8f9d

Compound 21 bound to procaspase-6

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 102.3 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8f9d

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8f9d
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8f9d
沉积日期 deposition_date2022-11-23
结构标题 titleCompound 21 bound to procaspase-6
关键词 keywordsinhibitor, procaspase-6, protease, APOPTOSIS, HYDROLASE-INHIBITOR complex; APOPTOSIS,HYDROLASE/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier31.24
回转半径 Rg (电子) rg_electron30.07
零角强度 I(0) i0204052000.00
分子量 molecular_weight114320.0 kDa
排除体积 excluded_volume143150 ų
包络体积 envelope_volume175900 ų
水化壳体积 shell_volume46354 ų
包络直径 envelope_diameter110.5
壳层 Rg shell_rg39.17
包络 Rg envelope_rg30.02
形状 Rg shape_rg30.04
总 Rg total_rg30.94
总原子数 total_atoms8043
残基数 n_residues991
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax102.3
Rg (实空间) rg_real31.08
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.81
I(0) (实空间) i0_real2.0410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2190e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal31.15
I(0) (倒空间) i0_reciprocal204100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8906
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary40.1
偏度 Skewness skewness0.178
峰度 Kurtosis kurtosis-0.443
角度范围 angular_range— – 0.2550 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha41110000.0000
实空间数据点数 n_real_points52
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.859; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.996

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)