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8wyr

Cryo-EM structure of human CD5L bound to IgM-Fc/J

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 186.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-2,Isoform 1 of Immunoglobulin heavy constant mu

Homo sapiens

UniProt P01871

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 其他聚合物 1 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 106–453 链 B； UniProt 106–453 链 C； UniProt 106–453 链 D； UniProt 106–453 链 E； UniProt 106–453 链 F； UniProt 106–453 链 G； UniProt 106–453 链 H； UniProt 106–453 链 K； UniProt 106–453 链 L； UniProt 106–453 未记录 Immunoglobulin J chain × 1 （P01591） Interleukin-2,CD5 antigen-like × 1 （P60568,O43866） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.39 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8WYR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2AGJ Crystal Structure of a glycosylated Fab from an IgM cryoglobulin with properties of a natural proteolytic antibody 提交 2005-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–183（183 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 15000-20000, sodium chloride, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.60 Å R-free 0.279
6KXS Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the ectodomain of pIgR 提交 2019-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 F 106–453（348 aa）
链 G 106–453（348 aa）
链 H 106–453（348 aa）
链 K 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7K0C Structure of Secretory IgM Core 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 103–453（351 aa）
链 B 103–453（351 aa）
链 E 103–453（351 aa）
链 F 103–453（351 aa）
链 G 103–453（351 aa）
链 H 103–453（351 aa）
链 I 103–453（351 aa）
链 J 103–453（351 aa）
链 K 103–453（351 aa）
链 L 103–453（351 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging with blot force 7.
分辨率 3.30 Å
7WSP Structure of a membrane protein M 提交 2022-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 106–471（366 aa）
链 D 106–472（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 4.09 Å
7Y09 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP 提交 2022-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 F 106–453（348 aa）
链 G 106–453（348 aa）
链 H 106–453（348 aa）
链 K 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7Y0H Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum VAR2CSA FCR3 提交 2022-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 F 106–453（348 aa）
链 G 106–453（348 aa）
链 H 106–453（348 aa）
链 K 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
7Y0J Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum TM284VAR1 提交 2022-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 F 106–453（348 aa）
链 G 106–453（348 aa）
链 H 106–453（348 aa）
链 K 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7YG2 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP2 提交 2022-07-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 F 106–453（348 aa）
链 G 106–453（348 aa）
链 H 106–453（348 aa）
链 K 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7YSG Cryo-EM structure of human FcmR bound to sIgM 提交 2022-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 222–453（232 aa）
链 B 222–453（232 aa）
链 C 222–453（232 aa）
链 D 222–453（232 aa）
链 E 222–453（232 aa）
链 F 222–453（232 aa）
链 G 222–453（232 aa）
链 H 222–453（232 aa）
链 K 222–453（232 aa）
链 L 222–453（232 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7YTC Cryo-EM structure of human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 222–453（232 aa）
链 B 222–453（232 aa）
链 C 222–453（232 aa）
链 D 222–453（232 aa）
链 E 222–453（232 aa）
链 F 222–453（232 aa）
链 G 222–453（232 aa）
链 H 222–453（232 aa）
链 K 222–453（232 aa）
链 L 222–453（232 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7YTD Cryo-EM structure of four human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 222–452（231 aa）
链 B 222–452（231 aa）
链 C 222–452（231 aa）
链 D 222–452（231 aa）
链 E 222–452（231 aa）
链 F 222–452（231 aa）
链 G 222–452（231 aa）
链 H 222–452（231 aa）
链 K 222–452（231 aa）
链 L 222–452（231 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
8GZN IgM-var2CSA complex 提交 2022-09-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–453（453 aa）
链 B 1–453（453 aa）
链 C 1–453（453 aa）
链 D 1–453（453 aa）
链 E 1–453（453 aa）
链 F 1–453（453 aa）
链 G 1–453（453 aa）
链 H 1–453（453 aa）
链 K 1–453（453 aa）
链 L 1–453（453 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9ARV CryoEM structure of AMETA-A3 提交 2024-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 106–453（348 aa）
链 B 106–453（348 aa）
链 C 106–453（348 aa）
链 D 106–453（348 aa）
链 E 106–453（348 aa）
链 L 106–453（348 aa）
链 M 106–453（348 aa）
链 N 106–453（348 aa）
链 O 106–453（348 aa）
链 P 106–453（348 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9UO3 Cryo-EM structure of the human IgM-Fc hexamer 提交 2025-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–446（341 aa）
链 B 106–446（341 aa）
链 C 106–446（341 aa）
链 D 106–446（341 aa）
链 E 106–446（341 aa）
链 F 106–446（341 aa）
链 G 106–446（341 aa）
链 H 106–446（341 aa）
链 I 106–446（341 aa）
链 J 106–446（341 aa）
链 K 106–446（341 aa）
链 L 106–446（341 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9UO4 Cryo-EM structure of the chimeric human IgM-Fc hexamer 提交 2025-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 106–433（328 aa）
链 B 106–433（328 aa）
链 C 106–433（328 aa）
链 D 106–433（328 aa）
链 E 106–433（328 aa）
链 F 106–433（328 aa）
链 G 106–433（328 aa）
链 H 106–433（328 aa）
链 I 106–433（328 aa）
链 J 106–433（328 aa）
链 K 106–433（328 aa）
链 L 106–433（328 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGHM_HUMAN
Isoform P01871-1
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 B； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 C； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 D； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 E； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 F； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 G； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 H； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 K； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453 作者链 L； PDB构建体 56–403； UniProt 106–453

