SAXSdb — 8ea0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic acetylcholine receptor M3

Homo sapiens

UniProt P20309

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 46–283 链 A； UniProt 464–590	未记录	IXO 4-(4,5-dihydro-1,2-oxazol-3-yloxy)-N,N,N-trimethylbut-2-yn-1-aminium × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.56 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8EA0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2CSA Structure of the M3 Muscarinic Acetylcholine Receptor Basolateral Sorting Signal 提交 2005-05-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 271–289（19 aa）片段：THIRD INTRACELLULAR LOOP (Residues:271-289)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.4；285 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.4；278 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.4；288 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.4；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.4；308 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.4；318 K；压力 ambient NMR样品组成 1-2mM M3 peptide, unlabeled, 50mM sodium phosphate buffer, 1mM EDTA, 1mM NaN3, 90% H2O, 10% D20 \| 90% H2O, 10% D20 NMR样品组成 1-2mM M3 peptide, unlabeled, 50mM sodium phosphate buffer, 1mM EDTA, 1mM NaN3, 99.9 % D20, 0.1% H20 \| 99.9 % D20, 0.1% H20	分辨率未提供
8E9W CryoEM structure of miniGq-coupled hM3Dq in complex with DCZ 提交 2022-08-27	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 46–283（238 aa）链 A 464–590（127 aa）	突变：Y149C, A239G 突变：Y149C, A239G	WEC 11-(4-methylpiperazin-1-yl)-5H-dibenzo[b,e][1,4]diazepine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.69 Å
8E9Y CryoEM structure of miniGq-coupled hM3Dq in complex with CNO 提交 2022-08-27	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 46–283（238 aa）链 A 464–590（127 aa）	未记录	WE9 8-chloro-11-(4-methyl-4-oxo-4lambda~5~-piperazin-1-yl)-5H-dibenzo[b,e][1,4]diazepine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.79 Å
8E9Z CryoEM structure of miniGq-coupled hM3R in complex with Iperoxo 提交 2022-08-27	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 46–283（238 aa）链 A 464–590（127 aa）	未记录	IXO 4-(4,5-dihydro-1,2-oxazol-3-yloxy)-N,N,N-trimethylbut-2-yn-1-aminium × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.69 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACM3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–238； UniProt 46–283 作者链 A； PDB构建体 239–365； UniProt 464–590

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ea0
沉积日期 deposition_date	2022-08-27
结构标题 title	CryoEM structure of miniGq-coupled hM3R in complex with iperoxo (local refinement)
关键词 keywords	GPCR, IXO, active state, MEMBRANE PROTEIN, hM3R, Iperoxo; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.59 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.48 Å
零角强度 I(0) i0	14747800.00
分子量 molecular_weight	32416.0 kDa
排除体积 excluded_volume	42112 Å³
包络体积 envelope_volume	49365 Å³
水化壳体积 shell_volume	20416 Å³
包络直径 envelope_diameter	71.6 Å
壳层 Rg shell_rg	26.94 Å
包络 Rg envelope_rg	21.03 Å
形状 Rg shape_rg	20.46 Å
总 Rg total_rg	21.59 Å
总原子数 total_atoms	2286
残基数 n_residues	285
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	71.7 Å
Rg (实空间) rg_real	21.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4750e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9970e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	14750000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8837
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.352
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.376
角度范围 angular_range	— – 0.3700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2107000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.841; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.987

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Muscarinic acetylcholine receptor M3
分子量 formula_weight	62966.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2286

AGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQALGGSGGGGSGGSSSGGGGSGGGGSGGSSSGGVFTLEDFVGDWEQTAAYNLDQVLEQGGVSSLLQNLAVSVTPIQRIVRSGENALKIDIHVIIPYEGLSADQMAQIEEVFKVVYPVDDHHFKVILPYGTLVIDGVTPNMLNYFGRPYEGIAVFDGKKITVTGTLWNGNKIIDERLITPDGSMLFRVTINSGGSGGHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	4-(4,5-dihydro-1,2-oxazol-3-yloxy)-N,N,N-trimethylbut-2-yn-1-aminium
分子量 formula_weight	197.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子量 formula_weight	486.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	8ea0A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.56 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	591814

fit	/app/data/saxs_computation/ea/8ea0/8ea0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ea/8ea0/8ea0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ea/8ea0/8ea0.dat

CryoEM structure of miniGq-coupled hM3R in complex with iperoxo (local refinement)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic acetylcholine receptor M3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D