8p1w

Crystal structure of human methionine adenosyltransferase 2A (MAT2A) in complex with allosteric compound STL232591

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 71.3 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8p1w

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8p1w
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8p1w
沉积日期 deposition_date2023-05-12
结构标题 titleCrystal structure of human methionine adenosyltransferase 2A (MAT2A) in complex with allosteric compound STL232591
关键词 keywordsMETHIONINE ADENOSYLTRANSFERASE, S-ADENOSYLMETHIONINE SYNTHASE ISOFORM 2 TYPE-2, SAM, ALLOSTERIC INHIBITOR, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier22.66
回转半径 Rg (电子) rg_electron21.67
零角强度 I(0) i031600200.00
分子量 molecular_weight43220.0 kDa
排除体积 excluded_volume54079 ų
包络体积 envelope_volume62330 ų
水化壳体积 shell_volume23704 ų
包络直径 envelope_diameter72.3
壳层 Rg shell_rg28.55
包络 Rg envelope_rg22.02
形状 Rg shape_rg21.64
总 Rg total_rg22.58
总原子数 total_atoms3038
残基数 n_residues381
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax71.3
Rg (实空间) rg_real22.60
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real3.1600e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.4660e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal22.62
I(0) (倒空间) i0_reciprocal31600000.0000
解质量估计 total_estimate0.7312
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.9
偏度 Skewness skewness0.246
峰度 Kurtosis kurtosis-0.531
角度范围 angular_range— – 0.3500 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha13740000.0000
实空间数据点数 n_real_points67
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.932; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.978

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)