SAXSdb — 7uvc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

Saccharomyces cerevisiae S288C

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	E3 ubiquitin-protein ligase BRE1 × 2 （Q07457）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBC2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q07457

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2 × 1 （P06104）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BRE1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–212； UniProt 1–212 作者链 V； PDB构建体 1–212； UniProt 1–212

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7uvc
沉积日期 deposition_date	2022-04-29
结构标题 title	Rad6(P43L)-Bre1 Complex
关键词 keywords	Rad6, E2 conjugating enzyme, Bre1, E3-Ligase, LIGASE, TRANSFERASE-LIGASE complex; TRANSFERASE/LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7uvc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7uvc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7uvc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.24 Å
Rg（电子密度）	34.55 Å
总 Rg	34.81 Å
原子数	3862
残基数	470
排除体积	68767 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7uvc__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2
分子量 formula_weight	17207.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.23
突变 mutation	P43L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3871

MSTPARRRLMRDFKRMKEDAPPGVSASPLPDNVMVWNAMIIGLADTPYEDGTFRLLLEFDEEYPNKPPHVKFLSEMFHPNVYANGEICLDILQNRWTPTYDVASILTSIQSLFNDPNPASPANVEAATLFKDHKSQYVKRVKETVEKSWE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase BRE1
分子量 formula_weight	24834.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.27
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,U

MTAEPATKKIKLELSDPSEPLTQSDVIAFQKEALFRCINRRRVDFEALRKQYELSRRECIDVSRKLANIMALIVTLARFIETFCTDANEKQLCREIAQGDETLIVQRSDSFMKLLTKYGKPNTTDSNTNSNASDHIQELTTELKNLRKSKEELFYENSQLTEEISALKEYYTNIIRKYDRDESFTIKRVFKEDKTDAVKELREDEKESNENN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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晶胞边长 a length_a	240.433 Å
晶胞边长 b length_b	50.088 Å
晶胞边长 c length_c	57.321 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.050 Å
最低分辨率 resolution_low	37.720 Å
R 因子 r_factor	0.2367
R_work r_work	0.2344
R_free r_free	0.2789

Rad6(P43L)-Bre1 Complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7uvc__assembly_1__model_1

7uvc__assembly_1__model_1 | I(q)

7uvc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Rad6(P43L)-Bre1 Complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

E3 ubiquitin-protein ligase BRE1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7uvc__assembly_1__model_1

7uvc__assembly_1__model_1 | I(q)

7uvc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)