Beta-lactamase
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 22–284 | 突变:T235A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 无其他共同聚合物 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M SPG buffer pH 6, 25% (w/v) PEG 1500 | 分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8DP4 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4UA6 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase Apo Crystal Structure at 0.79 Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PO4 PHOSPHATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M potassium phosphate
|
分辨率 0.79 Å R-free 0.115 |
| 4UA6 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase Apo Crystal Structure at 0.79 Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PO4 PHOSPHATE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M potassium phosphate
|
分辨率 0.79 Å R-free 0.115 |
| 4UA7 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Non-Covalent Inhibitor at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3GK N-[3-(2H-tetrazol-5-yl)phenyl]-6-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.89 Å R-free 0.131 |
| 4UA7 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Non-Covalent Inhibitor at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3GK N-[3-(2H-tetrazol-5-yl)phenyl]-6-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.89 Å R-free 0.131 |
| 4UA9 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Boronic Acid Acylation Transition State Analog at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CB4 PINACOL[[2-AMINO-ALPHA-(1-CARBOXY-1-METHYLETHOXYIMINO)-4-THIAZOLEACETYL]AMINO]METHANEBORONATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.84 Å R-free 0.131 |
| 4UA9 CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Boronic Acid Acylation Transition State Analog at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CB4 PINACOL[[2-AMINO-ALPHA-(1-CARBOXY-1-METHYLETHOXYIMINO)-4-THIAZOLEACETYL]AMINO]METHANEBORONATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.84 Å R-free 0.131 |
| 4UAA CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Non-Covalent Inhibitor at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3GK N-[3-(2H-tetrazol-5-yl)phenyl]-6-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.86 Å R-free 0.134 |
| 4UAA CTX-M-14 Class A Beta-Lactamase in Complex with a Non-Covalent Inhibitor at Sub-Angstrom Resolution 提交 2014-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–284(262 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3GK N-[3-(2H-tetrazol-5-yl)phenyl]-6-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.0M Potassium Phosphate
|
分辨率 0.86 Å R-free 0.134 |
| 5TOP Atomic Resolution X-Ray Crystal Structure of a Ruthenocene Conjugated Beta-Lactam Antibiotic in Complex with CTX-M-14 S70G Beta-Lactamase 提交 2016-10-18 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
|
突变:S70G 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | K POTASSIUM ION × 1 JSE [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 RU RUTHENIUM ION × 1 JSC [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;293.15 K;potassium phosphate
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.146 |
| 5TOP Atomic Resolution X-Ray Crystal Structure of a Ruthenocene Conjugated Beta-Lactam Antibiotic in Complex with CTX-M-14 S70G Beta-Lactamase 提交 2016-10-18 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–284(263 aa)
|
突变:S70G 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | K POTASSIUM ION × 1 JSE [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 RU RUTHENIUM ION × 2 7G4 ruthenocene × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;293.15 K;potassium phosphate
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.146 |
| 5U53 CTX-M-14 E166A with acylated ceftazidime molecule 提交 2016-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 24-284
|
未记录 | CAZ ACYLATED CEFTAZIDIME × 1 NO3 NITRATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2M ammonium nitrate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.195 |
| 5VLE Ultrahigh Resolution X-Ray Crystal Structure of Ruthenocene Conjugated Penicilloate and Penilloate Products in Complex with CTX-M-14 E166A Beta-Lactamase 提交 2017-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 22-284
|
突变:E166A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | JSD [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 2 JSC [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 JSE [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 K POTASSIUM ION × 1 RU RUTHENIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;293.15 K;potassium phosphate
|
分辨率 0.85 Å |
| 5VLE Ultrahigh Resolution X-Ray Crystal Structure of Ruthenocene Conjugated Penicilloate and Penilloate Products in Complex with CTX-M-14 E166A Beta-Lactamase 提交 2017-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 22-284
|
突变:E166A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | JSD [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 JSE [(1,2,3,4,5-eta)-1-(4-{[carboxy(4-carboxy-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidin-2-yl)methyl]amino}-4-oxobutanoyl)cyclopentadienyl][(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl]ruthenium × 1 K POTASSIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;293.15 K;potassium phosphate
|
分辨率 0.85 Å |
| 6MIA Crystal structure of CTX-M-14 with compound 6 提交 2018-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
未记录 | 1CE 3-(1H-tetrazol-5-ylmethyl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4(3H)-one × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0 M potassium phosphate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.163 |
| 6MIA Crystal structure of CTX-M-14 with compound 6 提交 2018-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
23–284(262 aa)
|
未记录 | 1CE 3-(1H-tetrazol-5-ylmethyl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4(3H)-one × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0 M potassium phosphate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.163 |
| 7U70 Crystal Structure of CTX-M-14 with compound 2 提交 2022-03-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 23-284
|
未记录 | LW0 3-fluoro-N-[(1R,3S)-3-(1H-tetrazol-5-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0 M potassium phosphate
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.171 |
| 7U70 Crystal Structure of CTX-M-14 with compound 2 提交 2022-03-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 23-284
|
未记录 | LW0 3-fluoro-N-[(1R,3S)-3-(1H-tetrazol-5-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293 K;1.0 M potassium phosphate
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.171 |
| 7UON CTX-M-14 Y105W mutant 提交 2022-04-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
|
突变:Y105W | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;HEPES (0.1M), PEG 4,000 (25% w/v)
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.246 |
| 8DOD Beta-lactamase CTX-M-14 S130A 提交 2022-07-12 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
|
突变:S130A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 25% (W/V) PEG6000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.259 |
| 8DOE Crystal Structure of CTX-M-14 N106A 提交 2022-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
突变:N106A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M Magnesium chloride ,0.1 M Tris pH 8 20% (w/v), PEG 6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.165 |
| 8DON Beta-lactamase CTX-M-14 T215A 提交 2022-07-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
突变:T215A | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M Calcium chloride ,0.1 M HEPES pH 7, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.160 |
| 8DPQ Beta-lactamase CTX-M-14 N170A 提交 2022-07-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
23–284(262 aa)
|
突变:N170A | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M Sodium HEPES pH7.5, 25% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.233 |
| 8SJ3 Beta-lactamase CTX-M-14 E166Y/N170G 提交 2023-04-17 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–284(263 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;0.2 M ammonium chloride, 0.1 M sodium acetate, 20% w/v PEG 6,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 8SJ3 Beta-lactamase CTX-M-14 E166Y/N170G 提交 2023-04-17 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
22–284(263 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;0.2 M ammonium chloride, 0.1 M sodium acetate, 20% w/v PEG 6,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 9Q0A CTX-M-14 WT in complex with BLIP E73W 提交 2025-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
22–284(263 aa)
片段:UNP residues 22-284
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M calcium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.211 |
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| UniProt名称 | H6UQI0_ECOLX |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–263; UniProt 22–284 |