SAXSdb — 7tqs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 22	pAbC-3 light chain × 1 pAbC-3 heavy chain × 1 VP3 × 5 （Q71LY2） MYRISTIC ACID × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7T7N6_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	3, 4, 6
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–298； UniProt 582–879 作者链 e； PDB构建体 1–298； UniProt 582–879 作者链 i； PDB构建体 1–298； UniProt 582–879 作者链 m； PDB构建体 1–298； UniProt 582–879 作者链 q； PDB构建体 1–298； UniProt 582–879 作者链 b； PDB构建体 1–272； UniProt 70–341 作者链 f； PDB构建体 1–272； UniProt 70–341 作者链 j； PDB构建体 1–272； UniProt 70–341 作者链 n； PDB构建体 1–272； UniProt 70–341 作者链 r； PDB构建体 1–272； UniProt 70–341 作者链 d； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69 作者链 h； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69 作者链 l； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69 作者链 p； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69 作者链 t； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

VP3

物种未注明

UniProt Q71LY2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 22	pAbC-3 light chain × 1 pAbC-3 heavy chain × 1 VP1 × 5 （Q7T7N6） VP2 × 5 （Q7T7N6） VP4 × 5 （Q7T7N6） MYRISTIC ACID × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q71LY2_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–240； UniProt 342–581 作者链 g； PDB构建体 1–240； UniProt 342–581 作者链 k； PDB构建体 1–240； UniProt 342–581 作者链 o； PDB构建体 1–240； UniProt 342–581 作者链 s； PDB构建体 1–240； UniProt 342–581

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7tqs
沉积日期 deposition_date	2022-01-26
结构标题 title	Coxsackievirus A21 capsid subdomain in complex with mouse polyclonal antibody pAbC-3
关键词 keywords	polyclonal antibodies, immune complex, cryoEM, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7tqs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.80 Å
Rg（电子密度）	52.61 Å
总 Rg	52.91 Å
原子数	34113
残基数	4451
排除体积	604010 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7tqs__assembly_1__model_1`	22-meric （22）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	pAbC-3 light chain
分子量 formula_weight	8188.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	34113

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	pAbC-3 heavy chain
分子量 formula_weight	9039.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	VP1
分子量 formula_weight	33234.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,e,i,m,q

GIEDLIDTAIKNALRVSQPPSTQSTEATSGVNSQEVPALTAVETGASGQAIPSDVVETRHVVNYKTRSESCLESFFGRAACVTILSLTNSSKSGEEKKHFNIWNITYTDTVQLRRKLEFFTYSRFDLEMTFVFTENYPSTASGEVRNQVYQIMYIPPGAPRPSSWDDYTWQSSSNPSIFYMYGNAPPRMSIPYVGIANAYSHFYDGFARVPLEGENTDAGDTFYGLVSINDFGVLAVRAVNRSNPHTIHTSVRVYMKPKHIRCWCPRPPRAVLYRGEGVDMISSAILPLAKVDSITTF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	VP2
分子量 formula_weight	29918.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,f,j,n,r

SPNVEACGYSDRVRQITLGNSTITTQEAANAIVAYGEWPTYINDSEANPVDAPTEPDVSSNRFYTLESVSWKTTSRGWWWKLPDCLKDMGMFGQNMYYHYLGRSGYTIHVQCNASKFHQGALGVFLIPEFVMACNTESKTSYVSYINANPGERGGEFTNTYNPSNTDASEGRKFAALDYLLGSGVLAGNAFVYPHQIINLRTNNSATIVVPYVNSLVIDCMAKHNNWGIVILPLAPLAFAATSSPQVPITVTIAPMCTEFNGLRNITVPVHQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	VP3
分子量 formula_weight	26596.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,g,k,o,s

GLPTMNTPGSNQFLTSDDFQSPCALPNFDVTPPIHIPGEVKNMMELAEIDTLIPMNAVDGKVNTMEMYQIPLNDNLSKAPIFCLSLSPASDKRLSHTMLGEILNYYTHWTGSIRFTFLFCGSMMATGKLLLSYSPPGAKPPTNRKDAMLGTHIIWDLGLQSSCSMVAPWISNTVYRRCARDDFTEGGFITCFYQTRIVVPASTPTSMFMLGFVSACPDFSVRLLRDTPHISQSKLIGRTQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	VP4
分子量 formula_weight	7442.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,h,l,p,t

MGAQVSTQKTGAHENQNVAANGSTINYTTINYYKDSASNSATRQDLSQDPSKFTEPVKDLMLKTAPALN

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MYRISTIC ACID
分子量 formula_weight	228.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	7tqsb01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	7tqsf01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	7tqsj01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	7tqsn01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	7tqsr01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	29282

Coxsackievirus A21 capsid subdomain in complex with mouse polyclonal antibody pAbC-3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7tqs__assembly_1__model_1

7tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

7tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Coxsackievirus A21 capsid subdomain in complex with mouse polyclonal antibody pAbC-3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7tqs__assembly_1__model_1

7tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

7tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)