Isoform 2 of Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 266–542 | 未记录 | L1N 4-[(~{E})-(7-oxidanyl-6~{H}-pyrrolo[2,3-g][1,3]benzothiazol-8-yl)methylideneamino]-~{N}-pyridin-2-yl-benzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MOPS pH 7.0, 18% PEG 3350, 5% Glycerol, 5 mM TCEP | 分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 B； UniProt 266–542 | 未记录 | L1N 4-[(~{E})-(7-oxidanyl-6~{H}-pyrrolo[2,3-g][1,3]benzothiazol-8-yl)methylideneamino]-~{N}-pyridin-2-yl-benzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MOPS pH 7.0, 18% PEG 3350, 5% Glycerol, 5 mM TCEP | 分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8HAQ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A07 C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-MALONYL TYR-GLU-(N,N-DIPENTYL AMINE) 提交 1997-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M MES, PH 6.5, 0.05 M CSCL, 30% JEFFAMINE M-600 AT 4 DEGREES C., pH 8.0, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å |
| 1A08 C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-DIFLUORO PHOSPHOTYR-GLU-(N,N-DIPENTYL AMINE) 提交 1997-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6, 2.1 M AMMONIUM SULFATE AT 4 C., temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å |
| 1A08 C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-DIFLUORO PHOSPHOTYR-GLU-(N,N-DIPENTYL AMINE) 提交 1997-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6, 2.1 M AMMONIUM SULFATE AT 4 C., temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å |
| 1A09 C-src (SH2 domain) complexed with ace-formyl phosphotyr-glu-(n,n-dipentyl amine) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6, 2 M NAFORMATE AT 4 C. THE CRYSTAL WAS SOAKED IN 10% PEG400, 10% GLYCEROL PRIOR TO DATA COLLECTION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1A09 C-src (SH2 domain) complexed with ace-formyl phosphotyr-glu-(n,n-dipentyl amine) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6, 2 M NAFORMATE AT 4 C. THE CRYSTAL WAS SOAKED IN 10% PEG400, 10% GLYCEROL PRIOR TO DATA COLLECTION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1A09 C-src (SH2 domain) complexed with ace-formyl phosphotyr-glu-(n,n-dipentyl amine) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6, 2 M NAFORMATE AT 4 C. THE CRYSTAL WAS SOAKED IN 10% PEG400, 10% GLYCEROL PRIOR TO DATA COLLECTION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1A1A C-SRC (SH2 DOMAIN WITH C188A MUTATION) COMPLEXED WITH ACE-FORMYL PHOSPHOTYR-GLU-(N,N-DIPENTYL AMINE) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
突变：C188S 突变：C188S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.0 M LI2SO4, 2% PEG8000 AT 4C. THE CRYSTAL WAS SOAKED IN 25% GLYCEROL PRIOR TO DATA COLLECTION., pH 8.0, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1A1B C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-PHOSPHOTYR-GLU-(N,N-DIPENTYL AMINE) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 2M AMMONIUM SULFATE AT 4 DEGREES C., pH 8.0, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å |
| 1A1C C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-PHOSPHOTYR-GLU-(N-ME(-(CH2)3-CYCLOPENTYL)) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6；295 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1 M ACETATE, PH 4.6,2M AMMONIUM SULFATE AT 22 C., temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å |
| 1A1E C-SRC (SH2 DOMAIN) COMPLEXED WITH ACE-PHOSPHOTYR-GLU-(3-BUTYLPIPERIDINE) 提交 1997-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
链 B
143–248（106 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8；295 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 2M AMMONIUM SULFATE AT 22 DEGREES C., pH 8.0, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å |
| 1FMK CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TYROSINE-PROTEIN KINASE C-SRC 提交 1997-01-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
85–535（451 aa）
片段：RESIDUES 86-836, CONTAINING SH2, SH3, KINASE 2 DOMAINS AND C-TERMINAL TAIL
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.264 |
| 1HCS NMR STRUCTURE OF THE HUMAN SRC SH2 DOMAIN COMPLEX 提交 1994-09-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
143–248（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1HCT NMR STRUCTURE OF THE HUMAN SRC SH2 DOMAIN COMPLEX 提交 1994-09-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
143–248（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1KSW Structure of Human c-Src Tyrosine Kinase (Thr338Gly Mutant) in Complex with N6-benzyl ADP 提交 2002-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
85–535（451 aa）
片段：SH3, SH2 and Kinase domains
|
突变：T338G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NBS N6-BENZYL ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；12% PEG 4000, 50mM PIPES pH 6.5, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.294 |
