7w6t

CryoEM structure of human KChIP1-Kv4.3-DPP6 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kv channel-interacting protein 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 × 4 （Q9UK17） Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 × 2 （E9PWX1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCIP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–228； UniProt 1–227 作者链 C； PDB构建体 2–228； UniProt 1–227 作者链 E； PDB构建体 2–228； UniProt 1–227 作者链 G； PDB构建体 2–228； UniProt 1–227

Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

Homo sapiens

UniProt Q9UK17

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Kv channel-interacting protein 1 × 4 （Q9NZI2） Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 × 2 （E9PWX1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCND3_HUMAN
Isoform	Q9UK17-2
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–636； UniProt 1–636 作者链 D； PDB构建体 1–636； UniProt 1–636 作者链 F； PDB构建体 1–636； UniProt 1–636 作者链 H； PDB构建体 1–636； UniProt 1–636

Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6

Mus musculus

UniProt E9PWX1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Kv channel-interacting protein 1 × 4 （Q9NZI2） Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 × 4 （Q9UK17）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9PWX1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–859； UniProt 1–859 作者链 J； PDB构建体 1–859； UniProt 1–859

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7w6t
沉积日期 deposition_date	2021-12-02
结构标题 title	CryoEM structure of human KChIP1-Kv4.3-DPP6 complex
关键词 keywords	Kv channel-interacting protein 1 Potassium voltage-gated channel Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7w6t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7w6t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7w6t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	73.63 Å
Rg（电子密度）	73.32 Å
总 Rg	73.03 Å
原子数	31768
残基数	3934
排除体积	568110 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7w6t__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Kv channel-interacting protein 1
分子量 formula_weight	26935.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	31768

SMGAVMGTFSSLQTKQRRPSKDIAWWYYQYQRDKIEDELEMTMVCHRPEGLEQLEAQTNFTKRELQVLYRGFKNECPSGVVNEDTFKQIYAQFFPHGDASTYAHYLFNAFDTTQTGSVKFEDFVTALSILLRGTVHEKLRWTFNLYDINKDGYINKEEMMDIVKAIYDMMGKYTYPVLKEDTPRQHVDVFFQKMDKNKDGIVTLDEFLESCQEDDNIMRSLQLFQNVM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3
分子量 formula_weight	71472.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLERYPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKELPCGERYSVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6
分子量 formula_weight	98874.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J

MASLYQRFTGKINTSRSFPAPPEASRLLGGQGPEEDAGPKPLGPQAQAVAPRERGGAGGRPRFQYQARSDCDEEDELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAEDTSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISNKEFIYRERKGSVILRNVETNNSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDKEYVLFSYNVEPVYQHSHTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKSHIAHWWSPDGTRLAYATINDSRVPLMELPTYTGSVYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFVRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILSYDEKRNKIYFLSTEDLPRRRHLYSANTVDDFNRQCLSCDLVENCTYVSASFSHNMDFFLLKCEGPGVPTVTVHNTTDKRRMFDLEANEEVQKAINDRQMPKIEYRKIEVEDYSLPMQILKPATFTDTAHYPLLLVVDGTPGSQSVTERFEVTWETVLVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLQEVRRRLGFLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDKTRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKLAHRVSALEDQQFLIIHATADEKIHFQHTAELITQLIKGKANYSLQIYPDESHYFHSVALKQHLSRSIIGFFVECFRVQDKLPTATAKEEEEEDLEGGSSDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	7w6tB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	7w6tB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	7w6tB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	7w6tD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	7w6tD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	7w6tD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	7w6tF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	7w6tF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	7w6tF03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	7w6tH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	7w6tH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	7w6tH03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.85 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	263176

CryoEM structure of human KChIP1-Kv4.3-DPP6 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kv channel-interacting protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7w6t__assembly_1__model_1

7w6t__assembly_1__model_1 | I(q)

7w6t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

CryoEM structure of human KChIP1-Kv4.3-DPP6 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kv channel-interacting protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 2 of Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7w6t__assembly_1__model_1

7w6t__assembly_1__model_1 | I(q)

7w6t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)