SAXSdb — 8ce8

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA

Escherichia coli K-12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Heme exporter protein B × 2 （P0ABL8） Heme exporter protein C × 2 （P0ABM1） Heme exporter protein D × 2 （P0ABM5） Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE × 1 （P69490）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCMA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 12–218； UniProt 1–207 作者链 a； PDB构建体 12–218； UniProt 1–207

Heme exporter protein B

Escherichia coli K-12

UniProt P0ABL8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA × 2 （P33931） Heme exporter protein C × 2 （P0ABM1） Heme exporter protein D × 2 （P0ABM5） Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE × 1 （P69490）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCMB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 b； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220

Heme exporter protein C

Escherichia coli K-12

UniProt P0ABM1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA × 2 （P33931） Heme exporter protein B × 2 （P0ABL8） Heme exporter protein D × 2 （P0ABM5） Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE × 1 （P69490）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCMC_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245 作者链 c； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245

Heme exporter protein D

Escherichia coli K-12

UniProt P0ABM5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA × 2 （P33931） Heme exporter protein B × 2 （P0ABL8） Heme exporter protein C × 2 （P0ABM1） Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE × 1 （P69490）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCMD_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69 作者链 d； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE

Escherichia coli K-12

UniProt P69490

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA × 2 （P33931） Heme exporter protein B × 2 （P0ABL8） Heme exporter protein C × 2 （P0ABM1） Heme exporter protein D × 2 （P0ABM5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCME_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ce8
沉积日期 deposition_date	2023-02-01
结构标题 title	Cytochrome c maturation complex CcmABCDE
关键词 keywords	Cytochrome c maturation, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ce8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ce8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ce8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.18 Å
Rg（电子密度）	36.98 Å
总 Rg	37.39 Å
原子数	12674
残基数	1620
排除体积	229980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ce8__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA
分子量 formula_weight	24411.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.6.2.5
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	12674

MASWSHPQFEKMGMLEARELLCERDERTLFSGLSFTLNAGEWVQITGSNGAGKTTLLRLLTGLSRPDAGEVLWQGQPLHQVRDSYHQNLLWIGHQPGIKTRLTALENLHFYHRDGDTAQCLEALAQAGLAGFEDIPVNQLSAGQQRRVALARLWLTRATLWILDEPFTAIDVNGVDRLTQRMAQHTEQGGIVILTTHQPLNVAESKIRRISLTQTRAA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Heme exporter protein B
分子量 formula_weight	23632.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MMFWRIFRLELRVAFRHSAEIANPLWFFLIVITLFPLSIGPEPQLLARIAPGIIWVAALLSSLLALERLFRDDLQDGSLEQLMLLPLPLPAVVLAKVMAHWMVTGLPLLILSPLVAMLLGMDVYGWQVMALTLLLGTPTLGFLGAPGVALTVGLKRGGVLLSILVLPLTIPLLIFATAAMDAASMHLPVDGYLAILGALLAGTATLSPFATAAALRISIQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Heme exporter protein C
分子量 formula_weight	27911.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MWKTLHQLAIPPRLYQICGWFIPWLAIASVVVLTVGWIWGFGFAPADYQQGNSYRIIYLHVPAAIWSMGIYASMAVAAFIGLVWQMKMANLAVAAMAPIGAVFTFIALVTGSAWGKPMWGTWWVWDARLTSELVLLFLYVGVIALWHAFDDRRLAGRAAGILVLIGVVNLPIIHYSVEWWNTLHQGSTRMQQSIDPAMRSPLRWSIFGFLLLSATLTLMRMRNLILLMEKRRPWVSELILKRGRK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Heme exporter protein D
分子量 formula_weight	7753.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MTPAFASWNEFFAMGGYAFFVWLAVVMTVIPLVVLVVHSVMQHRAILRGVAQQRAREARLRAAQQQEAA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
分子量 formula_weight	17720.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MNIRRKNRLWIACAVLAGLALTIGLVLYALRSNIDLFYTPGEILYGKRETQQMPEVGQRLRVGGMVMPGSVQRDPNSLKVTFTIYDAEGSVDVSYEGILPDLFREGQGVVVQGELEKGNHILAKEVLAKHDENYTPPEVEKAMEANHRRPASVYKDPAS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	8ce8E01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.81 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	135175

Cytochrome c maturation complex CcmABCDE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c biogenesis ATP-binding export protein CcmA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Heme exporter protein B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Heme exporter protein C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Heme exporter protein D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ce8__assembly_1__model_1

8ce8__assembly_1__model_1 | I(q)

8ce8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)