Myeloperoxidase light chain
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 其他聚合物 5 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 166–271 链 B； UniProt 279–744 链 C； UniProt 166–271 链 D； UniProt 279–744 | 片段：UNP RESIDUES 167-271 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Myeloperoxidase inhibitor SPIN × 2 （A0A8E8QUP3） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane | 分辨率 2.28 Å R-free 0.229 |
| 2 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 其他聚合物 5 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 G； UniProt 166–271 链 H； UniProt 279–744 链 I； UniProt 166–271 链 J； UniProt 279–744 | 片段：UNP RESIDUES 167-271 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Myeloperoxidase inhibitor SPIN × 2 （A0A8E8QUP3） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CL CHLORIDE ION × 2 HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane | 分辨率 2.28 Å R-free 0.229 |
| 3 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 其他聚合物 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 M； UniProt 166–271 链 N； UniProt 279–744 链 O； UniProt 166–271 链 P； UniProt 279–744 | 片段：UNP RESIDUES 167-271 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Myeloperoxidase inhibitor SPIN × 2 （A0A8E8QUP3） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 CL CHLORIDE ION × 2 HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 OXL OXALATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane | 分辨率 2.28 Å R-free 0.229 |
| 4 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 其他聚合物 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 S； UniProt 166–271 链 T； UniProt 279–744 链 U； UniProt 166–271 链 V； UniProt 279–744 | 片段：UNP RESIDUES 167-271 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Myeloperoxidase inhibitor SPIN × 2 （A0A8E8QUP3） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CL CHLORIDE ION × 2 HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane | 分辨率 2.28 Å R-free 0.229 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7Z53 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CXP CRYOGENIC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C 提交 1999-08-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE, CALCIUM CHLORIDE, pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 1CXP CRYOGENIC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C 提交 1999-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE, CALCIUM CHLORIDE, pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 1CXP CRYOGENIC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C 提交 1999-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE, CALCIUM CHLORIDE, pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 1D2V CRYSTAL STRUCTURE OF BROMIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-09-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 8 SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ACT ACETATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium bromide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.296 |
| 1D2V CRYSTAL STRUCTURE OF BROMIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium bromide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.296 |
| 1D2V CRYSTAL STRUCTURE OF BROMIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium bromide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.296 |
| 1D5L CRYSTAL STRUCTURE OF CYANIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-10-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 CYN CYANIDE ION × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium chloride,
sodium cyanide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.215 |
| 1D5L CRYSTAL STRUCTURE OF CYANIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CYN CYANIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium chloride,
sodium cyanide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.215 |
| 1D5L CRYSTAL STRUCTURE OF CYANIDE-BOUND HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C AT PH 5.5 提交 1999-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CYN CYANIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium chloride,
sodium cyanide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.215 |
| 1D7W CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C COMPLEXED WITH CYANIDE AND BROMIDE AT PH 4.0 提交 1999-10-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 CYN CYANIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 12 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium cyanide, sodium bromide, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 1D7W CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C COMPLEXED WITH CYANIDE AND BROMIDE AT PH 4.0 提交 1999-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 D
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 CYN CYANIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium cyanide, sodium bromide, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 1D7W CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C COMPLEXED WITH CYANIDE AND BROMIDE AT PH 4.0 提交 1999-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：LIGHT CHAIN
链 C
279–744（466 aa）
片段：HEAVY CHAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 CYN CYANIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；polyethylene glycol 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, calcium acetate,
sodium cyanide, sodium bromide, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 1DNU STRUCTURAL ANALYSES OF HUMAN MYELOPEROXIDASE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 B
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 C