| 1O41 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU78300. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 300 2-FORMYL-6-METHOXYPHENYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O42 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU81843. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 843 N-ACETYL-N-[1-(1,1'-BIPHENYL-4-YLMETHYL)-2-OXOAZEPAN-3-YL]-O-PHOSPHONOTYROSINAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O43 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU82129. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 821 [4-((1Z)-2-(ACETYLAMINO)-3-{[1-(1,1'-BIPHENYL-4-YLMETHYL)-2-OXOAZEPAN-3-YL]AMINO}-3-OXOPROP-1-ENYL)-2-FORMYLPHENYL]ACET IC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.50 Å |
| 1O44 Crystal structure of sh2 in complex with ru85052 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 852 2-{4-[2-ACETYLAMINO-2-(1-BIPHENYL-4-YLMETHYL-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL)-ETHYL]-2-CARBOXY-PHENYL}-MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O45 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU84687. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 687 N-ACETYL-N-[1-(1,1'-BIPHENYL-4-YLMETHYL)-2-OXOAZEPAN-3-YL]-3-FORMYL-O-PHOSPHONOTYROSINAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.80 Å |
| 1O46 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU90395. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 903 2-{4-[2-ACETYLAMINO-2-(1-BIPHENYL-4-YLMETHYL-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL)-ETHYL]-2-METHOXYCARBONYL-PHENYL}-2-FLUORO-MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 2.00 Å |
| 1O47 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU82209. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 822 N-ACETYL-N-[1-(1,1'-BIPHENYL-4-YLMETHYL)-2-OXOAZEPAN-3-YL]-4-[DIFLUORO(PHOSPHONO)METHYL]PHENYLALANINAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.80 Å |
| 1O48 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU85053. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 853 5-[2-ACETYLAMINO-2-(1-BIPHENYL-4-YLMETHYL-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL)-ETHYL]-2-CARBOXYMETHYL-BENZOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.55 Å |
| 1O49 CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU85493. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 493 {4-[2-ACETYLAMINO-2-(1-BIPHENYL-4-YLMETHYL-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL)-ETHYL]-2-PHOSPHONO-PHENOXY}-ACETIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O4A CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU82197. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 197 4-[2-ACETYLAMINO-2-(1-BIPHENYL-4-YLMETHYL-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL)-ETHYL]-2-FORMYL-BENZOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.50 Å |
| 1O4B CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU83876. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 876 N-ACETYL-N-[1-(1,1'-BIPHENYL-4-YLMETHYL)-2-OXOAZEPAN-3-YL]-3,4-DIPHOSPHONOPHENYLALANINAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.85 Å |
| 1O4C CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH PHOSPHATE. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.80 Å |
| 1O4D CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU78262. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 262 2-FORMYLPHENYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.85 Å |
| 1O4E CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU78299. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 299 2,6-DIFORMYL-4-METHYLPHENYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 2.00 Å |
| 1O4F CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU79073. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 790 1,2,3,4-TETRAHYDROQUINOLIN-8-YL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 2.00 Å |
| 1O4G CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH DPI59. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | I59 HYDROXY(1-NAPHTHYL)METHYLPHOSPHONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.55 Å |
| 1O4H CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU79072. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 772 2-CYANOQUINOLIN-8-YL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 2.25 Å |
| 1O4I CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH PAS219. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 219 cyclohexylmethyl 2-formylphenyl hydrogen (S)-phosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.75 Å |
| 1O4J CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH ISO24. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | IS2 [(4-ETHYLPHENYL)AMINO]CARBONYLPHOSPHONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O4K CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH PASBN. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | PSN BENZYL 2-FORMYLPHENYL HYDROGEN PHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.57 Å |
| 1O4L CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH FRAGMENT2. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.65 Å |
| 1O4M CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH MALONICACID. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | MLA MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.60 Å |
| 1O4N CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH OXALIC ACID. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | OXD OXALIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.60 Å |
| 1O4O CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH PHENYLPHOSPHATE. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | HPS PHENYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O4P CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU78791. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 791 2-PHENYLMALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.90 Å |
| 1O4Q CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU79256. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 256 PHENYL(SULFO)ACETIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.70 Å |
| 1O4R CRYSTAL STRUCTURE OF SH2 IN COMPLEX WITH RU78783. 提交 2003-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–251（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 787 (PHENYL-PHOSPHONO-METHYL)-PHOSPHONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.50 Å |
| 1SHD PEPTIDE INHIBITORS OF SRC SH3-SH2-PHOSPHOPROTEIN INTERACTIONS 提交 1994-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
143–248（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1Y57 Structure of unphosphorylated c-Src in complex with an inhibitor 提交 2004-12-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
86–536（451 aa）
片段：SH3 SH2 and KINASE domains
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MPZ 4-[(4-METHYLPIPERAZIN-1-YL)METHYL]-N-{3-[(4-PYRIDIN-3-YLPYRIMIDIN-2-YL)AMINO]PHENYL}BENZAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium sulfate, tris, glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.213 |
| 1YI6 C-term tail segment of human tyrosine kinase (258-533) 提交 2005-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
260–535（276 aa）
片段：residues 258-533
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 6000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1YI6 C-term tail segment of human tyrosine kinase (258-533) 提交 2005-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
260–535（276 aa）
片段：residues 258-533
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 6000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1YOJ Crystal structure of Src kinase domain 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
253–535（283 aa）
片段：Src kinase domain
|
突变：S344N, A369S, Y418W | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 1YOJ Crystal structure of Src kinase domain 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
253–535（283 aa）
片段：Src kinase domain
|
突变：S344N, A369S, Y418W | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 1YOL Crystal structure of Src kinase domain in complex with CGP77675 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
253–535（283 aa）
片段：SRC KINASE DOMAIN
|
突变：S344N, A369S | S03 1-{4-[4-AMINO-5-(3-METHOXYPHENYL)-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL]BENZYL}PIPERIDIN-4-OL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 1YOL Crystal structure of Src kinase domain in complex with CGP77675 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
253–535（283 aa）
片段：SRC KINASE DOMAIN
|
突变：S344N, A369S | S03 1-{4-[4-AMINO-5-(3-METHOXYPHENYL)-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL]BENZYL}PIPERIDIN-4-OL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 1YOM Crystal structure of Src kinase domain in complex with Purvalanol A 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
253–535（283 aa）
片段：Src kinase domain
|
突变：S344N, A369S, Y418W | P01 2-({6-[(3-CHLOROPHENYL)AMINO]-9-ISOPROPYL-9H-PURIN-2-YL}AMINO)-3-METHYLBUTAN-1-OL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 1YOM Crystal structure of Src kinase domain in complex with Purvalanol A 提交 2005-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
253–535（283 aa）
片段：Src kinase domain
|
突变：S344N, A369S, Y418W | P01 2-({6-[(3-CHLOROPHENYL)AMINO]-9-ISOPROPYL-9H-PURIN-2-YL}AMINO)-3-METHYLBUTAN-1-OL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；20% ethylene glycol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 2BDF Src kinase in complex with inhibitor AP23451 提交 2005-10-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
257–535（279 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | 24A {[(4-{[2-(4-AMINOCYCLOHEXYL)-9-ETHYL-9H-PURIN-6-YL]AMINO}PHENYL)(HYDROXY)PHOSPHORYL]METHYL}PHOSPHONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；15% PEG400, 50mM NaCl, 100mM HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 2BDF Src kinase in complex with inhibitor AP23451 提交 2005-10-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
