8st3

The 2alpha3beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 193.0 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 27–364 链 A； UniProt 582–627 链 D； UniProt 27–364 链 D； UniProt 582–627	片段：UNP residues 27-364,582-627	Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2 × 3 （P17787） IgG1 Kappa Light Chain × 3 IgG1 Heavy Chain × 3 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8ST3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2LLY NMR structures of the transmembrane domains of the nAChR a4 subunit 提交 2011-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 240–339（100 aa）片段：Helical transmembrane region, residues 242-339 and residues 598-625 链 A 598–626（29 aa）片段：Helical transmembrane region, residues 242-339 and residues 598-625	突变：R240E, R241E, L301S, I303S, L305S, R336E, M626E 突变：R240E, R241E, L301S, I303S, L305S, R336E, M626E	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.65；318 K；压力 ambient NMR样品组成 0.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 5 mM sodium acetate, 1.5 % LDAO, 10 mM sodium chloride, 5 % [U-100% 2H] D2O, 0.1 mM DSS, 10 mM sodium chloride, 20 mM beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5KXI X-ray structure of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2016-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364, 586-627,UNP residues 27-364, 586-627 链 A 586–627（42 aa）片段：UNP residues 27-364, 586-627,UNP residues 27-364, 586-627 链 D 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364, 586-627,UNP residues 27-364, 586-627 链 D 586–627（42 aa）片段：UNP residues 27-364, 586-627,UNP residues 27-364, 586-627	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287.15 K；0.05 M ADA pH 6.8, 12.5% PEG 1500 and 10% PEG 1000	分辨率 3.94 Å R-free 0.307
6CNJ Structure of the 2alpha3beta stiochiometry of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2018-03-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 27–364（338 aa）链 A 586–627（42 aa）链 D 27–364（338 aa）链 D 586–627（42 aa）	突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 10 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 second blot time	分辨率 3.70 Å
6CNK Structure of the 3alpha2beta stiochiometry of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2018-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 27–364（338 aa）链 A 586–627（42 aa）链 B 27–364（338 aa）链 B 586–627（42 aa）链 D 27–364（338 aa）链 D 586–627（42 aa）	突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction, between Phe559-Ser560 in the alpha4 subunit ;	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 10 NA SODIUM ION × 1 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 second blot time	分辨率 3.90 Å
6UR8 CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with varenicline 提交 2019-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 27–364（338 aa）链 A 589–627（39 aa）链 D 27–364（338 aa）链 D 589–627（39 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
6USF CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor with varenicline in complex with anti-BRIL synthetic antibody BAK5 提交 2019-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 27–358（332 aa）链 A 589–627（39 aa）链 D 27–358（332 aa）链 D 589–627（39 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
8SSZ The 2alpha3beta stoichiometry of full-length human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 27–627（601 aa）链 D 27–627（601 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 OCT N-OCTANE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.64 Å
8ST0 The 2alpha3beta stoichiometry of full-length human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 27–627（601 aa）链 D 27–627（601 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACH ACETYLCHOLINE × 2 OCT N-OCTANE × 1 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8ST1 The 3alpha2beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 A 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 B 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 B 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 3 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8ST2 The 3alpha2beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 A 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 B 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 B 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ACH ACETYLCHOLINE × 3 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
8ST4 The 2alpha3beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 A 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 27–364（338 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627 链 D 582–627（46 aa）片段：UNP residues 27-364,582-627	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.35 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACHA4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–338； UniProt 27–364 作者链 A； PDB构建体 339–386； UniProt 582–627 作者链 D； PDB构建体 1–338； UniProt 27–364 作者链 D； PDB构建体 339–386； UniProt 582–627

Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2

Homo sapiens

UniProt P17787

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 26–355 链 B； UniProt 442–502 链 C； UniProt 26–355 链 C； UniProt 442–502 链 E； UniProt 26–355 链 E； UniProt 442–502	片段：UNP residues 26-355,442-502	Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4 × 2 （P43681） IgG1 Kappa Light Chain × 3 IgG1 Heavy Chain × 3 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ST3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2K58 NMR structures of the first transmembrane domain of the neuronal acetylcholine receptor beta 2 subunit 提交 2008-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 231–265（35 aa）片段：unp residues 231-265	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 0.83 mM [U-100% 15N] nAChR TM1, 0.5 mM DSS, 125 mM DPC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2K59 NMR structures of the second transmembrane domain of the neuronal acetylcholine receptor beta 2 subunit 提交 2008-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 264–291（28 aa）片段：UNP residues 264-291	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25；压力 ambient NMR样品组成 3-5 mM [U-100% 15N] nAChR TM2, 0.5 mM DSS, 450-750 mM DPC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KSR NMR structures of TM domain of the n-Acetylcholine receptor b2 subunit 提交 2010-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 231–330（100 aa）链 A 453–486（34 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.8；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 0.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TM123, 50% HFIP/50% H2O \| 50% HFIP/50% H2O NMR样品组成 0.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TM1234, 50% HFIP/ 50% H2O \| 50% HFIP/ 50% H2O	分辨率未提供
2LM2 NMR structures of the transmembrane domains of the AChR b2 subunit 提交 2011-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 231–330（100 aa）片段：Helical transmembrane region, residues 234-330 and residues 458-484 链 A 458–486（29 aa）片段：Helical transmembrane region, residues 234-330 and residues 458-484	突变：R231E, R232E, K233E, L292S, V294S, L296S, K299E, T327E 突变：R231E, R232E, K233E, L292S, V294S, L296S, K299E, T327E	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.65；318 K；压力 ambient NMR样品组成 0.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 5 mM sodium acetate, 1.5 % LDAO, 0.1 mM DSS, 5 % [U-100% 2H] D2O, 10 mM sodium chloride, 20 mM beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5KXI X-ray structure of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2016-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502 链 B 446–502（57 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502 链 C 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502 链 C 446–502（57 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502 链 E 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502 链 E 446–502（57 aa）片段：UNP residues 26-355,446-502,UNP residues 26-353,446-502	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287.15 K；0.05 M ADA pH 6.8, 12.5% PEG 1500 and 10% PEG 1000	分辨率 3.94 Å R-free 0.307
6CNJ Structure of the 2alpha3beta stiochiometry of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2018-03-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 B 26–353（328 aa）链 B 446–502（57 aa）链 C 26–353（328 aa）链 C 446–502（57 aa）链 E 26–353（328 aa）链 E 446–502（57 aa）	突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. 突变：Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit.	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 10 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 second blot time	分辨率 3.70 Å
6CNK Structure of the 3alpha2beta stiochiometry of the human Alpha4Beta2 nicotinic receptor 提交 2018-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 26–353（328 aa）链 C 446–502（57 aa）链 E 26–353（328 aa）链 E 446–502（57 aa）	突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit.,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit.,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit.,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. ; 突变：;Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit.,Glu-Arg linker was inserted in the MX-M4 junction between Gln420-Ser421 in the beta 2 subunit. ;	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 10 NA SODIUM ION × 1 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 second blot time	分辨率 3.90 Å
6UR8 CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with varenicline 提交 2019-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 26–351（326 aa）链 B 442–502（61 aa）链 C 26–351（326 aa）链 C 442–502（61 aa）链 E 26–351（326 aa）链 E 442–502（61 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
6USF CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor with varenicline in complex with anti-BRIL synthetic antibody BAK5 提交 2019-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 26–351（326 aa）链 B 442–502（61 aa）链 C 26–351（326 aa）链 C 442–502（61 aa）链 E 26–351（326 aa）链 E 442–502（61 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
8SSZ The 2alpha3beta stoichiometry of full-length human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 B 26–502（477 aa）链 C 26–502（477 aa）链 E 26–502（477 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 OCT N-OCTANE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.64 Å
8ST0 The 2alpha3beta stoichiometry of full-length human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 B 26–502（477 aa）链 C 26–502（477 aa）链 E 26–502（477 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACH ACETYLCHOLINE × 2 OCT N-OCTANE × 1 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8ST1 The 3alpha2beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 C 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 3 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8ST2 The 3alpha2beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 C 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ACH ACETYLCHOLINE × 3 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
8ST4 The 2alpha3beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine 提交 2023-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 B 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 B 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 C 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 C 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 26–355（330 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502 链 E 442–502（61 aa）片段：UNP residues 26-355,442-502	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ACH ACETYLCHOLINE × 2 NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.35 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACHB2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–330； UniProt 26–355 作者链 B； PDB构建体 331–393； UniProt 442–502 作者链 C； PDB构建体 1–330； UniProt 26–355 作者链 C； PDB构建体 331–393； UniProt 442–502 作者链 E； PDB构建体 1–330； UniProt 26–355 作者链 E； PDB构建体 331–393； UniProt 442–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8st3
沉积日期 deposition_date	2023-05-09
结构标题 title	The 2alpha3beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium
关键词 keywords	cys-loop ligand-gated pentameric ion channels, cation-selective channel, acetylcholine, calcium, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	55.52 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	54.67 Å
零角强度 I(0) i0	1705240000.00
分子量 molecular_weight	359940.0 kDa
排除体积 excluded_volume	456130 Å³
包络体积 envelope_volume	638470 Å³
水化壳体积 shell_volume	100110 Å³
包络直径 envelope_diameter	202.3 Å
壳层 Rg shell_rg	54.96 Å
包络 Rg envelope_rg	55.08 Å
形状 Rg shape_rg	54.67 Å
总 Rg total_rg	54.68 Å
总原子数 total_atoms	50529
残基数 n_residues	3155
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	193.0 Å
Rg (实空间) rg_real	55.63 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.03 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7050e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5650e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.43 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1705000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6356
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	68.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.443
峰度 Kurtosis kurtosis	0.083
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	122700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.811; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.041; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.702

