7u06

Structure of the yeast TRAPPII-Rab11/Ypt32 complex in the closed/open state (composite structure)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TRS65_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–560； UniProt 1–560 作者链 c； PDB构建体 1–560； UniProt 1–560

TRAPP-associated protein TCA17

物种未注明

UniProt P32613

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TCA17_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–152； UniProt 1–152 作者链 d； PDB构建体 1–152； UniProt 1–152

Trafficking protein particle complex subunit 33

物种未注明

UniProt Q99394

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TRS33_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268 作者链 e； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268

Trafficking protein particle complex subunit BET3

物种未注明

UniProt P36149

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	BET3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193 作者链 I； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193 作者链 f； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193 作者链 i； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193

Trafficking protein particle complex subunit BET5

物种未注明

UniProt Q03630

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

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UniProt名称	BET5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 g； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

Trafficking protein particle complex subunit 23

物种未注明

UniProt Q03784

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

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UniProt名称	TRS23_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–219； UniProt 1–219 作者链 h； PDB构建体 1–219； UniProt 1–219

Trafficking protein particle complex subunit 31

物种未注明

UniProt Q03337

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TRS31_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 j； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

Trafficking protein particle complex subunit 20

物种未注明

UniProt P38334

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

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UniProt名称	TRS20_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 k； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175

GTP-binding protein YPT32/YPT11

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P51996

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

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UniProt名称	YPT32_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 l； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220

Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130

物种未注明

UniProt Q03660

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 × 2 （Q04183） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

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UniProt名称	TR130_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1102； UniProt 1–1102 作者链 b； PDB构建体 1–1102； UniProt 1–1102

Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120

物种未注明

UniProt Q04183

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 （P32893） TRAPP-associated protein TCA17 × 2 （P32613） Trafficking protein particle complex subunit 33 × 2 （Q99394） Trafficking protein particle complex subunit BET3 × 4 （P36149） Trafficking protein particle complex subunit BET5 × 2 （Q03630） Trafficking protein particle complex subunit 23 × 2 （Q03784） Trafficking protein particle complex subunit 31 × 2 （Q03337） Trafficking protein particle complex subunit 20 × 2 （P38334） GTP-binding protein YPT32/YPT11 × 1 （P51996） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 （Q03660） Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 × 2 Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65 × 2 PALMITIC ACID × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TR120_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1289； UniProt 1–1289 作者链 a； PDB构建体 1–1289； UniProt 1–1289

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7u06
沉积日期 deposition_date	2022-02-17
结构标题 title	Structure of the yeast TRAPPII-Rab11/Ypt32 complex in the closed/open state (composite structure)
关键词 keywords	complex, GTPase, Guanosine Exchange Factor, GEF, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7u06__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7u06__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7u06__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	104.80 Å
总 Rg	104.50 Å
原子数	127462
残基数	8151
排除体积	1144900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7u06__assembly_1__model_1`	27-meric （27）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65
分子量 formula_weight	63434.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c
原子数 atom_count	127470

MECFVPLRCDLDGSNIEQLRQSHLSRKFIIFDEQLNLWLWFQGNSQENKRFVLQNMIILINEAQVTRTSTIDDYFTQVENNENLWRLKNDCCSKILFKSNVVMNNGYNNQIKFVFEYKSVDANFNNQDSLQDPQAKYTLDKYSSEEILPSFEPVYSWSSAATKSSKNTNNHLEKNNRATHRVSSKNSEVHEADVSRNPNTFTLKLQYPIFSLLNMRLRNISLKSEHCILSSLDFQTSKASEQLTKKFIYPQEHNSFLKLNFQEISYKLIDGTSQIELDPICPLKVPLTAFSYDSISATFKLVLLPKSTQPHRVKITLAYELELHPNLKLPVRTSWETEVTLKRSMPISSTSSQYSSNNNNTNHSASFNGAANNVNSGGLANLRLGGVSSSRFSLGAASTTSLVNSKLSNVKFKFINSNIKVIKGEKFTMRLQIINSSSSPLDLVVYYNNTINPIPSANNVRNSNGINNCGMNNGTIPNSPLTLENQYQLHNKYRKIAEGIILLSNDYKIPVVPPRETYFADLRFIGIMSGYYGTLSGLKVLDLNTNELIEVGNGASVLIQ

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TRAPP-associated protein TCA17
分子量 formula_weight	17371.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MSLRPCFVSLIDESDKPILIYVPNEAENEMNDVLKYNVLSNISLDYFESALVEWHSLDSKPLLKSIFQLEGVSVFAMLIKQTGLKIVIGFEQKSLSGADDEFEAINQIFETVRKIYIRVKCNPLLVSGDEKSIIKSLERKFDELFISTEVEL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit 33
分子量 formula_weight	30786.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MSSTHSNNVGHPQSSPQGPLTEQQRAQQQYQIFENSLPKVSQSVYQMLLNEMVPLAMGIERQISGDVISSDSNVTSENGNINNMIKRLKIEEHHTVDIIRSHNLIHELYKADEEEKEKVLARLRNIGFQIGLKLSELLIFSNNPNLKFKEMDLLLIMKFICRDVWKQIFGKQIDNLKTNHRGTFYLLDYDYRPIQSFSLEEDAKNEELKMIEPFLEIPVGIIRGVLSSLGYSSEEVICLASFIDRPTDRPKTAFPKGVSFHVQVTMPQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit BET3
分子量 formula_weight	22152.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,I,f,i

