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7w52

Crystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 160.9 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

UniProt P68139

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–377 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Actin-binding protein fragmin P × 1 （Q94707） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–377 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Actin-binding protein fragmin P × 1 （Q94707） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–377 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Actin-binding protein fragmin P × 1 （Q94707） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–377 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Actin-binding protein fragmin P × 1 （Q94707） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7W52 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5YU8 Cofilin decorated actin filament 提交 2017-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
链 E 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6D8C Cryo-EM structure of FLNaABD E254K bound to phalloidin-stabilized F-actin 提交 2018-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 3–377（375 aa）
链 J 3–377（375 aa）
链 K 3–377（375 aa）
链 L 3–377（375 aa）
链 M 3–377（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6DJM Cryo-EM structure of AMPPNP-actin filaments 提交 2018-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6DJN Cryo-EM structure of ADP-Pi-actin filaments 提交 2018-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6DJO Cryo-EM structure of ADP-actin filaments 提交 2018-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6M5G F-actin-Utrophin complex 提交 2020-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds
分辨率 3.60 Å
6UPV Alpha-E-catenin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
链 E 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6UPW Metavinculin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
链 E 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6X5Z Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State 提交 2020-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Thin filaments were reconstituted by first mixing F-actin and tropomyosin to final concentrations of 10 uM actin and 7 uM tropomyosin. Just before applying 1.5 uL actin-tropomyosin to a freshly glow discharged holey-carbon grid, the surfactant octyl B-D-glucopyranoside was added to the protein solution to a concentration of 12 nM. The grid sample was manually blotted for 1 second and a 1.5 uL drop of 7.5 uM myosin-S1 sub-fragment was then applied to the blotted grid sample. The sample was immediately blotted for 4 seconds and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 4.24 Å
7BT7 F-actin-ADP complex structure 提交 2020-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
分辨率 3.80 Å
7BTE Lifeact-F-actin complex 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 I 1–377（377 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
分辨率 4.20 Å
7BTI Phalloidin bound F-actin complex 提交 2020-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM KCl,1mM MgCl2,0.2mM EGTA, 10mM Imidazole buffer pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3.5 seconds
分辨率 3.60 Å
7K20 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-actin filaments 提交 2020-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7K21 Cryo-EM structure of pyrene-labeled ADP-Pi-actin filaments 提交 2020-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 1T4 N-(pyren-1-yl)acetamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7KCH Myosin XI-F-actin complex 提交 2020-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0,50 mM KCl,1mM MgCl2, 1mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.33 Å
7R8V Cryo-EM structure of the ADP state actin filament 提交 2021-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 7–377（371 aa）
链 B 7–377（371 aa）
链 C 7–377（371 aa）
链 D 7–377（371 aa）
链 E 7–377（371 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
7R91 cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 7–377（371 aa）
链 B 7–377（371 aa）
链 C 7–377（371 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7R94 T-Plastin-F-actin complex 提交 2021-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7RB8 cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 5–377（373 aa）
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
7RB9 Cryo-EM structure of the rigor state Jordan myosin-15-F-actin complex 提交 2021-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 5–377（373 aa）
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
7SX8 T-Plastin-F-actin complex, parallel bundled state 提交 2021-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
7SX9 T-Plastin-F-actin complex, anti-parallel bundled state 提交 2021-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7SXA T-Plastin-F-actin complex, pre-bundling intermediate state 提交 2021-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.87 Å
7UDT cryo-EM structure of the rigor state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 5–377（373 aa）
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
7UDU cryo-EM structure of the ADP state wild type myosin-15-F-actin complex (symmetry expansion and re-centering) 提交 2022-03-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 5–377（373 aa）
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM DTT, 0.01% NaN3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
7W4Z Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (AMPPNP-form) 提交 2021-11-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Na2HPO4, 19% PEG3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.158
7W50 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-Pi-form) 提交 2021-11-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Na2HPO4, 18% PEG3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.162