Interleukin-2,Isoform 1 of Immunoglobulin heavy constant mu

Homo sapiens

UniProt P60568

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 其他聚合物 1 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–21 链 B； UniProt 1–21 链 C； UniProt 1–21 链 D； UniProt 1–21 链 E； UniProt 1–21 链 F； UniProt 1–21 链 G； UniProt 1–21 链 H； UniProt 1–21 链 K； UniProt 1–21 链 L； UniProt 1–21 链 M； UniProt 1–21 未记录 Immunoglobulin J chain × 1 （P01591） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.39 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8WYR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1IRL THE SOLUTION STRUCTURE OF THE F42A MUTANT OF HUMAN INTERLEUKIN 2 提交 1995-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：F42A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1M47 Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.99 Å R-free 0.245
1M48 Crystal Structure of Human IL-2 Complexed with (R)-N-[2-[1-(Aminoiminomethyl)-3-piperidinyl]-1-oxoethyl]-4-(phenylethynyl)-L-phenylalanine methyl ester 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 FRG 2-[3-METHYL-4-(N-METHYL-GUANIDINO)-BUTYRYLAMINO]-3-(4-PHENYLETHYNYL-PHENYL)-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.269
1M48 Crystal Structure of Human IL-2 Complexed with (R)-N-[2-[1-(Aminoiminomethyl)-3-piperidinyl]-1-oxoethyl]-4-(phenylethynyl)-L-phenylalanine methyl ester 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
未记录 FRG 2-[3-METHYL-4-(N-METHYL-GUANIDINO)-BUTYRYLAMINO]-3-(4-PHENYLETHYNYL-PHENYL)-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.269
1M49 Crystal Structure of Human Interleukin-2 Complexed with SP-1985 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 CMM 2-[2-(1-CARBAMIMIDOYL-PIPERIDIN-3-YL)-ACETYLAMINO]-3-{4-[2-(3-OXALYL-1H-INDOL-7-YL)ETHYL]-PHENYL}-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.278
1M49 Crystal Structure of Human Interleukin-2 Complexed with SP-1985 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
未记录 CMM 2-[2-(1-CARBAMIMIDOYL-PIPERIDIN-3-YL)-ACETYLAMINO]-3-{4-[2-(3-OXALYL-1H-INDOL-7-YL)ETHYL]-PHENYL}-PROPIONIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.278
1M4A Crystal Structure of Human Interleukin-2 Y31C Covalently Modified at C31 with (1H-Indol-3-yl)-(2-mercapto-ethoxyimino)-acetic acid 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：Y31C MPE (1H-INDOL-3-YL)-(2-MERCAPTO-ETHOXYIMINO)-ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.18 Å R-free 0.324
1M4B Crystal Structure of Human Interleukin-2 K43C Covalently Modified at C43 with 2-[2-(2-Cyclohexyl-2-guanidino-acetylamino)-acetylamino]-N-(3-mercapto-propyl)-propionamide 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：K43C NMP 2-[2-(2-CYCLOHEXYL-2-GUANIDINO-ACETYLAMINO)-ACETYLAMINO]-N-(3-MERCAPTO-PROPYL)-PROPIONAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.286
1M4C Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.333
1M4C Crystal Structure of Human Interleukin-2 提交 2002-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.333
1NBP Crystal Structure Of Human Interleukin-2 Y31C Covalently Modified At C31 With 3-Mercapto-1-(1,3,4,9-tetrahydro-B-carbolin-2-yl)-propan-1-one 提交 2002-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：Y31C SO4 SULFATE ION × 1 MHC 3-MERCAPTO-1-(1,3,4,9-TETRAHYDRO-B-CARBOLIN-2-YL)-PROPAN-1-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；ammonium sulfate, PEG 8k, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
未记录 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–153（133 aa）
链 B 21–153（133 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PW6 Low Micromolar Small Molecule Inhibitor of IL-2 提交 2003-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–153（133 aa）
链 B 21–153（133 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 FRB 2-CYCLOHEXYL-N-(2-{4-[5-(2,3-DICHLORO-PHENYL)-2H-PYRAZOL-3-YL]-PIPERIDIN-1-YL}-2-OXO-ETHYL)-2-GUANIDINO-ACETAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；lithium sulfate, ammonium sulfate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1PY2 Structure of a 60 nM Small Molecule Bound to a Hot Spot on IL-2 提交 2003-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–152（132 aa）
