Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | (2~{S})-2-[[(2~{S})-2-(3-oxidanylidene-1~{H}-isoindol-2-yl)-3-phenyl-propanoyl]amino]propanoic acid × 2 GLYCEROL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SDCB1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–166； UniProt 113–273 作者链 B； PDB构建体 6–166； UniProt 113–273 |
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| 条目编号 entry_id | 8aak |
| 沉积日期 deposition_date | 2022-07-01 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the PDZ tandem of syntenin in complex with compound 29 |
| 关键词 keywords | signaling protein cell adhesion PDZ domain syntenin syndecan drug design, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.86 Å |
| Rg（电子密度） | 21.95 Å |
| 总 Rg | 22.84 Å |
| 原子数 | 2554 |
| 残基数 | 328 |
| 排除体积 | 45629 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 8aakA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 42 — Pdz3 Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — PDZ domain |
| 结构域编号 domain_id | 8aakA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 42 — Pdz3 Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — PDZ domain |
| 结构域编号 domain_id | 8aakB01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 42 — Pdz3 Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — PDZ domain |
| 结构域编号 domain_id | 8aakB02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 42 — Pdz3 Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — PDZ domain |