7W51 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-form) 提交 2021-11-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 8.0, 16% PEG3350
分辨率 1.20 Å R-free 0.176
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
8C4C F-actin decorated by SipA497-669 提交 2023-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.70 Å
8C4E F-actin decorated by SipA426-685 提交 2023-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；5 mM Tris buffer, pH 7.5, 0.1 mM DTT, 0.2 mM ATP, 0.2 mM EGTA and 0.05 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.60 Å
8D13 Helical ADP-F-actin 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.43 Å
8D14 Helical ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8D15 Bent ADP-F-actin 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.61 Å
8D16 Bent ADP-Pi-F-actin 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 7–377（371 aa）
链 B 7–377（371 aa）
链 C 7–377（371 aa）
链 D 7–377（371 aa）
链 E 7–377（371 aa）
链 F 7–377（371 aa）
链 G 7–377（371 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
8D17 Straight ADP-F-actin 1 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
8D18 Straight ADP-F-actin 2 提交 2022-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–377（377 aa）
链 B 1–377（377 aa）
链 C 1–377（377 aa）
链 D 1–377（377 aa）
链 E 1–377（377 aa）
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8E9B Cryo-EM structure of S. pombe Arp2/3 complex in the branch junction 提交 2022-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 3–377（375 aa）
链 I 3–377（375 aa）
链 M 3–377（375 aa）
链 N 3–377（375 aa）
链 O 3–377（375 aa）
链 P 3–377（375 aa）
链 Q 3–377（375 aa）
链 R 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8R3H Phalloidin bound F-actin 提交 2023-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
链 I 1–377（377 aa）
链 J 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.13 Å
8SYF Homology model of Acto-HMM complex in ADP-state. Chicken smooth muscle HMM and chicken pectoralis actin 提交 2023-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 19.00 Å
8VFM Salmonella effector protein SipA decorated actin filament 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–377（377 aa）
链 L 1–377（377 aa）
链 M 1–377（377 aa）
链 N 1–377（377 aa）
链 R 1–377（377 aa）
链 S 1–377（377 aa）
链 U 1–377（377 aa）
链 W 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
链 D 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 5–377（373 aa）
链 F 5–377（373 aa）
链 G 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
链 D 5–377（373 aa）
链 E 5–377（373 aa）
链 F 5–377（373 aa）
链 G 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
链 D 5–377（373 aa）
链 E 5–377（373 aa）
链 F 5–377（373 aa）
链 G 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
链 D 5–377（373 aa）
链 E 5–377（373 aa）
链 F 5–377（373 aa）
链 G 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOA Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_right) 提交 2024-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 5–377（373 aa）
链 C 5–377（373 aa）
链 D 5–377（373 aa）
链 E 5–377（373 aa）
链 F 5–377（373 aa）
链 G 5–377（373 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9DVA F-actin binding interface of alpha-E-catenin ABD (cadherin-catenin complex) and afadin 提交 2024-10-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 3–377（375 aa）
链 B 3–377（375 aa）
链 C 3–377（375 aa）
链 D 3–377（375 aa）
链 E 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 f 1–377（377 aa）
链 g 1–377（377 aa）
链 p 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2
分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JUS Structure of villin bound to an actin trimer 提交 2024-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 P 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 8 SCN THIOCYANATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5 10% PEG 3350 0.2 M KSCN 5 mM CaCl2/MgCl2
分辨率 2.70 Å R-free 0.226
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 g 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2
分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JVT Structure of the C-terminal 4 domains (V4-V6-HP) villin bound to an actin 提交 2024-10-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris, pH 8.0 50% PEG 400 0.2 M Li2SO4 1 mM CaCl2
分辨率 3.29 Å R-free 0.268
9JW0 Structure of the N-terminal 3 domains (V1-V3) villin bound to actin 提交 2024-10-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–377（377 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium nitrate, 1 mM CaCl2
分辨率 2.69 Å R-free 0.259
9L2N Crystal structure of Cytochalasin D bound to a filamentous conformation actin 提交 2024-12-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–377（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CY9 (3S,3aR,4S,6S,6aR,7E,10S,12R,13E,15R,15aR)-3-benzyl-6,12-dihydroxy-4,10,12-trimethyl-5-methylidene-1,11-dioxo-2,3,3a,4,5,6,6a,9,10,11,12,15-dodecahydro-1H-cycloundeca[d]isoindol-15-yl acetate × 1 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG3350 and 20 mM Na2HPO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.204
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 I 1–377（377 aa）
链 J 1–377（377 aa）
链 K 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 I 1–377（377 aa）
链 J 1–377（377 aa）
链 K 1–377（377 aa）
链 L 1–377（377 aa）
链 i 1–377（377 aa）
链 j 1–377（377 aa）
链 k 1–377（377 aa）
链 l 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9QGK F-actin decorated by ITPKA 提交 2025-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
链 I 1–377（377 aa）
链 J 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.97 Å
9SGK F-actin in complex with USP54 M1 actin binding motif 提交 2025-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–377（377 aa）
链 G 1–377（377 aa）
链 H 1–377（377 aa）
链 I 1–377（377 aa）
链 J 1–377（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å

