREVADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLATCYGLISFKIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVCWTPFFFVQMWSVWDANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRFLCCSASYLKGRRLGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Antibody fragment scFv16
分子量 formula_weight	26679.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

DVQLVESGGGLVQPGGSRKLSCSASGFAFSSFGMHWVRQAPEKGLEWVAYISSGSGTIYYADTVKGRFTISRDDPKNTLFLQMTSLRSEDTAMYYCVRSIYYYGSSPFDFWGQGTTLTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVMTQATSSVPVTPGESVSISCRSSKSLLHSNGNTYLYWFLQRPGQSPQLLIYRMSNLASGVPDRFSGSGSGTAFTLTISRLEAEDVGVYYCMQHLEYPLTFGAGTKLELKAAA

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	7qvmA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	7qvmB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	7qvmS01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7qvmS02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.25 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	392369

Human Oxytocin receptor (OTR) oxytocin Gq chimera (mGoqi) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha,cDNA FLJ31446 fis, clone NT2NE2000909, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha 1 ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Oxytocin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Oxytocin receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7qvm__assembly_1__model_1

7qvm__assembly_1__model_1 | I(q)

7qvm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer