8ch5

Cryo-EM structure of the fd bacteriophage capsid major coat protein pVIII

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major capsid protein pVIII

物种未注明

UniProt P69539

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 50 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAPSD_BPFD
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–50; UniProt 24–73

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8ch5
沉积日期 deposition_date2023-02-07
结构标题 titleCryo-EM structure of the fd bacteriophage capsid major coat protein pVIII
关键词 keywordsBacteriophage, fd, inovirus, ff, helical, phage, filamentous, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ch5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ch5__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ch5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)54.98 Å
Rg(电子密度)55.84 Å
总 Rg55.51 Å
原子数16800
残基数2250
排除体积309390 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8ch5__assembly_1__model_1 50-meric (50) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 引用文献 (2)