8rd7

HUWE1 WWE domain in complex with ADP-ribose

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 79.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1611–1700 链 B； UniProt 1611–1700 链 C； UniProt 1611–1700 链 D； UniProt 1611–1700	未记录	CL CHLORIDE ION × 5 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1 M Na Acetate pH 4.83, 2.9 M NaCl	分辨率 1.31 Å R-free 0.177

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8RD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2EKK Solution structure of RUH-074, a human UBA domain 提交 2007-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1317–1356（40 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1.25mM Domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl (pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90%H2O, 10%D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MUL Solution Structure of the UBM1 domain of human HUWE1/ARF-BP1 提交 2014-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2951–3003（53 aa）片段：UNP residues 2951-3003	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-13C; U-15N] protein, 300 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 2 mM potassium phosphate, 0.05 mM CHAPS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3G1N Catalytic domain of the human E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4005–4374（370 aa）片段：HECT DOMAIN	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG-4000, 10% ISOPROPANOL, 0.1 M TRIS BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
3G1N Catalytic domain of the human E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 4005–4374（370 aa）片段：HECT DOMAIN	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG-4000, 10% ISOPROPANOL, 0.1 M TRIS BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
3H1D Structure of the HUWE1 HECT Domain 提交 2009-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3993–4374（382 aa）片段：HECT	突变：C4099A, C4184A, C4367A	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；291 K；0.1 M citric acid, 1.8 M (NH4)2SO4, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.89 Å R-free 0.229
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 1969–1994（26 aa）链 D 1969–1994（26 aa）链 F 1969–1994（26 aa）链 H 1969–1994（26 aa）链 J 1969–1994（26 aa）链 L 1969–1994（26 aa）链 N 1969–1994（26 aa）链 P 1969–1994（26 aa）链 R 1969–1994（26 aa）链 T 1969–1994（26 aa）链 V 1969–1994（26 aa）链 X 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5C6H Mcl-1 complexed with Mule 提交 2015-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 1969–1994（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG3350, calcium chloride	分辨率 2.05 Å R-free 0.346
5LP8 Crystal structure of an asymmetric dimer of the ubiquitin ligase HUWE1 提交 2016-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3951–4374（424 aa）片段：UNP residues 3951-4374 链 B 3951–4374（424 aa）片段：UNP residues 3951-4374	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Hepes pH 7, PEG20000	分辨率 2.70 Å R-free 0.225
6FYH Disulfide between ubiquitin G76C and the E3 HECT ligase Huwe1 提交 2018-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4255–4374（120 aa）	突变：N378C	SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.8M Zn SO4 0.1M Na Acetat pH 4.0	分辨率 2.91 Å R-free 0.266
6MIW WWE domain of human HUWE1 提交 2018-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1611–1700（90 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 10 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Molecular Dimensions Morpheus HT condition D3	分辨率 2.00 Å R-free 0.212
6PFL Crystal structure of Human HUWE1 WWE domain in complex with ADPR 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1611–1700（90 aa）链 B 1611–1700（90 aa）	未记录	APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.4M NaCitrate, and 0.1M Tris-HCL pH7.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.260
7JQ9 Cryo-EM structure of human HUWE1 提交 2020-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–4374（4374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CHAPSO detergent added to final conc. of 0.8 mM. Sample applied twice.	分辨率 3.10 Å
7MOP Cryo-EM structure of human HUWE1 in complex with DDIT4 提交 2021-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–4374（4374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CHAPSO detergent added to final conc. of 1 mM. Sample applied twice.	分辨率 3.30 Å
7MWD HUWE1 in map with focus on HECT 提交 2021-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–4374（4374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CHAPSO detergent added to final conc. of 0.8 mM. Sample applied twice.	分辨率 3.70 Å
7MWE HUWE1 in map with focus on WWE 提交 2021-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–4374（4374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CHAPSO detergent added to final conc. of 0.8 mM. Sample applied twice.	分辨率 3.40 Å
7MWF HUWE1 in map with focus on interface 提交 2021-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–4374（4374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CHAPSO detergent added to final conc. of 0.8 mM. Sample applied twice.	分辨率 3.30 Å
8R7O HUWE1 WWE domain in complex with 2'F-ATP 提交 2023-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1611–1700（90 aa）链 B 1611–1700（90 aa）链 C 1611–1700（90 aa）链 D 1611–1700（90 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 YGC [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-fluoranyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1 M Na Acetate pH 4.83, 2.9 M NaCl	分辨率 1.36 Å R-free 0.195
8RD0 HUWE1 WWE domain in complex with compound 3 提交 2023-12-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1611–1700（90 aa）链 B 1611–1700（90 aa）链 C 1611–1700（90 aa）链 D 1611–1700（90 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 6 51X (1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)acetic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；0.1 M Na Acetate pH 4.83, 2.9 M NaCl	分辨率 1.76 Å R-free 0.215
8RD1 HUWE1 WWE domain in complex with compound 4 提交 2023-12-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1611–1700（90 aa）链 B 1611–1700（90 aa）链 C 1611–1700（90 aa）链 D 1611–1700（90 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 5 YP2 2-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-1,3-bis(oxidanylidene)isoindole-5-carboxylic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；0.1 M Na Acetate pH 4.83, 2.9 M NaCl	分辨率 1.90 Å R-free 0.220

共 17 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HUWE1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–91； UniProt 1611–1700 作者链 B； PDB构建体 2–91； UniProt 1611–1700 作者链 C； PDB构建体 2–91； UniProt 1611–1700 作者链 D； PDB构建体 2–91； UniProt 1611–1700

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8rd7
沉积日期 deposition_date	2023-12-07
结构标题 title	HUWE1 WWE domain in complex with ADP-ribose
关键词 keywords	E3 Ligase, Complex, Nucleotide, LIGASE; LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.42 Å
零角强度 I(0) i0	26653100.00
分子量 molecular_weight	36202.0 kDa
排除体积 excluded_volume	44038 Å³
包络体积 envelope_volume	54175 Å³
水化壳体积 shell_volume	21593 Å³
包络直径 envelope_diameter	80.3 Å
壳层 Rg shell_rg	27.76 Å
包络 Rg envelope_rg	21.78 Å
形状 Rg shape_rg	21.38 Å
总 Rg total_rg	22.35 Å
总原子数 total_atoms	2537
残基数 n_residues	300
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	79.4 Å
Rg (实空间) rg_real	22.90 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.6650e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.3750e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.91 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	26650000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8755
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.308
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.416
角度范围 angular_range	— – 0.3450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	8162000.0000
实空间数据点数 n_real_points	66
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.810; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.951; Smooth: 0.995

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1
分子量 formula_weight	10519.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	3015

GQSNSNNWRWFDDRSGRWCSYSASNNSTIDSAWKSGETSVRFTAGRRRYTVQFTTMVQVNEETGNRRPVMLTLLRVPRLNKNSKNSNGQEL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	;[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL [HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE ;
分子量 formula_weight	559.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	431

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	62.883 Å
晶胞边长 b length_b	62.883 Å
晶胞边长 c length_c	231.245 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.310 Å
最低分辨率 resolution_low	44.460 Å
R 因子 r_factor	0.1491
R_work r_work	0.1477
R_free r_free	0.1771

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pddf	/app/data/pr_computation/rd/8rd7/8rd7.pr.out
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