8d8j

Yeast mitochondrial small subunit assembly intermediate (State 1)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT22_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628

37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial

物种未注明

UniProt P12686

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT13_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–339； UniProt 1–339

Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1

物种未注明

UniProt A0A8H4FBQ6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8H4FBQ6_YEASX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–864； UniProt 1–864

37S ribosomal protein S28, mitochondrial

物种未注明

UniProt P21771

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT28_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

37S ribosomal protein S16, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q02608

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT16_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

37S ribosomal protein S17, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q03246

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT17_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial

物种未注明

UniProt P40033

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RSM18_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

37S ribosomal protein PET123, mitochondrial

物种未注明

UniProt P17558

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RTPT_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–318； UniProt 1–318

Protein FYV4, mitochondrial

物种未注明

UniProt P38783

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	FYV4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial

物种未注明

UniProt P27929

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NAM9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–486； UniProt 1–486

37S ribosomal protein S5, mitochondrial

物种未注明

UniProt P33759

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT05_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–307； UniProt 1–307

37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial

物种未注明

UniProt P28778

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT06_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

37S ribosomal protein S35, mitochondrial

物种未注明

UniProt P53292

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT35_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 6； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

37S ribosomal protein S8, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q03799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 15S ribosomal RNA × 1 uS12m × 1 （A0A6A5Q5F6） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT08_YEAST
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

uS12m

物种未注明

UniProt A0A6A5Q5F6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial × 1 （P36056） 37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial × 1 （P12686） Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1 × 1 （A0A8H4FBQ6） 37S ribosomal protein S28, mitochondrial × 1 （P21771） 37S ribosomal protein S16, mitochondrial × 1 （Q02608） 37S ribosomal protein S17, mitochondrial × 1 （Q03246） 37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial × 1 （P40033） 37S ribosomal protein PET123, mitochondrial × 1 （P17558） Protein FYV4, mitochondrial × 1 （P38783） 37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial × 1 （P27929） 37S ribosomal protein S5, mitochondrial × 1 （P33759） 37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial × 1 （P28778） 37S ribosomal protein S35, mitochondrial × 1 （P53292） 37S ribosomal protein S8, mitochondrial × 1 （Q03799） 15S ribosomal RNA × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 29	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q5F6_YEASX
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8d8j
沉积日期 deposition_date	2022-06-08
结构标题 title	Yeast mitochondrial small subunit assembly intermediate (State 1)
关键词 keywords	Ribonucleoprotein complex Mitochondria Biogenesis, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8d8j__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8d8j__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8d8j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.27 Å
Rg（电子密度）	69.65 Å
总 Rg	69.62 Å
原子数	51386
残基数	4585
排除体积	823240 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8d8j__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial
分子量 formula_weight	72308.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0
原子数 atom_count	51386

MMKRCFSILPQNVRFSSKFTSLNLPKLDLADFIDSNKRGINVLPSYRDETASTTQATNSKELRLLSKTLQGQSYRDQLELNPDVSKAINNNIMAVHIPNNLRRVATNYYKEIQEPNSLHRPCRTKMEVDAHIASIFLQNYGSIFQSLKELQKRVGPDNFKPQRILDVGYGPATGIVALNDILGPNYRPDLKDAVILGNAEMQERAKIILSRQLNEVVDTVEENVSTEKEQETDRRNKNFQEDEHIGEVMTKKINIMTNLRSSIPASKEYDLIILTHQLLHDGNQFPIQVDENIEHYLNILAPGGHIVIIERGNPMGFEIIARARQITLRPENFPDEFGKIPRPWSRGVTVRGKKDAELGNISSNYFLKVIAPCPHQRKCPLQVGNPNFYTHKEGKDLKFCNFQKSIKRPKFSIELKKGKLLATSWDGSQGNASRLKGTGRRNGRDYEILNYSYLIFERSHKDENTLKEIKKLRNENVNGKYDIGSLGDDTQNSWPRIINDPVKRKGHVMMDLCAPSGELEKWTVSRSFSKQIYHDARKSKKGDLWASAAKTQIKGLGDLNVKKFHKLEKERIKQLKKEERQKARKAMESYNELEDSLQFDDHQFSNFEVMKKLSTFHGNDFLQHVNRK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial
分子量 formula_weight	39045.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