MVSTTQSRSLKAMGEEIWKNKTEKINTELFTLTYGSIVAQLCQDYERDFNKVNDHLYSMGYNIGCRLIEDFLARTALPRCENLVKTSEVLSKCAFKIFLNITPNITNWSHNKDTFSLILDENPLADFVELPMDAMKSLWYSNILCGVLKGSLEMVQLDCDVWFVSDILRGDSQTEIKVKLNRILKDEIPIGED

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit BET5
分子量 formula_weight	18453.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,g

MGIYSFWIFDRHCNCIFDREWTLASNSASGTINSKQNEEDAKLLYGMIFSLRSITQKLSKGSVKNDIRSISTGKYRVHTYCTASGLWFVLLSDFKQQSYTQVLQYIYSHIYVKYVSNNLLSPYDFAENENEMRGQGTRKITNRNFISVLESFLAPMVNQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit 23
分子量 formula_weight	24889.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

MAIETILVINKSGGLIYQRNFTNDEQKLNSNEYLILASTLHGVFAIASQLTPKALQLTQQTNIENTIPYIPYVGMSSNRSDTRNGGGNNNKHTNNEKLGSFKGDDFFKEPFTNWNKSGLRQLCTDQFTMFIYQTLTGLKFVAISSSVMPQRQPTIATTDKPDRPKSTSNLAIQIADNFLRKVYCLYSDYVMKDPSYSMEMPIRSNLFDEKVKKMVENLQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit 31
分子量 formula_weight	31755.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MSQRIIQPSASDQQFPGKSDGYEYTVGPKQAITSEASTTYIPSRIYSESLLFKRQEASLSAMAFLFQEMISQLHRTCKTAGDFETKLSDYGHNIGIRLLELLNFRASVSPSSLPRASAFLSQNESSSKLSNASNSPGMLANSSTATSASANERLQEKQTESLSNYITKMRRRDLKILDILQFIHGTLWSYLFNHVSDDLVKSSERDNEYMIVDNFPTLTQFIPGENVSCEYFVCGIIKGFLFNAGFPCGVTAHRMPQGGHSQRTVYLIQFDRQVLDREGLRFG

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex subunit 20
分子量 formula_weight	19721.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MPQYFAIIGKKDNPVYEIEFTNAENPQGFPQDLKELNPFILHASLDIVEDLQWQINPTSQLNGNGGNGSNGGGGFLRSRAVNNTDNCYLGKVDHFYGLAITAYISYSGMKFVMIHGNSANSSVVIDDNNMRSFYQEVHELYVKTLMNPFYKITDPIRSPAFDSRVRTLARKHLSK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	GTP-binding protein YPT32/YPT11
分子量 formula_weight	25309.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MSNEDYGYDYDYLFKIVLIGDSGVGKSNLLSRFTTDEFNIESKSTIGVEFATRTIEVENKKIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDISKSSSYENCNHWLTELRENADDNVAVGLIGNKSDLAHLRAVPTDEAKNFAMENQMLFTETSALNSDNVDKAFRELIVAIFQMVSKHQVDLSGSGTNNMGSNGAPKGPTISLTPAPKEDKKKKSSNHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130
分子量 formula_weight	128424.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MDKEIYCGSVPVSYFDPFDLFESLRPEFQQILPLDNIHWKAFDGTVRTVNRLPIELIPEGRGEADKSNDEQPFIRFLIVNCISIDQYRAKVRPLVRQWLPNLESVSSSTGEKMIYKPIILLYANSEVVDSNLFKSVSLMEKFGKDFPHVQTLEVRSVYRSPKERQEFWNQFSQKIKASVLSIFQKRLTHLQHSLANLQKGNNFEEQLLTREKLYELYVVFNILEDASLELQKIKKEILRRNMNMPDGKLQVPFESSSKSDESLGSIIIEGTLDKFQLHKYFFIRRLRLLKLEDQTLTAFVGAFQLIKNFIESISIEYRKSVRLLEFKHYFITSMLSYFEFENVSNPLLCEIKAELLMLKRDNWVQGVMATSGYRLMDKNYPNSDVKYKFDLLKETFVDETVFQENFLTLTKEILSLFNKCEGKRQRIVDILSIEIGLLYYQGKKYEEAVSLFLSCYEYYTQTNWNSIGLKILQVFIDSLSHCPKLDVLQIDGESVSASAVLTNAFLNILKLCKDNDSKEIWWKKFMDLQMKNNIHLMYPLDGLFEVTLNSKVHLARANVSAIEVNLKSYGFPEDISTKTMRLSLKNMGGDVIVFGASDFLLKKGENKLILECRDIMYGEFSLLSFEIIVEGITFVKEFPENQDEFIVVPEIYCKESTKVLVKQAHNLNLGEYALELKSVQSDALESLQVEVEVQKNIGNMKNLPVSFSMDEIQARKRYNTPFENVRLEYYLLDQITAFDLIIKTSFTKKNDQGTFGETKKVRIQCYLQLSVSVEDIFKKDIFFFKFLLNSSVREEPVILYSSELSAPDTRNDYNIRGDYIATTPALITFDGNESFINCYEITANNNFDSKDIFNLKVRYNTLKEQLDCFITDAVLIEGDVEWFILFEKWKTFWELEILKKLKYDYDAFKENRIIRLLKTSIDLNKTKSKIRNLCIEKAVLDKILICLNKVSRGIAVCNTDMDEYVRNLVPKQLTVPVQLPGFEQFFHVQFEQMETSHDALHDTIATIGNSLSYTVIVENLSGQWGQDVIDDGGYIFEILSSNEWLIHGQKRCAIKEKRKEFEVHLIPLKKGYLNFPRVEITNINGKSCRVDHSNAFESILIFAA