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
链 D
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ACY ACETIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Crystal is grown from sodium acetate, ammonium sulfate calcium chloride, and Peg MW 8000. It was subsequently
equilibrated with a substitute mother liquor which contained sodium thiocyanate., pH 5.5, Vapor Diffusion, Hanging Drop
with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 1DNU STRUCTURAL ANALYSES OF HUMAN MYELOPEROXIDASE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 D
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACY ACETIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Crystal is grown from sodium acetate, ammonium sulfate calcium chloride, and Peg MW 8000. It was subsequently
equilibrated with a substitute mother liquor which contained sodium thiocyanate., pH 5.5, Vapor Diffusion, Hanging Drop
with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 1DNU STRUCTURAL ANALYSES OF HUMAN MYELOPEROXIDASE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 C
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACY ACETIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Crystal is grown from sodium acetate, ammonium sulfate calcium chloride, and Peg MW 8000. It was subsequently
equilibrated with a substitute mother liquor which contained sodium thiocyanate., pH 5.5, Vapor Diffusion, Hanging Drop
with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 1DNW HUMAN MYELOPEROXIDASE-CYANIDE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 B
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 C
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
链 D
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 CYN CYANIDE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ACY ACETIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Co-crystal grown from sodium cyanide, sodium acetate, ammonium, sulfate, calcium chloride, and PEG MW 8000. It was
subsequently equilibrated with a substitute mother liquor containing sodium thiocyanate, pH 5.5, Vapor Diffusion,
Hanging Drop with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 1DNW HUMAN MYELOPEROXIDASE-CYANIDE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 C
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 CYN CYANIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACY ACETIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Co-crystal grown from sodium cyanide, sodium acetate, ammonium, sulfate, calcium chloride, and PEG MW 8000. It was
subsequently equilibrated with a substitute mother liquor containing sodium thiocyanate, pH 5.5, Vapor Diffusion,
Hanging Drop with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 1DNW HUMAN MYELOPEROXIDASE-CYANIDE-THIOCYANATE COMPLEX 提交 1999-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE LIGHT CHAIN CONTAINING RESIDUES 1 TO 104
链 D
279–744（466 aa）
片段：MYELOPEROXIDASE HEAVY CHAIN CONTAINING RESIDUES 113 TO 578
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CYN CYANIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACY ACETIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Vapor Diffusion, Hanging Drop with Macro Seeding；pH 5.5；295 K；Co-crystal grown from sodium cyanide, sodium acetate, ammonium, sulfate, calcium chloride, and PEG MW 8000. It was
subsequently equilibrated with a substitute mother liquor containing sodium thiocyanate, pH 5.5, Vapor Diffusion,
Hanging Drop with Macro Seeding, temperature 22K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 1MHL CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C CRYSTALLIZED IN SPACE GROUP P2(1) AT PH 5.5 AND 20 DEG C 提交 1995-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
165–272（108 aa）
链 B
165–272（108 aa）
链 C
279–744（466 aa）
链 D
279–744（466 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.25 Å |
| 1MHL CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C CRYSTALLIZED IN SPACE GROUP P2(1) AT PH 5.5 AND 20 DEG C 提交 1995-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
165–272（108 aa）
链 D
279–744（466 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.25 Å |
| 1MHL CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE ISOFORM C CRYSTALLIZED IN SPACE GROUP P2(1) AT PH 5.5 AND 20 DEG C 提交 1995-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
165–272（108 aa）
链 C
279–744（466 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.25 Å |
| 1MYP X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF CANINE MYELOPEROXIDASE AT 3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
165–272（108 aa）
链 B
165–272（108 aa）
链 C
279–744（466 aa）
链 D
279–744（466 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 3F9P Crystal structure of myeloperoxidase from human leukocytes 提交 2008-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
165–278（114 aa）
片段：Light chain: UNP residues 165-278
链 C
279–745（467 aa）
片段：Heavy chain: UNP residues 279-745
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.93 Å R-free 0.257 |
| 3F9P Crystal structure of myeloperoxidase from human leukocytes 提交 2008-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
165–278（114 aa）
片段：Light chain: UNP residues 165-278
链 D
279–745（467 aa）
片段：Heavy chain: UNP residues 279-745
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.93 Å R-free 0.257 |
| 3ZS0 Human Myeloperoxidase inactivated by TX2 提交 2011-06-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
70–177（108 aa）
链 B
70–177（108 aa）
链 C
184–650（467 aa）
链 D
184–650（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 ZS0 3-(4-FLUOROBENZYL)-2-THIOXO-1,2,3,7-TETRAHYDRO-6H-PURIN-6-ONE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.207 |
