Beta-amylase
Bacillus cereus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 5 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 31–546 | 未记录 | alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 3 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 8 BGC beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;HANGING DROP VAPOR DIFFUSION AGAINST 0.1 M PHOSPHATE BUFFER PH 6.5, 15% PEG 6000 AND 5% SATN. AMMONIUM SULFATE WITH A PROTEIN CONCENTRATION OF 15MG/ML. | 分辨率 1.26 Å R-free 0.165 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8ZRZ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B90 BACILLUS CEREUS BETA-AMYLASE APO FORM 提交 1999-03-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;HANGING DROP VAPOR DIFFUSION AGAINST
0.1 M ACETATE BUFFER PH 4.6, 18% PEG 6000
AND 5% SATN. AMMONIUM SULFATE WITH A
PROTEIN CONCENTRATION OF 10MG/ML.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.247 |
| 1B9Z BACILLUS CEREUS BETA-AMYLASE COMPLEXED WITH MALTOSE 提交 1999-03-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;HANGING DROP VAPOR DIFFUSION AGAINST 0.1 M ACETATE
BUFFER PH 4.6, 18% PEG 6000 AND 5% SATN. AMMONIUM SULFATE WITH A PROTEIN
CONCENTRATION OF 10MG/ML.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 1J0Y Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with glucose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 1J0Y Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with glucose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–546(516 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 1J0Y Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with glucose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
31–546(516 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 1J0Y Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with glucose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
31–546(516 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 1J0Z Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with maltose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 1J0Z Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with maltose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 1J0Z Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with maltose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 1J0Z Beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with maltose 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 1J10 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with GGX 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 1J10 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with GGX 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 1J10 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with GGX 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 1J10 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with GGX 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 1J11 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with alpha-EPG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | EPG (2R)-oxiran-2-ylmethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 1J11 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with alpha-EPG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–546(516 aa)
|
未记录 | EPG (2R)-oxiran-2-ylmethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 1J11 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with alpha-EPG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
31–546(516 aa)
|
未记录 | EPG (2R)-oxiran-2-ylmethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 1J11 beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides in complex with alpha-EPG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
31–546(516 aa)
|
未记录 | EPG (2R)-oxiran-2-ylmethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 1J12 Beta-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides in Complex with alpha-EBG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | EBG 2-[(2S)-oxiran-2-yl]ethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.253 |
| 1J12 Beta-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides in Complex with alpha-EBG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–546(516 aa)
|
未记录 | EBG 2-[(2S)-oxiran-2-yl]ethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.253 |
| 1J12 Beta-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides in Complex with alpha-EBG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
31–546(516 aa)
|
未记录 | EBG 2-[(2S)-oxiran-2-yl]ethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.253 |
| 1J12 Beta-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides in Complex with alpha-EBG 提交 2002-11-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
31–546(516 aa)
|
未记录 | EBG 2-[(2S)-oxiran-2-yl]ethyl alpha-D-glucopyranoside × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 6000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.253 |
| 1J18 Crystal Structure of a Beta-Amylase from Bacillus cereus var. mycoides Cocrystallized with Maltose 提交 2002-12-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;PEG 6000, ammonuim sulfate, maltose, acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 1VEM Crystal Structure Analysis of Bacillus Cereus Beta-Amylase at the optimum pH (6.5) 提交 2004-04-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG 6000, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 1VEN Crystal Structure Analysis of Y164E/maltose of Bacilus cereus Beta-amylase at pH 4.6 提交 2004-04-03 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
突变:Y164E | GLC alpha-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;291 K;PEG 6000, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.229 |
| 1VEO Crystal Structure Analysis of Y164F/maltose of Bacillus cereus Beta-Amylase at pH 4.6 提交 2004-04-03 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
突变:Y164F | GLC alpha-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;291 K;PEG 6000, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.215 |
| 1VEP Crystal Structure Analysis of Triple (T47M/Y164E/T328N)/maltose of Bacillus cereus Beta-Amylase at pH 6.5 提交 2004-04-03 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–546(516 aa)
|
突变:T47M, Y164E, T328N | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG 6000, ammonium sulfate, potassium phosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.226 |
共 12 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | AMYB_BACCE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–516; UniProt 31–546 |