8rp6

Aminodeoxychorismate synthase complex from Escherichia coli

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aminodeoxychorismate synthase component 2

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aminodeoxychorismate synthase component 1 × 1 （P05041） ZINC ION × 1 GLYCEROL × 2 TRYPTOPHAN × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHLORIDE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aminodeoxychorismate synthase component 1 × 1 （P05041） ZINC ION × 1 TRYPTOPHAN × 1 MAGNESIUM ION × 2 CHLORIDE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PABA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AAA； PDB构建体 3–189； UniProt 1–187 作者链 BBB； PDB构建体 3–189； UniProt 1–187

Aminodeoxychorismate synthase component 1

Escherichia coli

UniProt P05041

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aminodeoxychorismate synthase component 2 × 1 （P00903） ZINC ION × 1 GLYCEROL × 2 TRYPTOPHAN × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHLORIDE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Aminodeoxychorismate synthase component 2 × 1 （P00903） ZINC ION × 1 TRYPTOPHAN × 1 MAGNESIUM ION × 2 CHLORIDE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PABB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 CCC； PDB构建体 2–454； UniProt 1–453 作者链 DDD； PDB构建体 2–454； UniProt 1–453

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8rp6
沉积日期 deposition_date	2024-01-12
结构标题 title	Aminodeoxychorismate synthase complex from Escherichia coli
关键词 keywords	glutamine amidotransferase folate biosynthesis, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8rp6__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8rp6__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8rp6__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.38 Å
Rg（电子密度）	26.50 Å
总 Rg	27.18 Å
原子数	10085
残基数	642
排除体积	90092 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8rp6__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8rp6__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Aminodeoxychorismate synthase component 2
分子量 formula_weight	20911.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.6.1.85
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AAA,BBB
原子数 atom_count	20274

GGMILLIDNYDSFTWNLYQYFCELGADVLVKRNDALTLADIDALKPQKIVISPGPCTPDEAGISLDVIRHYAGRLPILGVCLGHQAMAQAFGGKVVRAAKVMHGKTSPITHNGEGVFRGLANPLTVTRYHSLVVEPDSLPACFDVTAWSETREIMGIRHRQWDLEGVQFHPESILSEQGHQLLANFLHR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Aminodeoxychorismate synthase component 1
分子量 formula_weight	51160.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.6.1.85
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	CCC,DDD

HMKTLSPAVITLLWRQDAAEFYFSRLSHLPWAMLLHSGYADHPYSRFDIVVAEPICTLTTFGKETVVSESEKRTTTTDDPLQVLQQVLDRADIRPTHNEDLPFQGGALGLFGYDLGRRFESLPEIAEQDIVLPDMAVGIYDWALIVDHQRHTVSLLSHNDVNARRAWLESQQFSPQEDFTLTSDWQSNMTREQYGEKFRQVQEYLHSGDCYQVNLAQRFHATYSGDEWQAFLQLNQANRAPFSAFLRLEQGAILSLSPERFILCDNSEIQTRPIKGTLPRLPDPQEDSKQAVKLANSAKDRAENLMIVDLMRNDIGRVAVAGSVKVPELFVVEPFPAVHHLVSTITAQLPEQLHASDLLRAAFPGGSITGAPKVRAMEIIDELEPQRRNAWCGSIGYLSFCGNMDTSITIRTLTAINGQIFCSAGGGIVADSQEEAEYQETFDKVNRILKQLEK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TRYPTOPHAN
分子量 formula_weight	204.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	67

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晶胞边长 a length_a	79.505 Å
晶胞边长 b length_b	108.326 Å
晶胞边长 c length_c	179.758 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.450 Å
最低分辨率 resolution_low	46.434 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2042
R_free r_free	0.2537

Aminodeoxychorismate synthase complex from Escherichia coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aminodeoxychorismate synthase component 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Aminodeoxychorismate synthase component 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8rp6__assembly_2__model_1

8rp6__assembly_2__model_1 | I(q)

8rp6__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

7. 引用文献 (1)

Aminodeoxychorismate synthase complex from Escherichia coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aminodeoxychorismate synthase component 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Aminodeoxychorismate synthase component 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8rp6__assembly_2__model_1

8rp6__assembly_2__model_1 | I(q)

8rp6__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

7. 引用文献 (1)