SAXSdb — 9fid

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Furin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Neuroendocrine convertase 1 × 1 （P29120） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Neuroendocrine convertase 1 × 1 （P29120） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Neuroendocrine convertase 1 × 1 （P29120） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FURIN_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–467； UniProt 108–574 作者链 B； PDB构建体 1–467； UniProt 108–574 作者链 C； PDB构建体 1–467； UniProt 108–574

Neuroendocrine convertase 1

Homo sapiens

UniProt P29120

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Furin × 1 （P09958） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Furin × 1 （P09958） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Furin × 1 （P09958） CALCIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NEC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 13–95； UniProt 28–110 作者链 E； PDB构建体 13–95； UniProt 28–110 作者链 F； PDB构建体 13–95； UniProt 28–110

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9fid
沉积日期 deposition_date	2024-05-29
最后修订 last_revision	2025-09-10
结构标题 title	X-ray structure of furin (PCSK3) in complex with the PC1/3 (PCSK1) prodomain mutant R78K,R80A
关键词 keywords	furin, proprotein convertase subtilisin/kexin type 3, PCSK3, PCSK1, prodomain, complex, activation, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9fid__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9fid__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9fid__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.02 Å
Rg（电子密度）	23.01 Å
总 Rg	23.81 Å
原子数	7994
残基数	532
排除体积	71706 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9fid__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`9fid__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`9fid__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Furin
分子量 formula_weight	52388.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.75
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	24133

DVYQEPTDPKFPQQWYLSGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTDAVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWASGNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNEKQIVTTDLRQKCTESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWATNGVGRKVSHSYGYGLLDAGAMVALAQNWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTVTACLGEPNHITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLYGTASGSLVPRGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Neuroendocrine convertase 1
分子量 formula_weight	11069.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.93
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MGHHHHHHSGHMKRQFVNEWAAEIPGGPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRKSARSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	106

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晶胞边长 a length_a	58.480 Å
晶胞边长 b length_b	196.980 Å
晶胞边长 c length_c	99.870 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.82 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	43.780 Å
R 因子 r_factor	0.2279
R_work r_work	0.2267
R_free r_free	0.2515

X-ray structure of furin (PCSK3) in complex with the PC1/3 (PCSK1) prodomain mutant R78K,R80A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Furin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Neuroendocrine convertase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9fid__assembly_3__model_1

9fid__assembly_3__model_1 | I(q)

9fid__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)

X-ray structure of furin (PCSK3) in complex with the PC1/3 (PCSK1) prodomain mutant R78K,R80A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Furin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Neuroendocrine convertase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9fid__assembly_3__model_1

9fid__assembly_3__model_1 | I(q)

9fid__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)