7sc7

Synechocystis PCC 6803 Phycobilisome core from up-down rod conformation

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Allophycocyanin alpha chain

物种未注明

UniProt Q01951

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PHAA_SYNY3
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 AA; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AC; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AH; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AJ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AN; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AP; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AR; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AV; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AX; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AZ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BH; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BJ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BO; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BQ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BU; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BW; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BY; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CB; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CD; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CF; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CP; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CR; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CT; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CW; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CY; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DA; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DG; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DI; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DK; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DN; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DP; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DR; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161

Allophycocyanin beta chain

物种未注明

UniProt Q01952

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 APCB_SYNY3
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 AB; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AD; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AF; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AI; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AL; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AO; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AQ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AS; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AU; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AW; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 AY; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BI; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BK; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BM; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BP; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BS; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BV; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BX; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BZ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CC; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CE; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CG; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CQ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CS; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CU; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CX; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 CZ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DB; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DH; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DJ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DL; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DO; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DQ; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 DS; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161

Allophycocyanin subunit alpha-B

物种未注明

UniProt P72870

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APCD_SYNY3
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 AE; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 BL; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161

Allophycocyanin subunit beta-18

物种未注明

UniProt P74551

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 APCF_SYNY3
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 AK; PDB构建体 1–169; UniProt 1–169 作者链 BR; PDB构建体 1–169; UniProt 1–169

Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core

物种未注明

UniProt Q01950

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PYC1_SYNY3
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 BA; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67 作者链 BB; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67 作者链 CI; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67 作者链 CJ; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67 作者链 DD; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67 作者链 DU; PDB构建体 1–67; UniProt 1–67

Phycobiliprotein ApcE

物种未注明

UniProt Q55544

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APCE_SYNY3
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 BD; PDB构建体 1–896; UniProt 1–896 作者链 CL; PDB构建体 1–896; UniProt 1–896

Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG

物种未注明

UniProt P73093

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Sll1873 protein × 2 (P74135) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PYG_SYNY3
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 BF; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 CN; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 DE; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 DF; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 DV; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 DW; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249

Sll1873 protein

物种未注明

UniProt P74135

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 86 Allophycocyanin alpha chain × 32 (Q01951) Allophycocyanin beta chain × 34 (Q01952) Allophycocyanin subunit alpha-B × 2 (P72870) Allophycocyanin subunit beta-18 × 2 (P74551) Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 6 (Q01950) Phycobiliprotein ApcE × 2 (Q55544) Phycobilisome rod-core linker polypeptide CpcG × 6 (P73093) PHYCOCYANOBILIN × 72 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 P74135_SYNY3
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 BG; PDB构建体 1–121; UniProt 1–121 作者链 CO; PDB构建体 1–121; UniProt 1–121

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7sc7
沉积日期 deposition_date2021-09-27
结构标题 titleSynechocystis PCC 6803 Phycobilisome core from up-down rod conformation
关键词 keywordsComplex, light harvesting, pigment, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7sc7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7sc7__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7sc7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)76.78 Å
Rg(电子密度)76.32 Å
总 Rg76.44 Å
原子数107930
残基数13756
排除体积1928300 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7sc7__assembly_1__model_1 86-meric (86) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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7. 引用文献 (1)