257–535（279 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | 24A {[(4-{[2-(4-AMINOCYCLOHEXYL)-9-ETHYL-9H-PURIN-6-YL]AMINO}PHENYL)(HYDROXY)PHOSPHORYL]METHYL}PHOSPHONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；15% PEG400, 50mM NaCl, 100mM HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 2BDJ Src kinase in complex with inhibitor AP23464 提交 2005-10-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
257–535（279 aa）
片段：kinase domain
|
未记录 | HET 3-[2-(2-CYCLOPENTYL-6-{[4-(DIMETHYLPHOSPHORYL)PHENYL]AMINO}-9H-PURIN-9-YL)ETHYL]PHENOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；20% PEG3350, 200mM NH4NO3, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 2H8H Src kinase in complex with a quinazoline inhibitor 提交 2006-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–535（535 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | H8H N-(5-CHLORO-1,3-BENZODIOXOL-4-YL)-7-[2-(4-METHYLPIPERAZIN-1-YL)ETHOXY]-5-(TETRAHYDRO-2H-PYRAN-4-YLOXY)QUINAZOLIN-4-AMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；288 K；50 mM PIPES pH 6.5, 10 mM DTT, 100 mM sodium chloride and 4 to 9% PEG4000 (w/v), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.272 |
| 2SRC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TYROSINE-PROTEIN KINASE C-SRC, IN COMPLEX WITH AMP-PNP 提交 1998-12-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
85–535（451 aa）
片段：RESIDUES 86-836, CONTAINING SH2, SH3, KINASE 2 DOMAINS AND C-TERMINAL TAIL
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.281 |
| 3VRO Crystal structure of the tyrosine kinase binding domain of Cbl-c in complex with phospho-Src peptide 提交 2012-04-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
412–424（13 aa）
片段：phospho-Src peptide, residues 412-424
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10% PEG3350, 0.1M ammonium formate, 0.1M NDSB-201, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 3ZMP Src-derived peptide inhibitor complex of PTP1B 提交 2013-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
527–536（10 aa）
片段：RESIDUES 527-536
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
0.2M MGCL2, 27.14W/V% PEG3350, 0.1M HEPES, PH=7.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.271 |
| 3ZMP Src-derived peptide inhibitor complex of PTP1B 提交 2013-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
527–536（10 aa）
片段：RESIDUES 527-536
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
0.2M MGCL2, 27.14W/V% PEG3350, 0.1M HEPES, PH=7.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.271 |
| 3ZMQ Src-derived mutant peptide inhibitor complex of PTP1B 提交 2013-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
527–536（10 aa）
片段：PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE SRC RESIDUES 527-536
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
0.2M MGCL2, 0.1M TRIS-HCL, PH=8.5 30% (W/V)POLYETHYLENE GLYCOL 4000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.304 |
| 4F59 Triple mutant Src SH2 domain 提交 2012-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–252（109 aa）
片段：SH2 domain
|
突变：T183V/C188A/K206L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M Tris-HCl, 18% PEG6000, 0.2 M lithium chloride, pH 7.6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.246 |
| 4F5A Triple mutant Src SH2 domain bound to phosphate ion 提交 2012-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–252（109 aa）
片段：SH2 domain
|
突变：T183V/C188A/K206L | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M Tris-HCl, 18% PEG6000, 0.2 M lithium chloride, pH 7.6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 4F5B Triple mutant Src SH2 domain bound to phosphotyrosine 提交 2012-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
144–252（109 aa）
片段：SH2 domain
|
突变：T183V/C188A/K206L | PTR O-PHOSPHOTYROSINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M Tris-HCl, 18% PEG6000, 0.2 M lithium chloride, pH 7.6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.230 |
| 4HXJ Crystal structure of SH3:RGT complex 提交 2012-11-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
87–144（58 aa）
片段：human c-Src SH3 domain, UNP residues 87-144
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；100mM Tris, pH 8.0, 1.3M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 4HXJ Crystal structure of SH3:RGT complex 提交 2012-11-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
87–144（58 aa）
片段：human c-Src SH3 domain, UNP residues 87-144
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；100mM Tris, pH 8.0, 1.3M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 4K11 The structure of 1NA in complex with Src T338G 提交 2013-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
87–534（448 aa）
片段：UNP residues 87-534
|
突变：T338G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0J9 1-tert-butyl-3-(naphthalen-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；50 mM PIPES, pH 6.5, 12% PEG4000, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.246 |
