Fascin
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–493 | 未记录 | Actin, alpha skeletal muscle × 6 (P68139) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8VOA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DFC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FASCIN, AN ACTIN-CROSSLINKING PROTEIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
片段:FULL-LENGTH PROTEIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 4000, hepes, dtt, sodium azide , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.268 |
| 1DFC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FASCIN, AN ACTIN-CROSSLINKING PROTEIN 提交 1999-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
片段:FULL-LENGTH PROTEIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 4000, hepes, dtt, sodium azide , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.268 |
| 3LLP 1.8 Angstrom human fascin 1 crystal structure 提交 2010-01-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 K POTASSIUM ION × 1 BR BROMIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;100mM Hepes, pH 7.5, 20% PEG 4000, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 3LLP 1.8 Angstrom human fascin 1 crystal structure 提交 2010-01-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 K POTASSIUM ION × 1 BR BROMIDE ION × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;100mM Hepes, pH 7.5, 20% PEG 4000, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 3P53 Structure of fascin 提交 2010-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;24% PEG 3350, 0.2 M Lithium Acetate, 1mM DTT, 4% glycerol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 3P53 Structure of fascin 提交 2010-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;24% PEG 3350, 0.2 M Lithium Acetate, 1mM DTT, 4% glycerol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
突变:S39D | BR BROMIDE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:S39D | BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 GOL GLYCEROL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–493(493 aa)
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:S39D 突变:S39D | BR BROMIDE ION × 12 CL CHLORIDE ION × 26 GOL GLYCEROL × 20 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
突变:K41A | BR BROMIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K41A | BR BROMIDE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–493(493 aa)
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K41A 突变:K41A | BR BROMIDE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K41A | BR BROMIDE ION × 10 CL CHLORIDE ION × 12 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
突变:R149A K150A R151A | BR BROMIDE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:R149A K150A R151A | BR BROMIDE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 18 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–493(493 aa)
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:R149A K150A R151A 突变:R149A K150A R151A | BR BROMIDE ION × 14 CL CHLORIDE ION × 58 GOL GLYCEROL × 20 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 6 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
突变:K358A | BR BROMIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K358A | BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 13 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–493(493 aa)
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K358A 突变:K358A | BR BROMIDE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 18 GOL GLYCEROL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
突变:K358A | BR BROMIDE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 26 GOL GLYCEROL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
7–493(487 aa)
片段:residues 7-493
|
未记录 | C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.303 |
| 6I0Z CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | GZQ ~{N}-(2,4-dichlorophenyl)-~{N}-methyl-ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;16-20% PEG 3350, 200 mM LiAc, 4% glycerol
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.227 |
| 6I0Z CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
未记录 | GZQ ~{N}-(2,4-dichlorophenyl)-~{N}-methyl-ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;16-20% PEG 3350, 200 mM LiAc, 4% glycerol
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.227 |
| 6I10 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 2 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | GZK 1-[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]-5-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.287 |
| 6I11 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 3 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 H0H ~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-2-(phenylmethyl)isoquinoline-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.247 |
| 6I12 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 5 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 H08 2-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.208 |
| 6I13 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 7 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 H0Q 2-[(3-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.227 |
| 6I14 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 9 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 GZN 2-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.216 |
| 6I15 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 11 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 GZT 1-[[2,2-bis(fluoranyl)-1,3-benzodioxol-5-yl]methyl]-~{N}-methyl-2-oxidanylidene-pyridine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.243 |
| 6I16 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 15 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 H0B 6-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-5-oxidanylidene-1,6-naphthyridine-8-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 6I17 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 24 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GZW 2-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-6-piperidin-4-yl-2,7-naphthyridine-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.240 |
| 6I18 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH BDP-13176 提交 2018-10-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 H0N 5-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-4-oxidanylidene-1-piperidin-4-yl-~{N}-pyridin-4-yl-pyrazolo[4,3-c]pyridine-7-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.195 |
| 7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–493(493 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
1–493(493 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
1–493(493 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9FN6 Full-length crystal structure of human Fascin 1 提交 2024-06-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0,1M HEPES pH 7.5, 20% polyethylene glycol (PEG) 4000, 2% propanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.304 |
| 9FN6 Full-length crystal structure of human Fascin 1 提交 2024-06-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–493(493 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0,1M HEPES pH 7.5, 20% polyethylene glycol (PEG) 4000, 2% propanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.304 |
| 9GS6 Crystal structure of fascin in complex with compound 4 提交 2024-09-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 A1IPD N-(1-(3,4-dichlorobenzyl)-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-5-oxopyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.268 |
| 9GXI Subtomogram average of fascin-actin complex 提交 2024-09-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–493(493 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | FSCN1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 6–498; UniProt 1–493 |