← 返回搜索
8u9l

Crystal Structure of RelA-cRel chimera complex with DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor p65,Proto-oncogene c-Rel chimera

Mus musculus

UniProt P15307

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
3 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
4 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
8u9l 8u9l 8u9l 8u9l

共 4 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 REL_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 B； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 G； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 H； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 K； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 L； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 O； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176 作者链 P； PDB构建体 82–170； UniProt 88–176

Transcription factor p65,Proto-oncogene c-Rel chimera

Mus musculus

UniProt Q04207

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
3 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
4 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*TP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*AP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
1bft 1my5 1my7

共 3 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1ikn 1k3z 1le5 1le5 1le9 1le9 1lei 1oy3 1ram 1vkx 2i9t 2ram

共 23 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF65_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 A； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 B； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 B； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 G； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 G； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 H； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 H； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 K； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 K； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 L； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 L； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 O； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 O； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291 作者链 P； PDB构建体 2–81； UniProt 19–98 作者链 P； PDB构建体 177–277； UniProt 191–291

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8u9l
沉积日期 deposition_date2023-09-19
结构标题 titleCrystal Structure of RelA-cRel chimera complex with DNA
关键词 keywordsVertebrate Evolution, transcription factor, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8u9l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8u9l__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8u9l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）29.46 Å
Rg（电子密度）29.97 Å
总 Rg30.16 Å
原子数5216
残基数590
排除体积89807 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8u9l__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 8u9l__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 8u9l__assembly_3__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 8u9l__assembly_4__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▶

7. 引用文献 (1)