SAXSdb — 7v3j

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope protein E

Dengue virus type 2 (strain Thailand/NGS-C/1944)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	Fab_C10_heavy_chain × 2 Fab_C10_light_chain × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_DEN2N
Isoform	—
PDB实体	3, 4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 B； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 C； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 O； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 P； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 Q； PDB构建体 1–495； UniProt 281–775 作者链 D； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 E； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 F； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 R； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 S； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277 作者链 T； PDB构建体 1–72； UniProt 206–277

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7v3j
沉积日期 deposition_date	2021-08-10
结构标题 title	DENV2:F(ab')2-local
关键词 keywords	complex, antibody, VIRUS, IMMUNE SYSTEM-VIRUS complex; IMMUNE SYSTEM/VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7v3j__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7v3j__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7v3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.49 Å
Rg（电子密度）	59.15 Å
总 Rg	59.12 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	577500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7v3j__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fab_C10_heavy_chain
分子量 formula_weight	25857.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I
原子数 atom_count	4304

EVQLVESGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYAMHWVRQAPGQRLEWMGWINAGNGNTKYSQKFQDRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAIYYCARDKVDDYGDYWFPTLWYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Fab_C10_light_chain
分子量 formula_weight	22497.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

SALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGFNYVSWFQQHPGKAPKLMLYDVTSRPSGVSSRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSHTSRGTWVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Envelope protein E
分子量 formula_weight	54363.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A,C,P,O,Q

MRCIGISNRDFVEGVSGGSWVDIVLEHGSCVTTMAKNKPTLDFELIETEAKQPATLRKYCIEAKLTNTTTDSRCPTQGEPSLNEEQDKRFVCKHSMVDRGWGNGCGLFGKGGIVTCAMFTCKKNMKGKVVQPENLEYTIVITPHSGEEHAVGNDTGKHGKEIKITPQSSITEAELTGYGTVTMECSPRTGLDFNEMVLLQMENKAWLVHRQWFLDLPLPWLPGADTQGSNWIQKETLVTFKNPHAKKQDVVVLGSQEGAMHTALTGATEIQMSSGNLLFTGHLKCRLRMDKLQLKGMSYSMCTGKFKVVKEIAETQHGTIVIRVQYEGDGSPCKIPFEIMDLEKRHVLGRLITVNPIVTEKDSPVNIEAEPPFGDSYIIIGVEPGQLKLNWFKKGSSIGQMIETTMRGAKRMAILGDTAWDFGSLGGVFTSIGKALHQVFGAIYGAAFSGVSWIMKILIGVIITWIGMNSRSTSLSVSLVLVGVVTLYLGVMVQA

来源 Source

来源生物 organism	Dengue virus type 2 (strain Thailand/NGS-C/1944)
通用名 common_name	DENV-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11065
宿主生物 host_organism	Aedes albopictus C6/36 cell densovirus

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Small envelope protein M
分子量 formula_weight	8026.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,D,F,S,R,T

SVALVPHVGMGLETRTETWMSSEGAWKHAQRIETWILRHPGFTIMAAILAYTIGTTHFQRALIFILLTAVAP

来源 Source

来源生物 organism	Dengue virus type 2 (strain Thailand/NGS-C/1944)
通用名 common_name	DENV-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11065
宿主生物 host_organism	Aedes albopictus C6/36 cell densovirus

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	93432

DENV2:F(ab')2-local

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope protein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7v3j__assembly_1__model_1

7v3j__assembly_1__model_1 | I(q)

7v3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

DENV2:F(ab')2-local

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope protein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7v3j__assembly_1__model_1

7v3j__assembly_1__model_1 | I(q)

7v3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)