7udt

cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering)

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 172.4 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 5–377 链 B； UniProt 5–377 链 C； UniProt 5–377	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	regulatory light chain × 1 Unconventional myosin-XV × 1 （Q9QZZ4） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7UDT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5YU8 Cofilin decorated actin filament 提交 2017-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6D8C Cryo-EM structure of FLNaABD E254K bound to phalloidin-stabilized F-actin 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 H 3–377（375 aa）链 J 3–377（375 aa）链 K 3–377（375 aa）链 L 3–377（375 aa）链 M 3–377（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
6DJM Cryo-EM structure of AMPPNP-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6DJN Cryo-EM structure of ADP-Pi-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6DJO Cryo-EM structure of ADP-actin filaments 提交 2018-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6M5G F-actin-Utrophin complex 提交 2020-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 3.60 Å
6UPV Alpha-E-catenin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6UPW Metavinculin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6X5Z Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State 提交 2020-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Thin filaments were reconstituted by first mixing F-actin and tropomyosin to final concentrations of 10 uM actin and 7 uM tropomyosin. Just before applying 1.5 uL actin-tropomyosin to a freshly glow discharged holey-carbon grid, the surfactant octyl B-D-glucopyranoside was added to the protein solution to a concentration of 12 nM. The grid sample was manually blotted for 1 second and a 1.5 uL drop of 7.5 uM myosin-S1 sub-fragment was then applied to the blotted grid sample. The sample was immediately blotted for 4 seconds and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 4.24 Å
7BT7 F-actin-ADP complex structure 提交 2020-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 3.80 Å
7BTE Lifeact-F-actin complex 提交 2020-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 4.20 Å
7BTI Phalloidin bound F-actin complex 提交 2020-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds	分辨率 3.60 Å
7K20 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-actin filaments 提交 2020-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7K21 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-Pi-actin filaments 提交 2020-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7KCH Myosin XI-F-actin complex 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0,50 mM KCl,1mM MgCl2, 1mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.33 Å
7R8V Cryo-EM structure of the ADP state actin filament 提交 2021-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）链 D 7–377（371 aa）链 E 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
7R91 cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-06-28	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7R94 T-Plastin-F-actin complex 提交 2021-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7RB8 cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7RB9 Cryo-EM structure of the rigor state Jordan myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
7SX8 T-Plastin-F-actin complex, parallel bundled state 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7SX9 T-Plastin-F-actin complex, anti-parallel bundled state 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7SXA T-Plastin-F-actin complex, pre-bundling intermediate state 提交 2021-11-22	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.87 Å
7UDU cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 5–377（373 aa）链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
7W4Z Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (AMPPNP-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Na2HPO4, 19% PEG3350	分辨率 1.15 Å R-free 0.158
7W50 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-Pi-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Na2HPO4, 18% PEG3350	分辨率 1.15 Å R-free 0.162
7W51 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-form) 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 8.0, 16% PEG3350	分辨率 1.20 Å R-free 0.176
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7W52 Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
8C4C F-actin decorated by SipA497-669 提交 2023-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.70 Å
8C4E F-actin decorated by SipA426-685 提交 2023-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.60 Å
8D13 Helical ADP-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.43 Å
8D14 Helical ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
8D15 Bent ADP-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.61 Å
8D16 Bent ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 7–377（371 aa）链 B 7–377（371 aa）链 C 7–377（371 aa）链 D 7–377（371 aa）链 E 7–377（371 aa）链 F 7–377（371 aa）链 G 7–377（371 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
8D17 Straight ADP-F-actin 1 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
8D18 Straight ADP-F-actin 2 提交 2022-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8E9B Cryo-EM structure of S. pombe Arp2/3 complex in the branch junction 提交 2022-08-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 H 3–377（375 aa）链 I 3–377（375 aa）链 M 3–377（375 aa）链 N 3–377（375 aa）链 O 3–377（375 aa）链 P 3–377（375 aa）链 Q 3–377（375 aa）链 R 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8R3H Phalloidin bound F-actin 提交 2023-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.13 Å
8SYF Homology model of Acto-HMM complex in ADP-state. Chicken smooth muscle HMM and chicken pectoralis actin 提交 2023-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 19.00 Å
8VFM Salmonella effector protein SipA decorated actin filament 提交 2023-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–377（377 aa）链 L 1–377（377 aa）链 M 1–377（377 aa）链 N 1–377（377 aa）链 R 1–377（377 aa）链 S 1–377（377 aa）链 U 1–377（377 aa）链 W 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8VOA Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_right) 提交 2024-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 5–377（373 aa）链 C 5–377（373 aa）链 D 5–377（373 aa）链 E 5–377（373 aa）链 F 5–377（373 aa）链 G 5–377（373 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9DVA F-actin binding interface of alpha-E-catenin ABD (cadherin-catenin complex) and afadin 提交 2024-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 3–377（375 aa）链 B 3–377（375 aa）链 C 3–377（375 aa）链 D 3–377（375 aa）链 E 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 f 1–377（377 aa）链 g 1–377（377 aa）链 p 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2	分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 P 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2	分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 g 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2	分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2	分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JW0 Structure of the N-terminal 3 domains (V1-V3) villin bound to actin 提交 2024-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–377（377 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium nitrate, 1 mM CaCl2	分辨率 2.69 Å R-free 0.259
9L2N Crystal structure of Cytochalasin D bound to a filamentous conformation actin 提交 2024-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–377（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CY9 (3S,3aR,4S,6S,6aR,7E,10S,12R,13E,15R,15aR)-3-benzyl-6,12-dihydroxy-4,10,12-trimethyl-5-methylidene-1,11-dioxo-2,3,3a,4,5,6,6a,9,10,11,12,15-dodecahydro-1H-cycloundeca[d]isoindol-15-yl acetate × 1 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG3350 and 20 mM Na2HPO4	分辨率 1.70 Å R-free 0.204
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）链 K 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）链 K 1–377（377 aa）链 L 1–377（377 aa）链 i 1–377（377 aa）链 j 1–377（377 aa）链 k 1–377（377 aa）链 l 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9QGK F-actin decorated by ITPKA 提交 2025-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.97 Å
9SGK F-actin in complex with USP54 M1 actin binding motif 提交 2025-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 F 1–377（377 aa）链 G 1–377（377 aa）链 H 1–377（377 aa）链 I 1–377（377 aa）链 J 1–377（377 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