| 4MXO human Src kinase bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
未记录 | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 4MXO human Src kinase bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
未记录 | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 4MXX Human Src A403T mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：A403T | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M Ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.276 |
| 4MXX Human Src A403T mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：A403T | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M Ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.276 |
| 4MXY Src M314L T338M double mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：M314L T338M | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.266 |
| 4MXY Src M314L T338M double mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：M314L T338M | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.266 |
| 4MXZ Src M314L T338M double mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：M314L, T338M | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.266 |
| 4MXZ Src M314L T338M double mutant bound to kinase inhibitor bosutinib 提交 2013-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
254–536（283 aa）
片段：Kinase domain, UNP residues 254-536
|
突变：M314L, T338M | DB8 4-[(2,4-dichloro-5-methoxyphenyl)amino]-6-methoxy-7-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]quinoline-3-carbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0-4% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.266 |
| 6ATE SRC kinase bound to covalent inhibitor 提交 2017-08-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
|
未记录 | 6H3 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, pH 6.5, 16%-20% PEG 3350, 350 mM - 420mM NaOAc
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.228 |
| 6C4S Human cSrc SH3 Domain in complex with Choline Kinase fragment 60-69 提交 2018-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
87–144（58 aa）
片段：SH3 domain residues 87-144
链 B
87–144（58 aa）
片段：SH3 domain residues 87-144
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5
10% v/v Isopropanol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.226 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 6E6E DGY-06-116, a novel and selective covalent inhibitor of SRC kinase 提交 2018-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
261–536（276 aa）
|
未记录 | HVY N-(2-chloro-6-methylphenyl)-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-4-{[2-(propanoylamino)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Magnesium Formate Dihydrate; 15% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.285 |
| 7NG7 Src kinase bound to eCF506 trapped in inactive conformation 提交 2021-02-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UCW tert-butyl (4-(4-amino-1-(2-(4-(dimethylamino)piperidin-1-yl)ethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-2-methoxyphenyl)carbamate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；6% PEG3350, 300mM Ammonium acetate, 0.1M HEPES pH7.5, 10mM TCEP
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.213 |
| 7OTE Src Kinase Domain in complex with ponatinib 提交 2021-06-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
254–536（283 aa）
|
未记录 | 0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；Tris 20 mM pH 8, 150 mM Sodium chloride, 1 mM DTT, 2-propanol and PEG 4.000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.252 |
| 7OTE Src Kinase Domain in complex with ponatinib 提交 2021-06-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
254–536（283 aa）
|
未记录 | 0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 1 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；Tris 20 mM pH 8, 150 mM Sodium chloride, 1 mM DTT, 2-propanol and PEG 4.000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.252 |
| 7T1U Crystal structure of a superbinder Src SH2 domain (sSrcF) in complex with a high affinity phosphopeptide 提交 2021-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
147–251（105 aa）
片段：SH2 domain
|
突变：Residues 180 to 188 mutated from SETTKGAYC to GQSQPDYV and K206I (numbered as residue 205 in these coordinates) | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；80 uM Zinc Acetate, 12% PEG3350, 100 mM Sodium Acetate (pH 4.0), and 2% 1,3-butanediol
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.270 |
| 7T1U Crystal structure of a superbinder Src SH2 domain (sSrcF) in complex with a high affinity phosphopeptide 提交 2021-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
147–251（105 aa）
片段：SH2 domain
|
突变：Residues 180 to 188 mutated from SETTKGAYC to GQSQPDYV and K206I (numbered as residue 205 in these coordinates) | ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；80 uM Zinc Acetate, 12% PEG3350, 100 mM Sodium Acetate (pH 4.0), and 2% 1,3-butanediol
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.270 |