未记录 FRH 5-[2,3-DICHLORO-4-(5-{1-[2-(2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOYLAMINO)-ACETYL]-PIPERIDIN-4-YL}-1-METHYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-PHENOXYMETHYL]-FURAN-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–152（132 aa）
链 C 21–152（132 aa）
突变：V69A 突变：V69A ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–152（132 aa）
链 D 21–152（132 aa）
突变：V69A 突变：V69A ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–152（132 aa）
链 B 21–152（132 aa）
链 C 21–152（132 aa）
链 D 21–152（132 aa）
突变：V69A 突变：V69A 突变：V69A 突变：V69A ZN ZINC ION × 4 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1QVN Structure of SP4160 Bound to IL-2 V69A 提交 2003-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–152（132 aa）
链 C 21–152（132 aa）
突变：V69A 突变：V69A ZN ZINC ION × 2 FRI 2-GUANIDINO-4-METHYL-PENTANOIC ACID [2-(4-{5-[4-(4-ACETYLAMINO-BENZYLOXY)-2,3-DICHLORO-PHENYL]-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL}-PIPERIDIN-1-YL)-2-OXO-ETHYL]-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.05 M Zinc Acetate, 0.075 M Magnesium Chloride, 18% (w/v) Polyethylene Glycol 10K, 0.1M Sodium Cacodylate, pH 5.9. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
1Z92 structure of interleukin-2 with its alpha receptor 提交 2005-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Na-malonic acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
2B5I cytokine receptor complex 提交 2005-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；29% Pentaerythritol Ethoxylate 15/4; 50 mM Ammonium Sulfate; 50 mM Bis Tris, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.269
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 21–153（133 aa）
突变：C125A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 21–153（133 aa）
突变：C125A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
3INK UNRAVELING THE STRUCTURE OF INTERLEUKIN-2: REPLY 提交 1992-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–153（133 aa）
链 D 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 b 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 e 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 h 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 S 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 V 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Y 21–153（133 aa） 片段：unp residues 21-153
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
3QB1 Interleukin-2 mutant D10 提交 2011-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 21–153（133 aa）
突变：Q74H, L80F, R81D, L85V, I86V, I92F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 30% PEG-4000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.263
5LQB Complex structure of human IL2 mutant, Proleukin, with Fab fragment of NARA1 antibody 提交 2016-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 22–153（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350 0.2M Sodium Nitrate
分辨率 1.95 Å R-free 0.291
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–153（133 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 21–153（133 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 21–153（133 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
5UTZ Human IL-2/Fab complex 提交 2017-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–153（133 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG6000
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6LX3 Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A 提交 2020-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–21（21 aa）
链 B 1–21（21 aa）
链 C 1–21（21 aa）
链 D 1–21（21 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
6LXW Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A in complex with the N-terminal domain of SpsA 提交 2020-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–21（21 aa）
链 B 1–21（21 aa）
链 C 1–21（21 aa）
链 D 1–21（21 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