MGTITVVINEGPILLIRALHRATTNKKMFRSTVWRRFASTGEIAKAKLDEFLIYHKTDAKLKPFIYRPKNAQILLTKDIRDPKTREPLQPRPPVKPLSKQTLNDFIYSVEPNSTELLDWFKEWTGTSIRKRAIWTYISPIHVQKMLTASFFKIGKYAHMVGLLYGIEHKFLKAQNPSVFDIEHFFNTNIMCALHRNRLKDYKDAEIAQRKLQVAWKKVLNRKNNTGLANILVATLGRQIGFTPELTGLQPVDISLPDIPNSSSGAELKDLLSKYEGIYLIARTLLDIDQHNAQYLELQEFIRQYQNALSESSDPYDTHLKALGLLETPPPQESTEKEEK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1
分子量 formula_weight	101568.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MYMARCGPKNNVLCFPFQLSFLFSKRLINKRFKYTLQTEDEKNMMGSLSKNKIITPEDVEFKLAQLREFSNTLKERIHNTKSVNSDGHQSNSIAPISEDSRNVNVTKTSSVPNEEKSKNLSDLIHSSFLEKMDHLVPKVIRERVADDDILAKNLFDRSHSNWAPVIDRLYVSEKRFMDIDSREFSVWLNGTVKYLPFHSILHLDEMLLEQINGDVVKFNTHMYECIFNNLGNLKPTNFNQDGTNDKVILKMKELLERYDKALKITEERINKKEGFPSKVPKMTQAILNNCLKYSTKCSSFHDMDYFITKFRDDYGITPNKQNLTTVIQFYSRKEMTKQAWNTFDTMKFLSTKHFPDICTYNTMLRICEKERNFPKALDLFQEIQDHNIKPTTNTYIMMARVLASSSSNAVVSEGKSDSLRLLGWKYLHELEDKNLYRHKKDDLNLFLAMMALAAFDGDIELSRALYYLFIAKKYKTLCANWKGNILVDQDTIWKSTLMPEMLNYLMLAYARFDPRNLPVLSGYEKGIELRRKFLREFDSSMRLDDTDKLVKFKLPFLPISDLNSEAQVLAESNAIWSFNMENGGTRNTLTSSNEAALEDIKKYRQLLDSFAQEAEDFNEFKFKVMYEVTKMQRESINVNVFNKISLHTYLSIPINLKQQKEFLRRLTFFTFQQHEFEAVIKRLYEGYRNIPSSHTRDQNSISTEAISVSKPETTEDLNLIMHDIWYITCLRHKIMMDTTLYELVMKAAIEFQNEDLAKKVWNDRGKFRTTVPFLKMDQRIRIAKDQKFAHLMVEFFTKQGKYSDAIAIILSSKNRFNWTYSMVRNLHKALEEIEDRNSVEILLDVVNKKSHAKALKWEEQELNM

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S28, mitochondrial
分子量 formula_weight	33116.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSIVGRNAILNLRISLCPLFMGKRSFVSSPVSNSAKAVKFLKAQRRKQKNEAKQATLKASTDKVDPVLGRADTPFITRIMAELKEPLVLSKGYNIEEVDKFLAAIESAKRERAELSGLNTEVVGIEDIEKLEDRREAILRILSMRNSENKNAIKMAVELARKEFERFPGDTGSSEVQAACMTVRIQNMANHIKEHRKDFANTRNLRILVQQRQAILRYLKRDNPEKYYWTIQKLGLNDAAITDEFNMDRRYMQDYEFFGDKILIRDSKKVANQKRKEIRKQKRATF

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S16, mitochondrial
分子量 formula_weight	13663.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MTCGLVRIRLARFGRKNSPVYNIVVANSRKARDAKPIEVLGTYVPVPSPVTKRELKRGVVPIKDVKLDFDRTKYWIGVGAQPSETVTKLLRKAGILNDAWATSKNSNVNRKVVFERMETLE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S17, mitochondrial
分子量 formula_weight	27684.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MARQNFLGLVVSQGKMQKTVKVRVETKVFNKKINKELFHRRDYLVHDEGEISREGDLVRIEATRPLSKRKFFAIAEIIRNKGQQFALYESEAQLSVAKEEAQKAKEFLDKRSVRENKLNEKTTLLRDIRTIQDALSSGSTPKELLEIKQRYGIQDFSQETVRQLLQLDISGLEVNLEKQRSLIDRIQTRLSELLSNDLKCDQFLKDHGVEDPLTLKKNIKKNLLRKHVMMDMQQPSQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial
分子量 formula_weight	15866.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MQPIIKGAVSSTFKRALYNFGIKEKKSVNIEMGRTQQTKKIDQSLSKKLPKGTIYDPFDFSMGRIHLDRKYQANKNSNRNDIMKSGANPLEFYARPRILSRYVTSTGRIQHRDITGLSAKNQRRLSKAIRRCQAIGLM

