8ay9

X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE CsPYL1(V112L, T135L,F137I, T153I, V168A)-ABA-HAB1 TERNARY COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Abscisic acid receptor PYL1

Citrus sinensis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein phosphatase 2C 16 × 1 （Q9CAJ0） (2Z,4E)-5-[(1S)-1-hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxocyclohex-2-en-1-yl]-3-methylpenta-2,4-dienoic acid × 1 MANGANESE (II) ION × 4 CHLORIDE ION × 6 GLYCEROL × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A067E666_CITSI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–209； UniProt 1–209

Protein phosphatase 2C 16

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9CAJ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Abscisic acid receptor PYL1 × 1 （A0A067E666） (2Z,4E)-5-[(1S)-1-hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxocyclohex-2-en-1-yl]-3-methylpenta-2,4-dienoic acid × 1 MANGANESE (II) ION × 4 CHLORIDE ION × 6 GLYCEROL × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	P2C16_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–333； UniProt 179–511

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ay9
沉积日期 deposition_date	2022-09-02
结构标题 title	X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE CsPYL1(V112L, T135L,F137I, T153I, V168A)-ABA-HAB1 TERNARY COMPLEX
关键词 keywords	CsPYL1_5M, HAB1, Phosphatase ABA receptor inhibitor complex, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ay9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ay9__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ay9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.39 Å
Rg（电子密度）	26.88 Å
总 Rg	27.46 Å
原子数	3939
残基数	500
排除体积	69406 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ay9__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Abscisic acid receptor PYL1
分子量 formula_weight	23269.9 kDa
突变 mutation	V112L, T135L, F137I, T153I, V168A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3983

MNNNKAEADTSSSMADPETRPTYTTHHLAIPSGVTQDEFDELKQSVVEFHTYQLSQNQCSSLLAQRIRAPNDVVWSIVRRFDQPQTYKHFIKSCSVSDNFTMAVGSTRDVNLISGLPAATSTERLDILDDDRQVLGISIIGGEHRLRNYRSVISVHGFNRDGAICTVALESYVVDVPEGNTEEDTRLFADTVVKLNLQKLVSVAESQVI

来源 Source

来源生物 organism	Citrus sinensis
通用名 common_name	sweet orange
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2711
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein phosphatase 2C 16
分子量 formula_weight	36971.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.3.16
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

RSVYELDCIPLWGVVSIQGNRSEMEDAFAVSPHFLKLPIKMLMGDHEGMSPSLTHLTGHFFGVYDGHGGHKVADYCRDRLHFALAEEIERIKDELCKRNTGAGRQVQWDKVFTSCFLTVDGEIEGKIGRAVVGSSDKVLEAVASETVGSTAVVALVCSSHIVVSNCGDSRAVLFRGKEAMPLSVDHKPDREDEYARIENAGGKVIQWQGARVFGVLAMSRSIGDRYLKPYVIPEPEVTFMPRSREDECLILASDGLWDVMNNQEVCEIARRRILMWHKKNGAPPLAERGKGIDPACQAAADYLSMLALQKGSKDNISIIVIDLKAQRKFKTRT

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	(2Z,4E)-5-[(1S)-1-hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxocyclohex-2-en-1-yl]-3-methylpenta-2,4-dienoic acid
分子量 formula_weight	264.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	44

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晶胞边长 a length_a	42.763 Å
晶胞边长 b length_b	62.923 Å
晶胞边长 c length_c	187.010 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	2.281 Å
最低分辨率 resolution_low	44.280 Å
R 因子 r_factor	0.2055
R_work r_work	0.2025
R_free r_free	0.2596

X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE CsPYL1(V112L, T135L,F137I, T153I, V168A)-ABA-HAB1 TERNARY COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Abscisic acid receptor PYL1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein phosphatase 2C 16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ay9__assembly_1__model_1

8ay9__assembly_1__model_1 | I(q)

8ay9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)

X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE CsPYL1(V112L, T135L,F137I, T153I, V168A)-ABA-HAB1 TERNARY COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Abscisic acid receptor PYL1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein phosphatase 2C 16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ay9__assembly_1__model_1

8ay9__assembly_1__model_1 | I(q)

8ay9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)