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9ckj

Co-crystal structure of 53BP1 tandem Tudor domains in complex with UNC9512

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TP53-binding protein 1

Homo sapiens

UniProt A6NNK5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ;(3S)-1-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridine-2-carbonyl]-N-[(3M)-3-(3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl)phenyl]piperidine-3-carboxamide ; × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ;(3S)-1-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridine-2-carbonyl]-N-[(3M)-3-(3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl)phenyl]piperidine-3-carboxamide ; × 2 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ;(3S)-1-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridine-2-carbonyl]-N-[(3M)-3-(3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl)phenyl]piperidine-3-carboxamide ; × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
6upt 6upt

共 2 个 assembly

同源二聚体
9ckj 9ckj 9ckj

共 3 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
7yqk 8svg 8svh 8svi 8svj 8t2d

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A6NNK5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561 作者链 B； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561 作者链 C； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561 作者链 D； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561 作者链 E； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561 作者链 F； PDB构建体 1–124； UniProt 1438–1561

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ckj
沉积日期 deposition_date2024-07-09
最后修订 last_revision2024-10-30
结构标题 titleCo-crystal structure of 53BP1 tandem Tudor domains in complex with UNC9512
关键词 keywords53BP1, UNC9512, TRANSCRIPTION, Structural Genomics, PSI-Biology, Structural Genomics Consortium, SGC; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ckj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ckj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ckj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）20.75 Å
Rg（电子密度）19.78 Å
总 Rg20.74 Å
原子数1944
残基数238
排除体积34680 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ckj__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 9ckj__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 9ckj__assembly_3__model_1 dimeric （2） 排除 — —
排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)