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	37S ribosomal protein PET123, mitochondrial
分子量 formula_weight	36059.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MGKGAAKYGFKSGVFPTTRSILKSPTTKQTDIINKVKSPKPKGVLGIGYAKGVKHPKGSHRLSPKVNFIDVDNLIAKTVAEPQSIKSSNGSAQKVRLQKAELRRKFLIEAFRKEEARLLHKHEYLQKRTKELEKAKELELEKLNKEKSSDLTIMTLDKMMSQPLLRNRSPEESELLKLKRNYNRSLLNFQAHKKKLNELLNLYHVANEFIVTESQLLKKIDKVFNDETEEFTDAYDVTSNFTQFGNRKLLLSGNTTLQTQINNAIMGSLSNEKFFDISLVDSYLNKDLKNISNKIDSKLNPTSNGAGNNGNNNNTTNL

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Protein FYV4, mitochondrial
分子量 formula_weight	15321.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MIPSRISHKFPLFLRSSLAAPKAAYRFSSTIPKPSDQVPDVDAFLNKIGRNCNELKDTFENNWNNLFQWDSKILKEKGVNIQQRKYILKQVHNYRNNRPIHEIKLGKKSFFGGERKRKAFTAKWKAENKQ

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial
分子量 formula_weight	56450.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MPRKANLLKSLARGRVRTSFNKYNLFNLYKKGGVDLKSKSLYQQKWTAKQETRAYHGEHLTEKRWQTVFKPKLDSVAQLDASLRGGEIKETPFLLQTFAVLEKRLDFALFRAMFASSVRQARQFILHGNVRVNGVKIKHPSYTLKPGDMFSVKPDKVLEALGAKKPSFQEALKIDKTQIVLWNKYVKEAKTEPKEVWEKKLENFEKMSDSNPKKLQFQEFLRQYNKNLESQQYNALKGCTQEGILRKLLNVEKEIGKSNNEPLSIDELKQGLPEIQDSQLLESLNNAYQEFFKSGEIRREIISKCQPDELISLATEMMNPNETTKKELSDGAKSALRSGKRIIAESVKLWTKNITDHFKTRMSDISDGSLTFDPKWAKNLKYHDPIKLSELEGDEPKARKLINLPWQKNYVYGRQDPKKPFFTPWKPRPFLSPFAILPHHLEISFKTCHAVYLRDPVARPGQSEVISPFDVPVHERAYMYYLRNGK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S5, mitochondrial
分子量 formula_weight	34941.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MFKRQLSTSVRYLQHYDESLLSRYYPESLLKSIKLAQQTIPEDTKFRVSRNVEFAPPYLDDFTKIHPFWDYKPGMPHLHAQEENNNFSIFRWDQVQQPLPGEGNILPPGVSLPNDGGRKSKSADVAAGLHKQTGVDPDYITRKLTMKPLVMKRVSNQTGKGKIASFYALVVVGDKNGMVGLGEGKSREEMSKAIFKAHWDAVRNLKEIPRYENRTIYGDIDFRYHGVKLHLRSAKPGFGLRVNHVIFEICECAGIKDLSGKVYKSRNDMNIAKGTIEAFTKAQKTLDEVALGRGKKLVDVRKVYYSS

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	37S ribosomal protein MRP17, mitochondrial
分子量 formula_weight	15046.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MLYELIGLVRITNSNAPKLEAKELSSTIGKLIIQNRGVVRDIVPMGIRYLPKIMKKDQEKHFRAYHFLMLFDSSAAVQSEILRTLKKDPRVIRSSIVKVDLDKQLDRASSLHRSLGKKSILELVNEDYQSI

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S35, mitochondrial
分子量 formula_weight	39638.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MSYGLTGTSSKLRGTSSIFSWTQVRHFSRRRIAYPFYPFKKLGRQHPKKHDTNLKTAMRQFLGPKNYKGEYVMNKYFTVPTNHVPNYIKPDLERGQSLEHPVTKKPLQLRYDGTLGPPPVENKRLQNIFKDRLLQPFPSNPHCKTNYVLSPQLKQSIFEEITVEGLSAQQVSQKYGLKIPRVEAIVKLVSVENSWNRRNRVSSDLKTMDETLYRMFPVFDSDASFKRENLSEIPVPQKTLASRFLTIAESEPFGPVDAAHVLELEPAVETLRNLSTVGEHSSGHQQSTNKNTKVIYGELVEGERSQYKFTNAKVGKVGYRYGSGNRDNKKDRRIGFNKLGQMVYI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	37S ribosomal protein S8, mitochondrial
分子量 formula_weight	17496.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSLVKLANTCAHLQNCSKVRVALTSIPYTKLQLQFAYNLYQQGFLSSLQKGSTMGPDKDFVEVTPDNISTRRLWVGLKYRDNKPVLSSCKLISKPNSRIHLPMEDMKKLCSGVTIRNIKPLQPGELILVRAHNNIMDINEAISKKLDGEVLCRVK

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	15S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	549234.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	a