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4
分子量 formula_weight	44862.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	50536

SSHVETRAHAEERLLKKLFSGYNKWSRPVANISDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTSIRIPSELIWRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMKFGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVFLDIVPRLLLMKRPSVVDTDFERSVKEDWKYVAMVIDRIFLWMFIIVCLLGTVGLFLPPWLAGMI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2
分子量 formula_weight	46748.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,E

TDTEERLVEHLLDPSRYNKLIRPATNGSELVTVQLMVSLAQLISVHEREQIMTTNVWLTQEWEDYRLTWKPEEFDNMKKVRLPSKHIWLPDVVLYNNADGMYEVSFYSNAVVSYDGSIFWLPPAIYKSACKIEVKHFPFDQQNCTMKFRSWTYDRTEIDLVLKSEVASLDDFTPSGEWDIVALPGRRNENPDDSTYVDITYDFIIRRKPLFYTINLIIPCVLITSLAILVFYLPSDCGEKMTLCISVLLALTVFLLLISKIVPPTSLDVPLVGKYLMFTMVLVTFSIVTSVCVLNVHHRSPTTHTMAPWVKVVFLEKLPALLFMQQPRHHDDDQERSVSEDWKYVAMVIDRLFLWIFVFVCVFGTIGMFLQPLFQNYTTTTFLHSDHSAPSSKSAWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	IgG1 Kappa Light Chain
分子量 formula_weight	26378.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,H,J

MKLPVRLLVLMFWIPASSSDVLMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCFQGSHVPWTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	IgG1 Heavy Chain
分子量 formula_weight	51195.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,I,K

MEWTWVFLFLLSVTAGVHSQVQLQQSGAEVMKPGASVKISCKGTGYTFSSYWIEWVKQRPGHGLERIGEILPGSGSTNYNEKFRGKATFTADKSSKTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARYLPYYYAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ACETYLCHOLINE
分子量 formula_weight	146.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	7

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	321064

fit	/app/data/saxs_computation/st/8st3/8st3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/st/8st3/8st3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/st/8st3/8st3.dat

The 2alpha3beta stoichiometry of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with acetylcholine and calcium

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)