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120
分子量 formula_weight	147823.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a

MNILKHFPSYVGPSKIRTLVIPIGHWTRKEFNNAVQKLSEFNEIHLSDVTPIDSPIFTPQGFPHGKLFFDFLTIDHDDALELFLYDFEPFRKTFVIIGLVNDYSDPLTNLNFMKEKYPTLISPNLVYASSTPTKELEQTIDTMENVFASSPDMQKNIETIMCDIARNFLTALNSYYSSYKHVTLRSPGAIGGNAVLKTTLIRQNSYTSSSSSTPMSAVQSSVSSSSKAGSVTTASKRLSSFEMTTNSLKRSASLKLATTLSTSENRSQQKSLGRQMKILGNFQLLAGRYVDALNSFVDAITTLYKVRDYLWLGSALDGISICFLLLSYLGLSYQIPQIVSLICPVEKLNFESSSTGISPVDSNSKATASTTASSTPRNSISIAAMQSPRNSIMSLSAPALNIDVENINLPLLIKCISDKVLYYYDLSLMHNSEYAPQVVYCEFLLKTLTFMTSCYKSSEFSKDVLDNIVKNQHRALSDIPNSPMFPRFEVYFYSNKLFELQLKEMQVEAQIKIYSTMAEVYRLLGYKRKQLFVLRLLMVALLATPNKIAWHPDYRTLIDTIIELLNINESEAKINVDDPSQSTWLILQKKILQLCIKVSRKINDFEYVAKFSSILITKYTHLLNQSEQDALFKEYIQPSITNESITSYWDPFILREVVINRILDSDPTSNEIPLESDVSSLESLENRQKTQDINPQEVFNPFKRVQPTSFVSNNSTKVPILVFLVGDKAEFTCRVQNPFKFDFTINDIQLDEEISEFCEIDRKAVSYSGPYNVKAESIRSITLPLIIKKPTYKKIYEISCLKISILKLPLQKFDIINDSRRSNPVEEEAEYSKCIYGKLKIKILPEQPQLELLSTSKMTRNSWMMLDGTKTDFHITVRNKSLSCAINHIKIIPMNNIEQMLKPDYWKKMPPDDLYIMEKQLDWLSKSCVRIIKLPTVIKPNETITFDLELDNTAVPFNFTGFDLLIEYGMSATDESCIYLKKLSIPYEVTLRRTIEVPSMDIIPLNELFSSQVENVDWIEYVMSKIRAESNLHSRDFILLLLDFRNSWIDGIKLNVQFEDFTSNEYHVEASHTSRIIVPIKKIDYKKYNFENTPIPRIYPGRQFIQSGLNEEQTIEMRQKFWCREHIISKLKCNWKLTTDQSVTGSVDFNKFIEKFDHKMVYTIYPGRLFYGVQLLLDEPKVKVGEIINLKIITEPTSTCRRKQNSTVNFLDIVIFDSKTSKILPRSNRRILYNGSLTKPISTTKVSEINLEIIPIEKGRYEFSVCISKSNNQDGIIQFDSENVILSVI

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130
分子量 formula_weight	24953.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65
分子量 formula_weight	17890.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n,N

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	PALMITIC ACID
分子量 formula_weight	256.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	149906

Structure of the yeast TRAPPII-Rab11/Ypt32 complex in the closed/open state (composite structure)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Trafficking protein particle complex II-specific subunit 65

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TRAPP-associated protein TCA17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit 33

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit BET3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit BET5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit 23

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit 31

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex subunit 20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

GTP-binding protein YPT32/YPT11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体