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7wnh

Crystal structure of Nurr1 binding to NBRE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2

Homo sapiens

UniProt P43354

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*CP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*CP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 water × 1 与全部聚合物一致
3 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*CP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 water × 1 与全部聚合物一致
4 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*CP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*CP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
5y41 5y41 5yd6 5yd6 5yd6 5yd6 6dda 6dda 6dda

共 9 个 assembly

同源二聚体
5y41 8cyo

共 2 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1ovl

共 1 个 assembly

异源或核酸复合物
7wnh 7wnh 7wnh 7wnh

共 4 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NR4A2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 10–350； UniProt 258–598 作者链 B； PDB构建体 10–350； UniProt 258–598 作者链 C； PDB构建体 10–350； UniProt 258–598 作者链 D； PDB构建体 10–350； UniProt 258–598

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7wnh
沉积日期 deposition_date2022-01-18
结构标题 titleCrystal structure of Nurr1 binding to NBRE
关键词 keywordsNurr1, NBRE, DBD, LBD, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7wnh__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7wnh__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7wnh__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）29.54 Å
Rg（电子密度）28.41 Å
总 Rg28.92 Å
原子数3137
残基数345
排除体积54017 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7wnh__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7wnh__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 7wnh__assembly_3__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 7wnh__assembly_4__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7wnhA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id7wnhB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id7wnhC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id7wnhD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
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7. 引用文献 (1)