| 3ZS1 Human Myeloperoxidase inactivated by TX5 提交 2011-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
70–183（114 aa）
链 D
184–650（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PVW 3-(2-METHOXYETHYL)-2-THIOXO-1,2,3,7-TETRAHYDRO-6H-PURIN-6-ONE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；16-17% PEG3350, 100 MM NACL, pH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 3ZS1 Human Myeloperoxidase inactivated by TX5 提交 2011-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
70–183（114 aa）
链 C
184–650（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PVW 3-(2-METHOXYETHYL)-2-THIOXO-1,2,3,7-TETRAHYDRO-6H-PURIN-6-ONE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；16-17% PEG3350, 100 MM NACL, pH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 4C1M Myeloperoxidase in complex with the revesible inhibitor HX1 提交 2013-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
165–272（108 aa）
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NIH 2-{[3,5-BIS(TRIFLUOROMETHYL)BENZYL]AMINO}-N-HYDROXY-6-OXO-1,6-DIHYDROPYRIMIDINE-5-CARBOXAMIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.278 |
| 4C1M Myeloperoxidase in complex with the revesible inhibitor HX1 提交 2013-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
165–272（108 aa）
链 C
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NIH 2-{[3,5-BIS(TRIFLUOROMETHYL)BENZYL]AMINO}-N-HYDROXY-6-OXO-1,6-DIHYDROPYRIMIDINE-5-CARBOXAMIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.278 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–270（104 aa）
链 B
167–270（104 aa）
链 C
279–744（466 aa）
链 D
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 J
167–270（104 aa）
链 L
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 M
167–270（104 aa）
链 O
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 N
167–270（104 aa）
链 P
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
167–270（104 aa）
链 F
167–270（104 aa）
链 G
279–744（466 aa）
链 H
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 I
167–270（104 aa）
链 J
167–270（104 aa）
链 K
279–744（466 aa）
链 L
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 M
167–270（104 aa）
链 N
167–270（104 aa）
链 O
279–744（466 aa）
链 P
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–270（104 aa）
链 C
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–270（104 aa）
链 D
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
167–270（104 aa）
链 G
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–270（104 aa）
链 H
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4DL1 Crystal Structure of human Myeloperoxidase with covalent thioxanthine analog 提交 2012-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 I
167–270（104 aa）
链 K
279–744（466 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 0KY 3-[(2R)-2-ethoxypropyl]-2-thioxo-1,2,3,9-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；27% PEG 3350, 0.25 M CaCl2, betaine HCl, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 4EJX Structure of ceruloplasmin-myeloperoxidase complex 提交 2012-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
165–278（114 aa）
片段：UNP residues 165-278
链 D
279–745（467 aa）
片段：UNP residues 279-745
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；280 K；40% MPD, 0.2 M potassium fluoride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
|
分辨率 4.69 Å R-free 0.401 |
| 5FIW CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2015-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 C
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；15% PEG 3350, 100 MM NACL, pH 6
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.193 |
| 5FIW CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MYELOPEROXIDASE AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2015-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；15% PEG 3350, 100 MM NACL, pH 6
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.193 |
| 5MFA Crystal structure of human promyeloperoxidase (proMPO) 提交 2016-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
49–745（697 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；10% w/v PEG20000, 20% PEG MME 550, 0.1 mM Tris-Bicine, pH 8.5, 0.05 mM CaCl2
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.143 |
| 5QJ2 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) OMPLEX WITH COMPOUND-20 AKA 7-((3-(1-METHYL-1H-PYRAZOL-3- YL)BENZYL)OXY)- 1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
278–744（467 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 JXS 7-{[3-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methoxy}-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.272 |
| 5QJ2 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) OMPLEX WITH COMPOUND-20 AKA 7-((3-(1-METHYL-1H-PYRAZOL-3- YL)BENZYL)OXY)- 1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
278–744（467 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 JXS 7-{[3-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methoxy}-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.272 |
| 5QJ2 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) OMPLEX WITH COMPOUND-20 AKA 7-((3-(1-METHYL-1H-PYRAZOL-3- YL)BENZYL)OXY)- 1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–271（105 aa）
链 G
278–744（467 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 JXS 7-{[3-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methoxy}-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.272 |
| 5QJ2 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) OMPLEX WITH COMPOUND-20 AKA 7-((3-(1-METHYL-1H-PYRAZOL-3- YL)BENZYL)OXY)- 1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