共 57 个其他 PDB 条目、66 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–373； UniProt 5–377 作者链 B； PDB构建体 1–373； UniProt 5–377 作者链 C； PDB构建体 1–373； UniProt 5–377

Unconventional myosin-XV

Mus musculus

UniProt Q9QZZ4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1205–1923	片段：motor domain	regulatory light chain × 1 Actin, alpha skeletal muscle × 3 （P68139） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7UDT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6Y9N Crystal structure of Whirlin PDZ3_C-ter in complex with Myosin 15a C-terminal PDZ binding motif peptide 提交 2020-03-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3499–3511（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1M HEPES pH 7.5,10% v/v isopropanol,20% w/v PEG 4000	分辨率 1.93 Å R-free 0.216
7R91 cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-06-28	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 18–702（685 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7RB8 cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 18–702（685 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7RB9 Cryo-EM structure of the rigor state Jordan myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 18–702（685 aa）	突变：D1647G	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
7UDU cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1205–1923（719 aa）片段：motor domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYO15_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–719； UniProt 1205–1923

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7udt
沉积日期 deposition_date	2022-03-20
结构标题 title	cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering)
关键词 keywords	myosin motor proteins, actin cytoskeleton, stereocilia, deafness, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	49.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	49.33 Å
零角强度 I(0) i0	729709000.00
分子量 molecular_weight	223350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	279330 Å³
包络体积 envelope_volume	410700 Å³
水化壳体积 shell_volume	70413 Å³
包络直径 envelope_diameter	189.0 Å
壳层 Rg shell_rg	51.65 Å
包络 Rg envelope_rg	49.54 Å
形状 Rg shape_rg	49.33 Å
总 Rg total_rg	49.42 Å
总原子数 total_atoms	15683
残基数 n_residues	1963
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	172.4 Å
Rg (实空间) rg_real	49.57 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.85 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.2970e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.4320e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	49.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	729400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6487
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	53.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.457
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.204
角度范围 angular_range	— – 0.1600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	62110000.0000
实空间数据点数 n_real_points	33
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.833; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.087; Positv: 1.000; Valcen: 0.941; Smooth: 0.728

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	regulatory light chain
分子量 formula_weight	16936.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G
原子数 atom_count	15806

VFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGFIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGA

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	41631.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C

DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Unconventional myosin-XV
分子量 formula_weight	82393.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

EDGVEDMTQLEDLQETTVLANLKTRFERNLIYTYIGSILVSVNPYRMFAIYGPEQVQQYSGRALGENPPHLFAIANLAFAKMLDAKQNQCVIISGESGSGKTEATKLILRCLAAMNQRRDVMQQIKILEATPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFVEIFLEGGVICGAITSQYLLEKSRIVFQAKNERNYHIFYELLAGLPAQLRQAFSLQEAETYYYLNQGGNCEIAGKSDADDFRRLLAAMEVLGFTSEDQDSIFRILASILHLGNVYFEKHETDAQEVASVVSAREIQAVAELLQVSPEGLQKAITFKVTETIREKIFTPLTVESAVDARDAIAKVLYALLFGWLITRVNALVSPKQDTLSIAILDIYGFEDLSFNSFEQLCINYANENLQYLFNKIVFQEEQEEYIREQMDWREIAFADNQPCINLISLKPYGILRILDDQCCFPQATDHTFLQKCHYHHGANPLYSKPKMPLPEFTIKHYAGKVTYQVHKFLDKNHDQVRQDVLDLFVHSRTRVVAHLFSSHAAQTAPPRLGKSSSITRLYKAHTVAAKFQQSLLDLVEKMERCNPLFVRCLKPNHKKEPGLFEPDVMMAQLRYSGVLETVRIRKEGFPVRLPFQVFIDRYRCLVALKLNVPADGDMCVSLLSRLCTVTPDMYRVGISKLFLKEHLHQLLESMRERVQNRAALTLQRYLRGFFIQRHFRSLRRKIILLQSRARGF

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7udtG01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	7udtG02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.17 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	189104

fit	/app/data/saxs_computation/ud/7udt/7udt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ud/7udt/7udt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ud/7udt/7udt.dat

cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Unconventional myosin-XV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)