UUUUAUAUAAUAAUAAUAAUAUAUAUAUAUAUAUAUUAUUAUAUUAGUUAUAUAAUAAGGAAAAGUAAAAAAUUUAUAAGAAUAUGAUGUUGGUUCAGAUUAAGCGCUAAAUAAGGACAUGACACAUGCGAAUCAUACGUUUAUUAUUGAUAAGAUAAUAAAUAUGUGGUGUAAACGUGAGUAAUUUUAUUAGGAAUUAAUGAACUAUAGAAUAAGCUAAAUACUUAAUAUAUUAUUAUAUAAAAAUAAUUUAUAUAAUAAAAAGGAUAUAUAUAUAAUAUAUAUUUAUCUAUAGUCAAGCCAAUAAUGGUUUAGGUAGUAGGUUUAUUAAGAGUUAAACCUAGCCAACGAUCCAUAAUCGAUAAUGAAAGUUAGAACGAUCACGUUGACUCUGAAAUAUAGUCAAUAUCUAUAAGAUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGACAAUGAUCGAAAGAUUGAUCCAGUUACUUAUUAGGAUGAUAUAUAAAAAUAUUUUAUUUUAUUUAUAAAUAUUAAAUAUUUAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAUAUAUAUAUAAAUUGAUUAAAAAUAAAAUCCAUAAAUAAUUAAAAUAAUGAUAUUAAUUACCAUAUAUAUUUUUAUAUGGAUAUAUAUAUUAAUAAUAAUAUUAAUUUUAUUAUUAUUAAUAAUAUAUUUUAAUAGUCCUGACUAAUAUUUGUGCCAGCAGUCGCGGUAACACAAAGAGGGCGAGCGUUAAUCAUAAUGGUUUAAAGGAUCCGUAGAAUGAAUUAUAUAUUAUAAUUUAGAGUUAAUAAAAUAUAAUUAAAGAAUUAUAAUAGUAAAGAUGAAAUAAUAAUAAUAAUUAUAAGACUAAUAUAUGUGAAAAUAUUAAUUAAAUAUUAACUGACAUUGAGGGAUUAAAACUAGAGUAGCGAAACGGAUUCGAUACCCGUGUAGUUCUAGUAGUAAACUAUGAAUACAAUUAUUUAUAAUAUAUAUUAUAUAUAAAUAAUAAAUGAAAAUGAAAGUAUUCCACCUGAAGAGUACGUUAGCAAUAAUGAAACUCAAAACAAUAGACGGUUACAGACUUAAGCAGUGGAGCAUGUUAUUUAAUUCGAUAAUCCACGACUAACCUUACCAUAUUUUGAAUAUUAUAAUAAUUAUUAUAAUUAUUAUAUUACAGGCGUUACAUUGUUGUCUUUAGUUCGUGCUGCAAAGUUUUAGAUUAAGUUCAUAAACGAACAAAACUCCAUAUAUAUAAUUUUAAUUAUAUAUAAUUUUAUAUUAUUUAUUAAUAUAAAGAAAGGAAUUAAGACAAAUCAUAAUGAUCCUUAUAAUAUGGGUAAUAGACGUGCUAUAAUAAAAUGAUAAUAAAAUUAUAUAAAAUAUAUUUAAUUAUAUUUAAUUAAUAAUAUAAAACAUUUUAAUUUUUAAUAUAUUUUUUUAUUAUAUAUUAAUAUGAAUUAUAAUCUGAAAUUCGAUUAUAUGAAAAAAGAAUUGCUAGUAAUACGUAAAUUAGUAUGUUACGGUGAAUAUUCUAACUGUUUCGCACUAAUCACUCAUCACGCGUUGAAACAUAUUAUUAUCUUAUUAUUUAUAUAAUAUUUUUUAAUAAAUAUUAAUAAUUAUUAAUUUAUAUUUAUUUAUAUCAGAAAUAAUAUGAAUUAAUGCGAAGUUGAAAUACAGUUACCGUAGGGGAACCUGCGGUGGGCUUAUAAAUAUCUUAAAUAUUCUUACA

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	uS12m
分子量 formula_weight	16948.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MLSRFMSNTWCTPLRQAQRLFSSTTTMQATLNQIKRGSGPPRRKKISTAPQLDQCPQRKGVVLRVMVLKPKKPNSAQRKACRVRLTNGNVVSAYIPGEGHDAQEHSIVYVRGGRCQDLPGVKYHVIRGAGDLSGVVNRISSRSKYGAKKPSKS

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	29

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	8d8jF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	19720

Yeast mitochondrial small subunit assembly intermediate (State 1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable S-adenosyl-L-methionine-dependent RNA methyltransferase RSM22, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein MRP13, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial group I intron splicing factor CCM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein S28, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein S16, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein S17, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein RSM18, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein PET123, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein FYV4, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

37S ribosomal protein NAM9, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体