8rfl

Low pH (5.5) nitrite-bound MSOX movie series dataset 1 of the copper nitrite reductase (NirK) from Bradyrhizobium japonicum USDA110 [0.61 MGy] - nitrite (start)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Copper-containing nitrite reductase

Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 110

UniProt Q89EJ6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 3 其他聚合物 3 beta-D-fructofuranose-(2-1)-alpha-D-glucopyranose × 3 COPPER (II) ION × 6 NITRITE ION × 15 SULFATE ION × 15 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q89EJ6_BRADU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–340; UniProt 29–367

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8rfl
沉积日期 deposition_date2023-12-13
结构标题 titleLow pH (5.5) nitrite-bound MSOX movie series dataset 1 of the copper nitrite reductase (NirK) from Bradyrhizobium japonicum USDA110 [0.61 MGy] - nitrite (start)
关键词 keywordsCopper nitrite reductase, Copper-containing nitrite reductase, BrJNiR, low pH, nitrite-bound, MSOX, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8rfl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8rfl__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8rfl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)28.87 Å
Rg(电子密度)27.73 Å
总 Rg28.71 Å
原子数7863
残基数1002
排除体积139170 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8rfl__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 引用文献 (1)