SAXSdb — 8d7i

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neutrophil elastase

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ELNE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247 作者链 D； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247 作者链 G； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247 作者链 J； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247 作者链 M； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247 作者链 P； PDB构建体 1–218； UniProt 30–247

Extracellular Adherence Protein

Staphylococcus aureus subsp. aureus

UniProt Q99QS1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Cathepsin G, C-terminal truncated form × 1 （P08311）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAP_STAAM
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145 作者链 E； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145 作者链 H； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145 作者链 K； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145 作者链 N； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145 作者链 Q； PDB构建体 4–100； UniProt 49–145

Cathepsin G, C-terminal truncated form

物种未注明

UniProt P08311

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Neutrophil elastase × 1 （P08246） Extracellular Adherence Protein × 1 （Q99QS1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CATG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243 作者链 F； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243 作者链 I； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243 作者链 L； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243 作者链 O； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243 作者链 R； PDB构建体 1–223； UniProt 21–243

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8d7i
沉积日期 deposition_date	2022-06-07
结构标题 title	Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus
关键词 keywords	Protease Inhibitor, Immune Evasion, Neutrophil, S. aureus, PROTEIN BINDING, HYDROLASE-INHIBITOR, PROTEIN BINDING complex; HYDROLASE/INHIBITOR,PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8d7i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8d7i__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8d7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.93 Å
Rg（电子密度）	28.30 Å
总 Rg	28.99 Å
原子数	4198
残基数	540
排除体积	74248 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8d7i__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8d7i__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`8d7i__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`8d7i__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`8d7i__assembly_5__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`8d7i__assembly_6__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Neutrophil elastase
分子量 formula_weight	23319.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.37
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,G,J,M,P
原子数 atom_count	25188

IVGGRRARPHAWPFMVSLQLRGGHFCGATLIAPNFVMSAAHCVANVNVRAVRVVLGAHNLSRREPTRQVFAVQRIFENGYDPVNLLNDIVILQLNGSATINANVQVAQLPAQGRRLGNGVQCLAMGWGLLGRNRGIASVLQELNVTVVTSLCRRSNVCTLVRGRQAGVCFGDSGSPLVCNGLIHGIASFVRGGCASGLYPDAFAPVAQFVNWIDSIIQ

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Extracellular Adherence Protein
分子量 formula_weight	11185.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E,H,K,N,Q

GSTIQIPYTITVNGTSQNILSSLTFNKNQNISYKDIENKVKSVLYFNRGISDIDLRLSKQAEYTVHFKNGTKRVIDLKSGIYTADLINTSDIKAISVNVD

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus subsp. aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	158878
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cathepsin G, C-terminal truncated form
分子量 formula_weight	25397.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I,L,O,R

IIGGRESRPHSRPYMAYLQIQSPAGQSRCGGFLVREDFVLTAAHCWGSNINVTLGAHNIQRRENTQQHITARRAIRHPQYNQRTIQNDIMLLQLSRRVRRNRNVNPVALPRAQEGLRPGTLCTVAGWGRVSMRRGTDTLREVQLRVQRDRQCLRIFGSYDPRRQICVGDRRERKAAFKGDSGGPLLCNNVAHGIVSYGKSSGVPPEVFTRVSSFLPWIRTTMR

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	8d7iB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	8d7iE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	8d7iH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	8d7iK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	8d7iN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	8d7iQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

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晶胞边长 a length_a	102.230 Å
晶胞边长 b length_b	152.270 Å
晶胞边长 c length_c	296.380 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.630 Å
最低分辨率 resolution_low	96.640 Å
R 因子 r_factor	0.1876
R_work r_work	0.1865
R_free r_free	0.2170

Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neutrophil elastase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Extracellular Adherence Protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cathepsin G, C-terminal truncated form

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8d7i__assembly_1__model_1

8d7i__assembly_1__model_1 | I(q)

8d7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neutrophil elastase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Extracellular Adherence Protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cathepsin G, C-terminal truncated form

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8d7i__assembly_1__model_1

8d7i__assembly_1__model_1 | I(q)

8d7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)