8rtl

Af Aio C65F-C80G

Method: X-RAY DIFFRACTION

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8rtl
沉积日期 deposition_date	2024-01-26
最后修订 last_revision	2025-08-06
结构标题 title	Af Aio C65F-C80G
关键词 keywords	arsenite oxidase, cysteine mutation, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (19)

Entity 1 polymer

描述 description	Arsenite oxidase subunit AioA
分子量 formula_weight	92032.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.20.9.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	32670

NDRITLPPANAQRTNMTCHFCIVGCGYHVYKWPELQEGGRAPEQNALGLDFRKQLPPLAVTLTPAMTNVVTEHNGRRYNIMVVPDKACVVNSGLSSTRGGKMASYMYTPTGDGKQRLKAPRLYAADQWVDTTWDHAMALYAGLIKKTLDKDGPQGVFFSCFDHGGAGGGFENTWGTGKLMFSAIQTPMVRIHNRPAYNSECHATREMGIGELNNAYEDAQLADVIWSIGNNPYESQTNYFLNHWLPNLQGATTSKKKERFPNENFPQARIIFVDPRETPSVAIARHVAGNDRVLHLAIEPGTDTALFNGLFTYVVEQGWIDKPFIEAHTKGFDDAVKTNRLSLDECSNITGVPVDMLKRAAEWSYKPKASGQAPRTMHAYEKGIIWGNDNYVIQSALLDLVIATHNVGRRGTGCVRMGGHQEGYTRPPYPGDKKIYIDQELIKGKGRIMTWWGCNNFQTSNNAQALREAILQRSAIVKQAMQKARGATTEEMVDVIYEATQNGGLFVTSINLYPTKLAEAAHLMLPAAHPGEMNLTSMNGERRIRLSEKFMDPPGTAMADCLIAARIANALRDMYQKDGKAEMAAQFEGFDWKTEEDAFNDGFRRAGQPGAPAIDSQGGSTGHLVTYDRLRKSGNNGVQLPVVSWDESKGLVGTEMLYTEGKFDTDDGKAHFKPAPWNGLPATVQQQKDKYRFWLNNGRNNEVWQTAYHDQYNSLMQERYPMAYIEMNPDDCKQLDVTGGDIVEVYNDFGSTFAMVYPVAEIKRGQTFMLFGYVNGIQGDVTTDWTDRNIIPYYKGTWGDIRKVGSMEEFKRTVSFKSRRFA

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 2 polymer

描述 description	Arsenite oxidase subunit AioB
分子量 formula_weight	14301.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.20.9.1
突变 mutation	C65F-C80G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

LRTTLQYPATQVSVAKNLKANEPVSFTYPDTSSPCVAVKLGSPVPGGVGPNNDIVAYSVLCTHMGFPTSYDKSSKTFKCPGHFTEFDAEKAGQMICGQATENLPRVLLRYDEASDALTAVGVDGLIYGRQANVI

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 3 polymer

描述 description	Arsenite oxidase subunit AioB
分子量 formula_weight	14316.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.20.9.1
突变 mutation	C65F-C80G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,F,H

AGRTTLQYPATQVSVAKNLKANEPVSFTYPDTSSPCVAVKLGSPVPGGVGPNNDIVAYSVLCTHMGFPTSYDKSSKTFKCPGHFTEFDAEKAGQMICGQATENLPRVLLRYDEASDALTAVGVDGLIYGRQANVI

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 4 polymer

描述 description	Arsenite oxidase subunit AioA
分子量 formula_weight	92174.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.20.9.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

AANDRITLPPANAQRTNMTCHFCIVGCGYHVYKWPELQEGGRAPEQNALGLDFRKQLPPLAVTLTPAMTNVVTEHNGRRYNIMVVPDKACVVNSGLSSTRGGKMASYMYTPTGDGKQRLKAPRLYAADQWVDTTWDHAMALYAGLIKKTLDKDGPQGVFFSCFDHGGAGGGFENTWGTGKLMFSAIQTPMVRIHNRPAYNSECHATREMGIGELNNAYEDAQLADVIWSIGNNPYESQTNYFLNHWLPNLQGATTSKKKERFPNENFPQARIIFVDPRETPSVAIARHVAGNDRVLHLAIEPGTDTALFNGLFTYVVEQGWIDKPFIEAHTKGFDDAVKTNRLSLDECSNITGVPVDMLKRAAEWSYKPKASGQAPRTMHAYEKGIIWGNDNYVIQSALLDLVIATHNVGRRGTGCVRMGGHQEGYTRPPYPGDKKIYIDQELIKGKGRIMTWWGCNNFQTSNNAQALREAILQRSAIVKQAMQKARGATTEEMVDVIYEATQNGGLFVTSINLYPTKLAEAAHLMLPAAHPGEMNLTSMNGERRIRLSEKFMDPPGTAMADCLIAARIANALRDMYQKDGKAEMAAQFEGFDWKTEEDAFNDGFRRAGQPGAPAIDSQGGSTGHLVTYDRLRKSGNNGVQLPVVSWDESKGLVGTEMLYTEGKFDTDDGKAHFKPAPWNGLPATVQQQKDKYRFWLNNGRNNEVWQTAYHDQYNSLMQERYPMAYIEMNPDDCKQLDVTGGDIVEVYNDFGSTFAMVYPVAEIKRGQTFMLFGYVNGIQGDVTTDWTDRNIIPYYKGTWGDIRKVGSMEEFKRTVSFKSRRFA

