SAXSdb — 8ilx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MCherry fluorescent protein

Anaplasma marginale

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	LAM3 × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	LAM3 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	X5DSL3_ANAMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–235； UniProt 1–236 作者链 B； PDB构建体 2–235； UniProt 1–236

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ilx
沉积日期 deposition_date	2023-03-05
结构标题 title	mCherry-LaM3 complex
关键词 keywords	PROTEIN BINDING, FLUORESCENT PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; FLUORESCENT PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ilx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ilx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ilx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.82 Å
Rg（电子密度）	20.86 Å
总 Rg	21.71 Å
原子数	2514
残基数	336
排除体积	44309 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ilx__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8ilx__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MCherry fluorescent protein
分子量 formula_weight	26797.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5076

GMVSKGEEDNMAIIKEFMRFKVHMEGSVNGHEFEIEGEGEGRPYEGTQTAKLKVTKGGPLPFAWDILSPQFXSKAYVKHPADIPDYLKLSFPEGFKWERVMNFEDGGVVTVTQDSSLQDGEFIYKVKLRGTNFPSDGPVMQKKTMGWEASSERMYPEDGALKGEIKQRLKLKDGGHYDAEVKTTYKAKKPVQLPGAYNVNIKLDITSHNEDYTIVEQYERAEGRHSTGGMDELYK

来源 Source

来源生物 organism	Anaplasma marginale
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	770
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	LAM3
分子量 formula_weight	14303.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GSAQVQLVQSGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDIAVGWFRQTPGKEREFVAAISWSGLIINYGDSVEDRFTISRDNAKSAVYLQMNSLKPEDTAVYYCAARIGMNYYYAREIEYPYWGQGTQVTVSKCY

来源 Source

来源生物 organism	Camelus bactrianus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9837
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	8ilxA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	8ilxB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	8ilxC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8ilxD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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晶胞边长 a length_a	134.867 Å
晶胞边长 b length_b	104.831 Å
晶胞边长 c length_c	68.508 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	102.83 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.290 Å
最低分辨率 resolution_low	66.800 Å
R 因子 r_factor	0.2661
R_work r_work	0.2638
R_free r_free	0.3119

mCherry-LaM3 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MCherry fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ilx__assembly_1__model_1

8ilx__assembly_1__model_1 | I(q)

8ilx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

mCherry-LaM3 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MCherry fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ilx__assembly_1__model_1

8ilx__assembly_1__model_1 | I(q)

8ilx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)