SAXSdb — 7ruc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase GET3

Danio rerio

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	Golgi to ER traffic protein 4 homolog × 2 （Q7L5D6） Large proline-rich protein BAG6 × 2 （P46379） Ubiquitin-like protein 4A × 1 （P11441） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GET3_DANRE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–343； UniProt 1–341 作者链 B； PDB构建体 3–343； UniProt 1–341

Golgi to ER traffic protein 4 homolog

Homo sapiens

UniProt Q7L5D6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	ATPase GET3 × 2 （Q6IQE5） Large proline-rich protein BAG6 × 2 （P46379） Ubiquitin-like protein 4A × 1 （P11441） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GET4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 7–333； UniProt 1–327 作者链 F； PDB构建体 7–333； UniProt 1–327

Large proline-rich protein BAG6

Homo sapiens

UniProt P46379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	ATPase GET3 × 2 （Q6IQE5） Golgi to ER traffic protein 4 homolog × 2 （Q7L5D6） Ubiquitin-like protein 4A × 1 （P11441） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BAG6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 4–132； UniProt 1004–1132 作者链 G； PDB构建体 4–132； UniProt 1004–1132

Ubiquitin-like protein 4A

Homo sapiens

UniProt P11441

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	ATPase GET3 × 2 （Q6IQE5） Golgi to ER traffic protein 4 homolog × 2 （Q7L5D6） Large proline-rich protein BAG6 × 2 （P46379） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBL4A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ruc
沉积日期 deposition_date	2021-08-16
结构标题 title	Metazoan pre-targeting GET complex with SGTA (cBUGGS)
关键词 keywords	ATPase, complex, membrane protein chaperone, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ruc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ruc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ruc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.93 Å
Rg（电子密度）	40.00 Å
总 Rg	39.97 Å
原子数	10766
残基数	1344
排除体积	192120 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7ruc__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATPase GET3
分子量 formula_weight	38574.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.-.-
突变 mutation	D68N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	10766

GHMAASVEDEFEDAPDVEPLEPTLKNIIEQKSLKWIFVGGKGGVGKTTCSCSLAVQLAAVRESVLIISTNPAHNISDAFDQKFSKVPTKVKGYDNLFAMEIDPSLGVAELPDEFFEEDNMLSMGKKMMQEAMSAFPGIDEAMSYAEVMRLVKGMNFSVVVFDTAPTGHTLRLLNFPTIVERGLGRLMQIKNQISPFISQMCNMLGLGDMNADQLASKLEETLPVIRSVSEQFKDPEQTTFICVCIAEFLSLYETERLIQELAKCRIDTHNIIVNQLVFPDNERPCKMCEARHKIQSKYLDQMEDLYEDFHIVKLPLLPHEVRGADKVNTFSKQLLEPYSPPKK

来源 Source

来源生物 organism	Danio rerio
通用名 common_name	Zebrafish, Brachydanio rerio
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7955
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Golgi to ER traffic protein 4 homolog
分子量 formula_weight	37054.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

GPLGSTMAAAAAMAEQESARNGGRNRGGVQRVEGKLRASVEKGDYYEAHQMYRTLFFRYMSQSKHTEARELMYSGALLFFSHGQQNSAADLSMLVLESLEKAEVEVADELLENLAKVFSLMDPNSPERVTFVSRALKWSSGGSGKLGHPRLHQLLALTLWKEQNYCESRYHFLHSADGEGCANMLVEYSTSRGFRSEVDMFVAQAVLQFLCLKNKSSASVVFTTYTQKHPSIEDGPPFVEPLLNFIWFLLLAVDGGKLTVFTVLCEQYQPSLRRDPMYNEYLDRIGQLFFGVPPKQTSSYGGLLGNLLTSLMGSSEQEDGEESPSDGSPIELD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Large proline-rich protein BAG6
分子量 formula_weight	14618.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,G

GPGSAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPLSDAYLSGMPAKRRKTMQGEGPQLLLSEAVSRAAKAAGARPLTSPESLSRDLEAPEVQESYRQQLRSDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAQRAFADDP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Ubiquitin-like protein 4A
分子量 formula_weight	18741.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MQLTVKALQGRECSLQVPEDELVSTLKQLVSEKLNVPVRQQRLLFKGKALADGKRLSDYSIGPNSKLNLVVKPLEKVLLEEGEAQRLADSPPPQVWQLISKVLARHFSAADASRVLEQLQRDYERSLSRLTLDDIERLASRFLHPEVTETMEKGFSKGSENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7rucC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	7rucF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	56845

Metazoan pre-targeting GET complex with SGTA (cBUGGS)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase GET3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Golgi to ER traffic protein 4 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Large proline-rich protein BAG6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquitin-like protein 4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7ruc__assembly_1__model_1

7ruc__assembly_1__model_1 | I(q)

7ruc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)