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 5 polymer

描述 description	Arsenite oxidase subunit AioA
分子量 formula_weight	92103.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.20.9.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

ANDRITLPPANAQRTNMTCHFCIVGCGYHVYKWPELQEGGRAPEQNALGLDFRKQLPPLAVTLTPAMTNVVTEHNGRRYNIMVVPDKACVVNSGLSSTRGGKMASYMYTPTGDGKQRLKAPRLYAADQWVDTTWDHAMALYAGLIKKTLDKDGPQGVFFSCFDHGGAGGGFENTWGTGKLMFSAIQTPMVRIHNRPAYNSECHATREMGIGELNNAYEDAQLADVIWSIGNNPYESQTNYFLNHWLPNLQGATTSKKKERFPNENFPQARIIFVDPRETPSVAIARHVAGNDRVLHLAIEPGTDTALFNGLFTYVVEQGWIDKPFIEAHTKGFDDAVKTNRLSLDECSNITGVPVDMLKRAAEWSYKPKASGQAPRTMHAYEKGIIWGNDNYVIQSALLDLVIATHNVGRRGTGCVRMGGHQEGYTRPPYPGDKKIYIDQELIKGKGRIMTWWGCNNFQTSNNAQALREAILQRSAIVKQAMQKARGATTEEMVDVIYEATQNGGLFVTSINLYPTKLAEAAHLMLPAAHPGEMNLTSMNGERRIRLSEKFMDPPGTAMADCLIAARIANALRDMYQKDGKAEMAAQFEGFDWKTEEDAFNDGFRRAGQPGAPAIDSQGGSTGHLVTYDRLRKSGNNGVQLPVVSWDESKGLVGTEMLYTEGKFDTDDGKAHFKPAPWNGLPATVQQQKDKYRFWLNNGRNNEVWQTAYHDQYNSLMQERYPMAYIEMNPDDCKQLDVTGGDIVEVYNDFGSTFAMVYPVAEIKRGQTFMLFGYVNGIQGDVTTDWTDRNIIPYYKGTWGDIRKVGSMEEFKRTVSFKSRRFA

来源 Source

来源生物 organism	Alcaligenes faecalis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Entity 6 non-polymer

描述 description	2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	740.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

Entity 7 non-polymer

描述 description	MOLYBDENUM(IV) ION
分子量 formula_weight	95.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 8 non-polymer

描述 description	FE3-S4 CLUSTER
分子量 formula_weight	295.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 9 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

Entity 10 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

Entity 11 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 12 non-polymer

描述 description	TRIETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	150.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 13 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 14 non-polymer

描述 description	OXYGEN ATOM
分子量 formula_weight	16.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 15 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

Entity 16 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

Entity 17 non-polymer

描述 description	1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE
分子量 formula_weight	162.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 18 non-polymer

描述 description	2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL
分子量 formula_weight	120.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 19 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1941

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	90.164 Å
晶胞边长 b length_b	108.797 Å
晶胞边长 c length_c	117.109 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	97.58 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.04 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	96.18 °
晶胞分子数 Z z_pdb	3

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.890 Å
最低分辨率 resolution_low	116.070 Å
R 因子 r_factor	0.2017
R_work r_work	0.1999
R_free r_free	0.2351

Af Aio C65F-C80G

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合体信息 (19)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

来源 Source

Entity 6 non-polymer

Entity 7 non-polymer

Entity 8 non-polymer

Entity 9 non-polymer

Entity 10 non-polymer

Entity 11 non-polymer

Entity 12 non-polymer

Entity 13 non-polymer

Entity 14 non-polymer

Entity 15 non-polymer

Entity 16 non-polymer

Entity 17 non-polymer

Entity 18 non-polymer

Entity 19 water

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (0)