SAXSdb — 9etg

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, liver

Gallus gallus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	;[4-[(2-azanyl-4-oxidanylidene-1,3-thiazol-5-yl)methyl]phenyl] (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},7~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-3,7,12-tris(oxidanyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoate ; × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	;[4-[(2-azanyl-4-oxidanylidene-1,3-thiazol-5-yl)methyl]phenyl] (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},7~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-3,7,12-tris(oxidanyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoate ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FABPL_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–129； UniProt 1–126 作者链 B； PDB构建体 4–129； UniProt 1–126 作者链 C； PDB构建体 4–129； UniProt 1–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9etg
沉积日期 deposition_date	2024-03-26
最后修订 last_revision	2024-10-09
结构标题 title	Crystal structure of recombinant chicken liver Bile Acid Binding Protein (cL-BABP) in complex with CA-M11
关键词 keywords	fatty acid binding protein, chicken liver bile acid binding protein, recombinant, CA-M11, bioconjugate, LIPID BINDING PROTEIN; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9etg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9etg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9etg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	15.13 Å
Rg（电子密度）	13.70 Å
总 Rg	14.98 Å
原子数	987
残基数	126
排除体积	17754 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9etg__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`9etg__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`9etg__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fatty acid-binding protein, liver
分子量 formula_weight	14513.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	3132

GSHMAFSGTWQVYAQENYEEFLKALALPEDLIKMARDIKPIVEIQQKGDDFVVTSKTPRQTVTNSFTLGKEADITTMDGKKLKCTVHLANGKLVTKSEKFSHEQEVKGNEMVETITFGGVTLIRRSKRV

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;[4-[(2-azanyl-4-oxidanylidene-1,3-thiazol-5-yl)methyl]phenyl] (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},7~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-3,7,12-tris(oxidanyl)-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoate ;
分子量 formula_weight	612.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	163

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晶胞边长 a length_a	59.563 Å
晶胞边长 b length_b	60.569 Å
晶胞边长 c length_c	135.136 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	67.570 Å
R 因子 r_factor	0.2248
R_work r_work	0.2219
R_free r_free	0.2856

Crystal structure of recombinant chicken liver Bile Acid Binding Protein (cL-BABP) in complex with CA-M11

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, liver

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9etg__assembly_1__model_1

9etg__assembly_1__model_1 | I(q)

9etg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of recombinant chicken liver Bile Acid Binding Protein (cL-BABP) in complex with CA-M11

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, liver

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9etg__assembly_1__model_1

9etg__assembly_1__model_1 | I(q)

9etg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)