| 7YQE Structure of human SRC regulatory domains in complex with the C-terminal PRRP motifs of GPR54. 提交 2022-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
85–247（163 aa）
|
突变：C338S,C340S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1% v/v 1,4 Dioxane, 0.1 M Tris pH 7.5, 12.5% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.295 |
| 7YQE Structure of human SRC regulatory domains in complex with the C-terminal PRRP motifs of GPR54. 提交 2022-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
85–247（163 aa）
|
突变：C338S,C340S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1% v/v 1,4 Dioxane, 0.1 M Tris pH 7.5, 12.5% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.295 |
| 8JF3 C-Src in complex with compound 9 提交 2023-05-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
254–536（283 aa）
链 B
254–536（283 aa）
|
未记录 | C0N 2-[4-[4-[bis(oxidanylidene)-$l^5-sulfanyl]oxyphenyl]carbonylpiperazin-1-yl]-6-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]-N-prop-2-ynyl-pyrimidine-4-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM Sodium Acetate, 0.1 M MES pH 7.5, 4% PEG3350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.317 |
| 8JN8 Crystal structure of c-Src in complex with covalent inhibitor DC-Srci-6668 提交 2023-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–536（536 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JA6 (2R)-N-cyclopentyl-2-[cyclopropyl(ethanoyl)amino]-2-(4-fluorophenyl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M tri-Lithium citrate, 20%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 8JN9 Crystal structure of c-Src in complex with covalent inhibitor LW-Srci-8 提交 2023-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–536（536 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UJ0 N-[(1R)-1-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-2-(cyclopentylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-N-cyclopropyl-prop-2-enamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M tri-Lithium citrate, 20%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.279 |
| 8VCF Crystal structure of Superbinder Src SH2 domain with Cysteine to Serine mutations 提交 2023-12-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
161–268（108 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP, TEMPERATURE 290K
0.2 M Ammonium Fluoride, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.177 |
| 8VCG Mutant Src SH2 domain in complex with phosphotyrosine 提交 2023-12-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
161–267（107 aa）
片段：SH2 DOMAIN
|
未记录 | PTR O-PHOSPHOTYROSINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；VAPOR DIFFUSION,
SITTING DROP, TEMPERATURE 290K
0.2 M Ammonium Fluoride, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.176 |
| 9IRL Crystal structure analysis of LW-Srci-2o in complex with c-Src. 提交 2024-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
86–536（451 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1L20 (2~{R})-2-[3,5-bis(fluoranyl)phenyl]-2-[2-chloranylethanoyl(cyclopropyl)amino]-~{N}-cyclopentyl-ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, Hepes 7.4
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.243 |
| 9NS0 Ground state of Src kinase domain 提交 2025-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
251–536（286 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500；压力 1
NMR样品组成
250 uM [U-15N; U-2H] ILVMAT CH3 FY CEHE Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, 25 mM potassium chloride, 500 mM sodium chloride, 3 mM BME, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
250 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, 25 mM potassium chloride, 500 mM sodium chloride, 3 mM BME, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9NS1 Intermediate state of Src kinase domain 提交 2025-03-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
251–536（286 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）500；压力 1
NMR样品组成
250 uM [U-13C; U-15N; U-2H] SrcA311I kinase, 25 mM potassium chloride, 500 mM sodium chloride, 3 mM BME, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
250 uM [U-15N; U-2H] ILVMAT CH3 FY CEHE SrcA311I kinase, 25 mM potassium chloride, 500 mM sodium chloride, 3 mM BME, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9OFX Crystal structure of c-Src SH3 domain in H32 space group mediated by nickel 提交 2025-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
85–143（59 aa）
片段：c-Src SH3 domain
链 B
85–143（59 aa）
片段：c-Src SH3 domain
链 C
85–143（59 aa）
片段：c-Src SH3 domain
链 D
85–143（59 aa）
片段：c-Src SH3 domain
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1.7 M Ammonium Sulfate, 5 mM NiCl2, 10% glycerol, 0.1 M HEPES pH 7.5
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分辨率 1.45 Å R-free 0.196 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | SRC_HUMAN |
| Isoform | P12931-2 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–277； UniProt 266–542 作者链 B； PDB构建体 1–277； UniProt 266–542 |