167–271（105 aa）
链 I
278–744（467 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.272 |
| 5QJ3 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-24 AKA 7-({4-CHLORO-3'-FLUORO-[1,1'- BIPHENYL]-3-YL}METHOXY)-3H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN- 5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
278–744（467 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 JXP 7-[(4-chloro-3'-fluoro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methoxy]-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.228 |
| 5QJ3 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-24 AKA 7-({4-CHLORO-3'-FLUORO-[1,1'- BIPHENYL]-3-YL}METHOXY)-3H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN- 5-AMINE 提交 2018-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
278–744（467 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.228 |
| 5UZU Immune evasion by a Staphylococcal Peroxidase Inhibitor that blocks myeloperoxidase 提交 2017-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
72–649（578 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% w/v PEG-3350
0.2M ammonium citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 5WDJ CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-6 AKA 7-(BENZYLOXY)-1H-[1,2, 3]TRIAZOLO[4,5-D]PYRIMIDIN-5-AMINE 提交 2017-07-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
167–271（105 aa）
片段：UNP residues 167-271
链 B
184–649（466 aa）
片段：UNP residues 183-649
链 D
167–271（105 aa）
片段：UNP residues 167-271
链 E
184–649（466 aa）
片段：UNP residues 183-649
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AEY 7-(benzyloxy)-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-d]pyrimidin-5-amine × 2 CL CHLORIDE ION × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FUC alpha-L-fucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 6AZP A Structurally Dynamic N-terminal Region Drives Function of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor (SPIN) 提交 2017-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
72–648（577 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 7.0
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.229 |
| 6BMT Crystal Structure of a Recombinant form of Human Myeloperoxidase Bound to an Inhibitor from Staphylococcus delphini 提交 2017-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–745（745 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M acetate, pH 4.5-4.6, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.218 |
| 6WXZ CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-29 A.K.A 7-(1,2-DIPHENYLETHYL)-1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 HEC HEME C × 1 UEY 7-[(1R)-1,2-diphenylethyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.242 |
| 6WXZ CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-29 A.K.A 7-(1,2-DIPHENYLETHYL)-1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 HEC HEME C × 1 UEY 7-[(1R)-1,2-diphenylethyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.242 |
| 6WY0 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-40 A.K.A 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1r,4r)-4-phenylcyclohexyl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 UFA 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(trans-4-phenylcyclohexyl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.216 |
| 6WY0 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-40 A.K.A 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1r,4r)-4-phenylcyclohexyl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 UFA 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(trans-4-phenylcyclohexyl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.216 |
| 6WY0 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-40 A.K.A 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1r,4r)-4-phenylcyclohexyl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–271（105 aa）
链 G
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 UFA 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(trans-4-phenylcyclohexyl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.216 |
| 6WY0 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-40 A.K.A 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1r,4r)-4-phenylcyclohexyl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
167–271（105 aa）
链 I
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 UFA 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(trans-4-phenylcyclohexyl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.216 |
| 6WY5 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-37 A.K.A 7-(1-phenyl-3-(((1S,3S)-3-phenyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)propyl)-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 UF7 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1S,3S)-3-phenyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.245 |
| 6WY5 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-37 A.K.A 7-(1-phenyl-3-(((1S,3S)-3-phenyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)propyl)-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 UF7 7-[(1R)-1-phenyl-3-{[(1S,3S)-3-phenyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]amino}propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.245 |
| 6WY7 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-41 A.K.A 7-[1-phenyl-3-({4-phenylbicyclo[2.2.2]octan-1-yl}amino)propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 UFD 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(4-phenylbicyclo[2.2.2]octan-1-yl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.185 |