6VWU X-ray structure of ALKS 4230, a fusion of circularly permuted human Interleukin-2 and Interleukin-2 Receptor alpha 提交 2020-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–94（71 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；An equal volume of protein was mixed with crystallization buffer, 25 % (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Hepes 7.5. Large crystals appeared within 48-72 hours, and were frozen in a cryoprotectant consisting of mother liquor with 10 % glycerol
分辨率 3.40 Å R-free 0.297
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48
分辨率 2.89 Å R-free 0.283
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48
分辨率 2.89 Å R-free 0.283
6YE3 IL-2 in complex with a Fab fragment from UFKA-20 提交 2020-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10.86% (v/v) PEG 8000, 5.76% (v/v) ethylene glycol, 100 mM HEPES, pH 7.48
分辨率 2.89 Å R-free 0.283
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7DR4 Complex of anti-human IL-2 antibody and human IL-2 提交 2020-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 21–153（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4NO3, pH4.8, 25% PEG3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.258
7M2G INTERLEUKIN-2 (human) mutant P65K, C125S 提交 2021-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa） 片段：IL2
突变：P65K, C125S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.75；293 K；1.75M (NH4)2SO4, 0.10 M HEPES/NaOH pH=7.75 at a protein concentration of 37 mg/ml.
分辨率 1.79 Å R-free 0.228
7RA9 Designed StabIL-2 seq1 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：G27M, I28L, K32D, M39L, E52S, V69A, L72A, Q74G, S75D, K76D, N77P, F78K, H79T, L80I, delta81-82, L85V, I86V, I92F, V115I PO4 PHOSPHATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；295 K；0.2 M Li2SO4, 0.1 M CAPS pH 10.5, 1.2 M NaH2PO4, and 0.8 M K2HPO4
分辨率 2.20 Å R-free 0.293
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–153（133 aa）
突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding
分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–153（133 aa）
突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding
分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–153（133 aa）
突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding
分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7RAA Designed StabIL-2 seq15 提交 2021-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 21–153（133 aa）
突变：G27M, I28L, K32D, V69A, L72Q, R81D, V115I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；295 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.3, 24% PEG 3350 with microseeding
分辨率 2.69 Å R-free 0.294
7ZMZ Engineered Interleukin 2 bound to CD25 receptor 提交 2022-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–153（134 aa）
突变：T37H, R38L, T41S, F42Y, K43G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；19% PEG 3350, 0.2 M Sodium tartrate dibasic dihydrate, 10% glycerol
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
8SOW Structure of the complex formed by human interleukin-2 and scFv F10 提交 2023-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–153（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；15-30% PEG 3350, 0.1-0.35 M ammonium fluoride
分辨率 1.71 Å R-free 0.235
8SOZ Structure of the complex formed by human interleukin-2 and scFv 602 提交 2023-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–153（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；15-30% PEG 3350, 0.1-0.35 ammonium fluoride
分辨率 1.64 Å R-free 0.250
8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–21（21 aa）
链 L 1–21（21 aa）
链 M 1–21（21 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9KMC Cryo-EM structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 and anti-CD25 Fab S417 提交 2024-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–153（133 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9MBZ Cryo-EM structure of human FcRL4 bound to IgA-Fc/J 提交 2025-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–21（21 aa）
链 B 1–21（21 aa）
链 C 1–21（21 aa）
链 D 1–21（21 aa）
链 F 1–21（21 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.30 Å

