SAXSdb — 8oij

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein Smaug

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Protein smoothened × 2 （P91682） 1,2-ETHANEDIOL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMG_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 13–95； UniProt 73–155 作者链 A； PDB构建体 96–177； UniProt 197–278 作者链 B； PDB构建体 13–95； UniProt 73–155 作者链 B； PDB构建体 96–177； UniProt 197–278

Protein smoothened

Drosophila melanogaster

UniProt P91682

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Protein Smaug × 2 （Q23972） 1,2-ETHANEDIOL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMO_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–35； UniProt 970–1003 作者链 D； PDB构建体 2–35； UniProt 970–1003

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8oij
沉积日期 deposition_date	2023-03-23
结构标题 title	Drosophila Smaug-Smoothened complex
关键词 keywords	translation repressor, Hedgehog signaling, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8oij__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8oij__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8oij__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.38 Å
Rg（电子密度）	22.64 Å
总 Rg	23.50 Å
原子数	2852
残基数	350
排除体积	51067 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8oij__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein Smaug
分子量 formula_weight	19964.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2946

GGSGGSGGSGGSLFCEQVTTVTNLFEKWNDCERTVVMYALLKRLRYPSLKFLQYSIDSNLTQNLGTSQTNLSSVVIDINANNPVYLQNLLNAYKTARKEDILHEVLNMLPLLKPGNEEAKLIYLTLIPVAVKDTMQQIVPTELVQQIFSYLLIHPAITSEDRRSLNIWLRHLEDHIQ

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein smoothened
分子量 formula_weight	3816.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

SVPSYGEDELQQAMRLLNAASRQRTEAANEDFGGT

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	94

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晶胞边长 a length_a	76.590 Å
晶胞边长 b length_b	76.590 Å
晶胞边长 c length_c	268.470 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	hexagonal

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	64.390 Å
R 因子 r_factor	0.2737
R_work r_work	0.2719
R_free r_free	0.2925

Drosophila Smaug-Smoothened complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein Smaug

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein smoothened

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8oij__assembly_1__model_1

8oij__assembly_1__model_1 | I(q)

8oij__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (2)

Drosophila Smaug-Smoothened complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein Smaug

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein smoothened

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8oij__assembly_1__model_1

8oij__assembly_1__model_1 | I(q)

8oij__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (2)