| 6WY7 CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-41 A.K.A 7-[1-phenyl-3-({4-phenylbicyclo[2.2.2]octan-1-yl}amino)propyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 HEC HEME C × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 UFD 7-{(1R)-1-phenyl-3-[(4-phenylbicyclo[2.2.2]octan-1-yl)amino]propyl}-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.185 |
| 6WYD CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-12 (AKA; 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyrid 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEC HEME C × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 7GD 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 6WYD CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-12 (AKA; 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyrid 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
279–745（467 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEC HEME C × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 7GD 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 6WYD CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-12 (AKA; 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyrid 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–271（105 aa）
链 G
279–745（467 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEC HEME C × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 7GD 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 6WYD CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-12 (AKA; 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyrid 提交 2020-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
167–271（105 aa）
链 I
279–745（467 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 HEC HEME C × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 7GD 7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.254 |
| 7LAE CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-4 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 XRV 7-{[1-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]methyl}-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.267 |
| 7LAE CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-4 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 XRV 7-{[1-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]methyl}-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.267 |
| 7LAG CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-14 AKA 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XSD 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.235 |
| 7LAG CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-14 AKA 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XSD 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.235 |
| 7LAG CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-14 AKA 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–271（105 aa）
链 G
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XSD 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.235 |
| 7LAG CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH Compound-14 AKA 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
167–271（105 aa）
链 I
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 XSD 7-({1-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}methyl)-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.235 |
| 7LAL CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-18 AKA 7-(3-(2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLAMINO)-1-PHENYLPROPYL)-1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.270 |
| 7LAL CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-18 AKA 7-(3-(2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLAMINO)-1-PHENYLPROPYL)-1H-[1,2,3]TRIAZOLO[4,5-B]PYRIDIN-5-AMINE 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 XSG 7-[(1R)-3-{[(1R)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]amino}-1-phenylpropyl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.270 |
| 7LAN CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-30 AKA 7-[(3~{S},4~{R},6~{R})-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1^{3,6}.1^{11,14}]docosa-1(19),11(21),12,16(20),17-pentaen-10-yl]-3~{H}-triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
链 B
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XS1 7-[(3R,4S,6S,10R)-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1~3,6~.1~11,14~]docosa-1(20),11(21),12,16,18-pentaen-10-yl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 7LAN CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-30 AKA 7-[(3~{S},4~{R},6~{R})-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1^{3,6}.1^{11,14}]docosa-1(19),11(21),12,16(20),17-pentaen-10-yl]-3~{H}-triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
167–271（105 aa）
链 E
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XS1 7-[(3R,4S,6S,10R)-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1~3,6~.1~11,14~]docosa-1(20),11(21),12,16,18-pentaen-10-yl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 7LAN CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-30 AKA 7-[(3~{S},4~{R},6~{R})-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1^{3,6}.1^{11,14}]docosa-1(19),11(21),12,16(20),17-pentaen-10-yl]-3~{H}-triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
167–271（105 aa）
链 G
184–649（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 XS1 7-[(3R,4S,6S,10R)-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1~3,6~.1~11,14~]docosa-1(20),11(21),12,16,18-pentaen-10-yl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 7LAN CRYSTAL STRUCTURE OF MYELOPEROXIDASE SUBFORM C (MPO) COMPLEX WITH COMPOUND-30 AKA 7-[(3~{S},4~{R},6~{R})-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1^{3,6}.1^{11,14}]docosa-1(19),11(21),12,16(20),17-pentaen-10-yl]-3~{H}-triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine 提交 2021-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