共 33 个其他 PDB 条目、77 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 B； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 C； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 D； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 E； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 F； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 G； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 H； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 K； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 L； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21 作者链 M； PDB构建体 1–21； UniProt 1–21

Immunoglobulin J chain

Homo sapiens

UniProt P01591

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 其他聚合物 1 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–159 未记录 Interleukin-2,Isoform 1 of Immunoglobulin heavy constant mu × 10 （P60568,P01871） Interleukin-2,CD5 antigen-like × 1 （P60568,O43866） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.39 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8WYR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KXS Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the ectodomain of pIgR 提交 2019-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6LX3 Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A 提交 2020-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
6LXW Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A in complex with the N-terminal domain of SpsA 提交 2020-02-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
6UE7 Structure of dimeric sIgA complex 提交 2019-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 23–159（137 aa） 片段：UNP residues 23-159
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6UE8 Structure of tetrameric sIgA complex (Class 1) 提交 2019-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 23–159（137 aa） 片段：UNP residues 23-159
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6UE9 Structure of tetrameric sIgA complex (Class 2) 提交 2019-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 23–159（137 aa） 片段：UNP residues 23-159
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6UEA Structure of pentameric sIgA complex 提交 2019-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 23–159（137 aa） 片段：UNP residues 23-159
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7K0C Structure of Secretory IgM Core 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 23–159（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging with blot force 7.
分辨率 3.30 Å
7Y09 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP 提交 2022-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7Y0H Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum VAR2CSA FCR3 提交 2022-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
7Y0J Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum TM284VAR1 提交 2022-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7YG2 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP2 提交 2022-07-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7YSG Cryo-EM structure of human FcmR bound to sIgM 提交 2022-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7YTC Cryo-EM structure of human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7YTD Cryo-EM structure of four human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
8GZN IgM-var2CSA complex 提交 2022-09-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 24–159（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8R83 pentameric IgMFc-AIM complex global refinement 提交 2023-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
8R84 pentameric IgMFc-AIM complex focused refinement 提交 2023-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8SKU Structure of human SIgA1 in complex with human CD89 (FcaR1) 提交 2023-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 23–159（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SKV Structure of human SIgA1 in complex with Streptococcus pyogenes protein M4 (Arp4) 提交 2023-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 23–159（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9ARV CryoEM structure of AMETA-A3 提交 2024-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MBZ Cryo-EM structure of human FcRL4 bound to IgA-Fc/J 提交 2025-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.30 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGJ_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

Interleukin-2,CD5 antigen-like

Homo sapiens

UniProt O43866

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 12 其他聚合物 1 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 20–347 未记录 Interleukin-2,Isoform 1 of Immunoglobulin heavy constant mu × 10 （P60568,P01871） Immunoglobulin J chain × 1 （P01591） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.39 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8WYR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8R83 pentameric IgMFc-AIM complex global refinement 提交 2023-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 N 20–347（328 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
8R84 pentameric IgMFc-AIM complex focused refinement 提交 2023-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 N 20–347（328 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 20–347（328 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CD5L_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 32–359； UniProt 20–347

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8wyr

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8wyr
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8wyr
沉积日期 deposition_date2023-10-31
结构标题 titleCryo-EM structure of human CD5L bound to IgM-Fc/J
关键词 keywordsimmunoglobulin, CD5 antigen-like, pentamer, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier55.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron55.33 Å
零角强度 I(0) i01277660000.00
分子量 molecular_weight293390.0 kDa
排除体积 excluded_volume364880 ų
包络体积 envelope_volume556240 ų
水化壳体积 shell_volume84117 ų
包络直径 envelope_diameter183.6 Å
壳层 Rg shell_rg55.82 Å
包络 Rg envelope_rg55.50 Å
形状 Rg shape_rg55.36 Å
总 Rg total_rg55.27 Å
总原子数 total_atoms20612
残基数 n_residues2629
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax186.1 Å
Rg (实空间) rg_real55.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.01 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2780e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.3700e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal55.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1277000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8548
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary59.8 Å
偏度 Skewness skewness0.312
峰度 Kurtosis kurtosis-0.526
角度范围 angular_range— – 0.1400 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha114700000.0000
实空间数据点数 n_real_points29
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.900; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.418
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)