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8a50

Crystal structure of HSF2BP-ALPHA1 tetramer

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 51.8 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock factor 2-binding protein

物种未注明

UniProt O75031

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 19–50 链 B； UniProt 19–50 未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M LiCl 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 5 20% PEG6000 分辨率 1.48 Å R-free 0.217

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8A50 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7BDX Armadillo domain of HSF2BP in complex with BRCA2 peptide 提交 2020-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 122–334（213 aa）
链 B 122–334（213 aa）
链 C 122–334（213 aa）
链 D 122–334（213 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG 3350 : 16% (w/v) Mes ph 6.0 100 mM MgCl2 100 mM
分辨率 2.60 Å R-free 0.241
7LDG Crystal structure of the MEILB2-BRCA2 complex 提交 2021-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 83–334（252 aa） 片段：aa83-334
链 C 83–334（252 aa） 片段：aa83-334
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；289 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M lithium acetate
分辨率 2.56 Å R-free 0.231
8A51 Crystal structure of HSF2BP-BRME1 complex 提交 2022-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 19–50（32 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES sodium salt, pH 7.5, 40% PEG200
分辨率 1.90 Å R-free 0.243

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HSF2B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–32； UniProt 19–50 作者链 B； PDB构建体 1–32； UniProt 19–50

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8a50

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8a50
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8a50
沉积日期 deposition_date2022-06-13
结构标题 titleCrystal structure of HSF2BP-ALPHA1 tetramer
关键词 keywordsComplex, RECOMBINATION; RECOMBINATION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.67 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron14.72 Å
零角强度 I(0) i01246540.00
分子量 molecular_weight7394.0 kDa
排除体积 excluded_volume9308 ų
包络体积 envelope_volume12433 ų
水化壳体积 shell_volume7893 ų
包络直径 envelope_diameter51.8 Å
壳层 Rg shell_rg18.77 Å
包络 Rg envelope_rg14.69 Å
形状 Rg shape_rg14.74 Å
总 Rg total_rg15.71 Å
总原子数 total_atoms1065
残基数 n_residues59
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.8 Å
Rg (实空间) rg_real15.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.37 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2470e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.3560e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1247000.0000
解质量估计 total_estimate0.6153
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary20.3 Å
偏度 Skewness skewness0.178
峰度 Kurtosis kurtosis-0.231
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha63340.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.634; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.368; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)