167–271（105 aa）
链 I
184–649（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 XS1 7-[(3R,4S,6S,10R)-4-benzyl-2-oxa-7,13,14-triazatetracyclo[14.3.1.1~3,6~.1~11,14~]docosa-1(20),11(21),12,16,18-pentaen-10-yl]-3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.1M Hepes pH 7.5, 150mM NaCl, 20-25%(V/V)PEG3350.Crystals were cryoprotected by supplementing the mother liquor with 15% (v/v) ethylene glycol and harvested by flash-cooling in liquid nitrogen
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 7NI1 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE HUMAN MYELOPEROXIDASE IN COMPLEX WITH CPD 9 提交 2021-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 C
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 UEB (S)-1-(2-(amino(phenyl)methyl)benzyl)-2-thioxo-1,2,3,5-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18% PEG 3350, 100 MM NACL, PROTEIN BUFFER CONTAINED 50 MM AMMOIUM SULPHATE, 20 MM AMMONIUM ACETATE PH 5.5 AND 2 MM CACL
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.256 |
| 7NI1 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE HUMAN MYELOPEROXIDASE IN COMPLEX WITH CPD 9 提交 2021-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 UEB (S)-1-(2-(amino(phenyl)methyl)benzyl)-2-thioxo-1,2,3,5-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18% PEG 3350, 100 MM NACL, PROTEIN BUFFER CONTAINED 50 MM AMMOIUM SULPHATE, 20 MM AMMONIUM ACETATE PH 5.5 AND 2 MM CACL
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.256 |
| 7NI3 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE HUMAN MYELOPEROXIDASE IN COMPLEX WITH CPD 3 提交 2021-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 C
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 UE8 2-sulfanylidene-3-[(2R)-tetrahydro-2-furanylmethyl]-1,2,3,7-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18% PEG 3350, 100 MM NACL, PROTEIN IN 50 MM AMMONIUM ACETATE, 2 MM CACL, 20 MM SODIUM ACETATE PH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 7NI3 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE HUMAN MYELOPEROXIDASE IN COMPLEX WITH CPD 3 提交 2021-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
167–271（105 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–744（466 aa）
片段：UNP RESIDUES 279-744
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CL CHLORIDE ION × 2 UE8 2-sulfanylidene-3-[(2R)-tetrahydro-2-furanylmethyl]-1,2,3,7-tetrahydro-6H-purin-6-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18% PEG 3350, 100 MM NACL, PROTEIN IN 50 MM AMMONIUM ACETATE, 2 MM CACL, 20 MM SODIUM ACETATE PH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 7OIH Glycosylation in the crystal structure of neutrophil myeloperoxidase 提交 2021-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
166–744（579 aa）
链 B
166–744（579 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 10 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 SCN THIOCYANATE ION × 3 8PR Paroxetine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate
0.1 M Sodium cacodylate
8% w/v PGA L/M
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.220 |
| 7OIH Glycosylation in the crystal structure of neutrophil myeloperoxidase 提交 2021-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
166–744（579 aa）
链 D
166–744（579 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 SCN THIOCYANATE ION × 3 8PR Paroxetine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate
0.1 M Sodium cacodylate
8% w/v PGA L/M
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.220 |
| 7OIH Glycosylation in the crystal structure of neutrophil myeloperoxidase 提交 2021-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
166–744（579 aa）
链 F
166–744（579 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 9 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 SCN THIOCYANATE ION × 2 8PR Paroxetine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate
0.1 M Sodium cacodylate
8% w/v PGA L/M
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.220 |
| 7OIH Glycosylation in the crystal structure of neutrophil myeloperoxidase 提交 2021-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
166–744（579 aa）
链 H
166–744（579 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 9 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 SCN THIOCYANATE ION × 2 8PR Paroxetine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium thiocyanate
0.1 M Sodium cacodylate
8% w/v PGA L/M
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.220 |
| 7QZR Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with the Staphyloccal Peroxidase Inhibitor SPIN from Staphylococcus aureus 提交 2022-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
165–278（114 aa）
链 B
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 HEC HEME C × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.244 |
| 7QZR Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with the Staphyloccal Peroxidase Inhibitor SPIN from Staphylococcus aureus 提交 2022-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
165–278（114 aa）
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；8% (w/V) PEG 20000, 0.1 M BICINE pH 9, 0.5% (V/V) Dioxane
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.244 |
| 9GEN Recombinant Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric |
链 L
167–743（577 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.76 Å |
