SAXSdb — 8hrx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium/bile acid cotransporter

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	PreS1 protein (Fragment) × 1 （Q6RXR5） Fab heavy chain from antibody IgG clone number YN9048 × 1 Fab light chain from antibody IgG clone number YN9048 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NTCP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–319； UniProt 1–319

PreS1 protein (Fragment)

Hepatitis B virus

UniProt Q6RXR5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Sodium/bile acid cotransporter × 1 （Q14973） Fab heavy chain from antibody IgG clone number YN9048 × 1 Fab light chain from antibody IgG clone number YN9048 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6RXR5_HBV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–47； UniProt 2–48

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8hrx
沉积日期 deposition_date	2022-12-16
结构标题 title	Cryo-EM structure of human NTCP-myr-preS1-YN9048Fab complex
关键词 keywords	hepatitis, HBV, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8hrx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8hrx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8hrx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.49 Å
Rg（电子密度）	36.98 Å
总 Rg	37.39 Å
原子数	6013
残基数	780
排除体积	108270 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8hrx__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Sodium/bile acid cotransporter
分子量 formula_weight	38198.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6013

MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIENLYFQGDYKDDDDKHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PreS1 protein (Fragment)
分子量 formula_weight	6229.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GTNLSVPNPLGFFPDHQLDPAFKANSENPDWDLNPHKDNWPDANKVGDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Hepatitis B virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10407
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fab heavy chain from antibody IgG clone number YN9048
分子量 formula_weight	26410.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EVQLQESGPELVKPGDSVKMSCKASGYTFTDYYMDWVKQNHGKSLEWIGYIYPYNGGTNYNQKFKGKATLTVDKSSSTAYMELHSLTSEDSAVYYCARRGRFPWLAYWGQGTLVTVSAAKTTPPSVYPLAPGCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPESVTVTWNSGSLSSSVHTFPALLQSGLYTMSSSVTVPSSTWPSQTVTCSVAHPASSTTVDKKLEPSGPISTINPCPPCKECHKCPAPNLEGGPS

来源 Source

来源生物 organism	Ondatra zibethicus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10060
宿主生物 host_organism	Mus musculus

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Fab light chain from antibody IgG clone number YN9048
分子量 formula_weight	23831.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

DIVMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLNWYQQKPDGTVRVLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDFSLTISNLEPEDIATYYCQQYSKFPWTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

来源 Source

来源生物 organism	Ondatra zibethicus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10060
宿主生物 host_organism	Mus musculus

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.89 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	103000

Cryo-EM structure of human NTCP-myr-preS1-YN9048Fab complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium/bile acid cotransporter

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PreS1 protein (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8hrx__assembly_1__model_1

8hrx__assembly_1__model_1 | I(q)

8hrx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of human NTCP-myr-preS1-YN9048Fab complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium/bile acid cotransporter

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PreS1 protein (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8hrx__assembly_1__model_1

8hrx__assembly_1__model_1 | I(q)

8hrx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)