共 57 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTS_CHICK
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Actin-binding protein fragmin P

Physarum polycephalum

UniProt Q94707

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 15–160 未记录 Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68139） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 15–160 未记录 Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68139） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 15–160 未记录 Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68139） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 15–160 未记录 Actin, alpha skeletal muscle × 1 （P68139） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 0.1 M calcium acetate, and 7% PEG3350 分辨率 2.00 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7W52 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KWZ Crystal structure of fragmin F3 domain with calcium ion 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 276–371（96 aa）
链 B 276–371（96 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100mM MES-NaOH (pH 6.0), 20% PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.216
6LJC Crystal structure of fragmin F2-F3 domains (calcium and magnesium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 162–371（210 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride, magnesium chloride
分辨率 1.85 Å R-free 0.203
6LJD Crystal structure of fragmin F2-F3 domains (calcium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 162–371（210 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride
分辨率 2.15 Å R-free 0.219
7W4Z Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (AMPPNP-form) 提交 2021-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Na2HPO4, 19% PEG3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.158
7W50 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-Pi-form) 提交 2021-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Na2HPO4, 18% PEG3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.162
7W51 Crystal structure of fragmin domain-1 in complex with actin (ADP-form) 提交 2021-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 8.0, 16% PEG3350
分辨率 1.20 Å R-free 0.176
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
7YNE Crystal structure of fragmin domain-1 (1-160) in complex with G-form actin 提交 2022-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.1 M calcium acetate, and 12% PEG4000
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
8GSU Crystal structure of human cardiac alpha actin (WT_ADP-Pi) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.50 Å R-free 0.191
8GSW Crystal structure of human cardiac alpha actin A108G mutant (AMPPNP state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.40 Å R-free 0.196
8GT1 Crystal structure of human cardiac alpha actin A108G mutant (ADP-Pi state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.35 Å R-free 0.202
8GT2 Crystal structure of human cardiac alpha actin P109A mutant (AMPPNP state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
8GT3 Crystal structure of human cardiac alpha actin P109A mutant (ADP-Pi state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.50 Å R-free 0.196
8GT4 Crystal structure of human cardiac alpha actin Q137A mutant (AMPPNP state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.55 Å R-free 0.209
8GT5 Crystal structure of human cardiac alpha actin Q137A mutant (ADP-Pi state) in complex with fragmin F1 domain 提交 2022-09-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Disodium Hydrogenphosphate, HEPES
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
9L2N Crystal structure of Cytochalasin D bound to a filamentous conformation actin 提交 2024-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–160（160 aa）
突变：N13A ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CY9 (3S,3aR,4S,6S,6aR,7E,10S,12R,13E,15R,15aR)-3-benzyl-6,12-dihydroxy-4,10,12-trimethyl-5-methylidene-1,11-dioxo-2,3,3a,4,5,6,6a,9,10,11,12,15-dodecahydro-1H-cycloundeca[d]isoindol-15-yl acetate × 1 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG3350 and 20 mM Na2HPO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.204

共 15 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q94707_PHYPO
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 3–148； UniProt 15–160 作者链 D； PDB构建体 3–148； UniProt 15–160 作者链 F； PDB构建体 3–148； UniProt 15–160 作者链 H； PDB构建体 3–148； UniProt 15–160

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7w52

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7w52
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7w52
沉积日期 deposition_date2021-11-29
结构标题 titleCrystal structure of fragmin domain-1 (15-160) in complex with actin
关键词 keywordsactin dynamics, fragmin, gelsolin, ATP hydrolysis, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier48.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron48.66 Å
零角强度 I(0) i0721881000.00
分子量 molecular_weight223640.0 kDa
排除体积 excluded_volume279850 ų
包络体积 envelope_volume403950 ų
水化壳体积 shell_volume70291 ų
包络直径 envelope_diameter159.2 Å
壳层 Rg shell_rg51.90 Å
包络 Rg envelope_rg47.20 Å
形状 Rg shape_rg48.66 Å
总 Rg total_rg48.78 Å
总原子数 total_atoms15714
残基数 n_residues1964
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax160.9 Å
Rg (实空间) rg_real48.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.70 Å
I(0) (实空间) i0_real7.2190e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1800e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal48.72 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal721900000.0000
解质量估计 total_estimate0.6677
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary55.3 Å
偏度 Skewness skewness0.223
峰度 Kurtosis kurtosis-0.638
角度范围 angular_range— – 0.1600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha31910000.0000
实空间数据点数 n_real_points33
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.937; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.013; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.839
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7w52B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id7w52D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id7w52F01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id7w52H01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)