| 9GEP Native monomeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric |
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 9GEQ Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle; composite map 提交 2024-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric |
链 K
165–272（108 aa）
链 L
279–744（466 aa）
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9GER Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle, intermediate state; composite map 提交 2024-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric |
链 K
165–272（108 aa）
链 L
279–744（466 aa）
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 9IHD Nucleosome core particle bound by one molecule of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric |
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9IHE Nucleosome core particle bound by two molecules of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric |
链 K
165–272（108 aa）
链 L
279–744（466 aa）
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9IHF Nucleosome core particle bound by one monomer and one dimer of of DTT-reduced native myeloperoxidase 提交 2025-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric |
链 K
165–272（108 aa）
链 L
279–744（466 aa）
链 M
165–272（108 aa）
链 N
279–744（466 aa）
链 O
165–272（108 aa）
链 P
279–744（466 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9QE3 Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and selenocyanate at pH 5.5 提交 2025-03-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 B
279–745（467 aa）
链 C
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SEK SELENOCYANATE ION × 32 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；0.1 M Na Acet 5.5 pH (Buffer)
6 %(w/v) PEG 8K (Precipitant)
10 %(w/v) PEG 1K (Precipitant)
0.4 M KSeCN (Salt)
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.234 |
| 9QEX Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and thiocyanate at pH 7.5 提交 2025-03-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 B
279–745（467 aa）
链 C
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 15 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295.15 K；0.1 M TRIS 7.5 pH (Buffer)
4 %(w/v) PEG 8K (Precipitant)
10 %(w/v) PEG 1K (Precipitant)
0.4 M KSCN (Salt)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.216 |
| 9QGA Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and bromide at pH 7.5 提交 2025-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
165–278（114 aa）
链 B
279–745（467 aa）
链 C
165–278（114 aa）
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 BR BROMIDE ION × 46 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295.15 K；0.1 M TRIS 7.5 pH
6 %(w/v) PEG 8K
8 %(w/v) PEG 1K
0.4 M NaI
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.252 |
| 9QJ3 Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and iodide at pH 5.5 提交 2025-03-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 B
279–745（467 aa）
链 C
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 89 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；0.1 M Na Acet 5.5 pH
6 %(w/v) PEG 8K
10 %(w/v) PEG 1K
0.4 M NaI
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.249 |
| 9QJO Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and bromide at pH 5.5 提交 2025-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
165–278（114 aa）
链 B
279–745（467 aa）
链 C
165–278（114 aa）
链 D
279–745（467 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 BR BROMIDE ION × 56 CA CALCIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；10 %(w/v) PEG 1K
8 %(w/v) PEG 8K
0.4 M NaBr
0.1 M Na Acet 5.5 pH
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.232 |
| 9SDS Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and chloride at pH 5.5 提交 2025-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 C
279–745（467 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 IOD IODIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；0.1 M Na Acet 5.5 pH (Buffer)
10 %w/v PEG 1K (Precipitant)
7 %w/v PEG 8K (Precipitant)
0.4 M NaI (Salt)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.234 |
| 9SDS Structure of native leukocyte myeloperoxidase in complex with a truncated version of the Staphylococcal Peroxidase Inhibitor SPIN and chloride at pH 5.5 提交 2025-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
165–278（114 aa）
片段：UNP RESIDUES 167-271
链 D
279–745（467 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 IOD IODIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；0.1 M Na Acet 5.5 pH (Buffer)
10 %w/v PEG 1K (Precipitant)
7 %w/v PEG 8K (Precipitant)
0.4 M NaI (Salt)
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.234 |
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| UniProt名称 | PERM_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1, 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 C； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 G； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 I； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 M； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 O； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 S； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 U； PDB构建体 1–106； UniProt 166–271 作者链 B； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 D； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 H； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 J； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 N； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 P； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 T； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 作者链 V； PDB构建体 1–466； UniProt 279–744 |
