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7sol

Crystal Structures of the bispecific ubiquitin/FAT10 activating enzyme, Uba6

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 162.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6

Homo sapiens

UniProt A0AVT1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 37–1052 突变：C625A Ubiquitin × 1 （P69326） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M NaF 分辨率 2.25 Å R-free 0.206
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 37–1052 突变：C625A Ubiquitin × 1 （P69326） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M NaF 分辨率 2.25 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SOL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PVN Crystal Structure of Human UBA6 in Complex with ATP 提交 2021-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1052（1052 aa）
突变：C625A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Na-cacodylate, 0.16 M Ca-acetate, 15% PEG 8000 and 16% Glycerol
分辨率 2.71 Å R-free 0.262
7PVN Crystal Structure of Human UBA6 in Complex with ATP 提交 2021-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–1052（1052 aa）
突变：C625A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Na-cacodylate, 0.16 M Ca-acetate, 15% PEG 8000 and 16% Glycerol
分辨率 2.71 Å R-free 0.262
7PYV Crystal structure of human UBA6 in complex with the ubiquitin-like modifier FAT10 提交 2021-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–623（623 aa）
链 A 900–1052（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；277 K；0.5 M Lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.4, 25% PEG 6000
分辨率 3.27 Å R-free 0.239
7PYV Crystal structure of human UBA6 in complex with the ubiquitin-like modifier FAT10 提交 2021-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–623（623 aa）
链 B 900–1052（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；277 K；0.5 M Lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.4, 25% PEG 6000
分辨率 3.27 Å R-free 0.239
9QGW Consensus structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (singly loaded) 提交 2025-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9QH5 Consensus structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (doubly loaded) 提交 2025-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9QHI Structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (cluster 0) 提交 2025-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.27 Å
9QIA Structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (cluster 2) 提交 2025-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.38 Å
9QIC Consensus structure of UBA6 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9QIG Structure of UBA6 (cluster 2) 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.94 Å
9QII Structure of UBA6 (cluster 3) 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9QIM Consensus structure of UBA6-BIRC6 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
9QIO Structure of UBA6-BIRC6 (cluster 0) 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.22 Å
9QIP Structure of UBA6-BIRC6 (cluster 4) 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
9QIV Consensus structure of UBA6-BIRC6 (alternative conformation) 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–1052（1052 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å

共 13 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UBA6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 5–1020； UniProt 37–1052 作者链 C； PDB构建体 5–1020； UniProt 37–1052

Ubiquitin

Triticum aestivum

UniProt P69326

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–76 突变：K6R, K11R, K27R, K29R, K33R, K48R, K63R Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 × 1 （A0AVT1） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M NaF 分辨率 2.25 Å R-free 0.206
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–76 突变：K6R, K11R, K27R, K29R, K33R, K48R, K63R Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 × 1 （A0AVT1） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M NaF 分辨率 2.25 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SOL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 W 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 1–76（76 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246
7K5J Structure of an E1-E2-ubiquitin thioester mimetic 提交 2020-09-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–76（76 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.91；291 K；0.2 M NH4Ac, pH 6.91, 20% PEG3350, 0.02% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.02% 1,2,3,-Heptanetriol, 0.02% Diethylenetriaminepentakis (methylphosphonic acid), 0.02% D-Sorbitol, 0.02% Glycerol, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
分辨率 3.42 Å R-free 0.246

共 1 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UBIQ_WHEAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 8–83； UniProt 1–76 作者链 D； PDB构建体 8–83； UniProt 1–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7sol

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7sol
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7sol
沉积日期 deposition_date2021-10-31
结构标题 titleCrystal Structures of the bispecific ubiquitin/FAT10 activating enzyme, Uba6
关键词 keywords;UBIQUITIN, E1, ADENYLATION, THIOESTER BOND, E2, FAT10, IP6, LIGASE, ATP-binding, nucleotide binding, conformational change, SIGNALING PROTEIN, SIGNALING PROTEIN-Ligase complex ;; SIGNALING PROTEIN/Ligase
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier46.61 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron46.58 Å
零角强度 I(0) i0841851000.00
分子量 molecular_weight243020.0 kDa
排除体积 excluded_volume305350 ų
包络体积 envelope_volume418330 ų
水化壳体积 shell_volume75144 ų
包络直径 envelope_diameter172.3 Å
壳层 Rg shell_rg50.61 Å
包络 Rg envelope_rg46.24 Å
形状 Rg shape_rg46.58 Å
总 Rg total_rg46.76 Å
总原子数 total_atoms17106
残基数 n_residues2144
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax162.0 Å
Rg (实空间) rg_real46.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.39 Å
I(0) (实空间) i0_real8.4180e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4950e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal46.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal841700000.0000
解质量估计 total_estimate0.8628
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary52.4 Å
偏度 Skewness skewness0.469
峰度 Kurtosis kurtosis-0.117
角度范围 angular_range— – 0.1700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha120000000.0000
实空间数据点数 n_real_points35
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.805; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.797
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7solA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180 — Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain
结构域编号 domain_id7solA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Ubiquitin-activating enzyme E1, UFD domain
结构域编号 domain_id7solB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id7solD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)