9h2a

AcMNPV complete basal cap

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Occlusion-derived virus envelope protein E27

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Protein C42 × 42 （P25695） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Protein AC142 × 14 （P41700） Major capsid protein × 56 （P17499） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E27_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290 作者链 B； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290 作者链 O； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290 作者链 P； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290 作者链 Q； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290 作者链 R； PDB构建体 1–290； UniProt 1–290

Protein C42

物种未注明

UniProt P25695

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Protein AC142 × 14 （P41700） Major capsid protein × 56 （P17499） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C42_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 D； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 S； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 T； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 U； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 V； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361

Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region

物种未注明

UniProt P24745

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Protein C42 × 42 （P25695） Protein AC142 × 14 （P41700） Major capsid protein × 56 （P17499） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	38K_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 W； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

Protein AC142

物种未注明

UniProt P41700

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Protein C42 × 42 （P25695） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Major capsid protein × 56 （P17499） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AC142_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–477； UniProt 1–477 作者链 X； PDB构建体 1–477； UniProt 1–477

Major capsid protein

物种未注明

UniProt P17499

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Protein C42 × 42 （P25695） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Protein AC142 × 14 （P41700） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MCP_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 H； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 M； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 N； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 Y； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 Z； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 e； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 f； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347

Capsid-associated protein VP80

物种未注明

UniProt Q00733

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Protein C42 × 42 （P25695） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Protein AC142 × 14 （P41700） Major capsid protein × 56 （P17499） Protein AC109 × 14 （P41662） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VP80_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691 作者链 J； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691 作者链 K； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691 作者链 a； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691 作者链 b； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691 作者链 c； PDB构建体 1–691； UniProt 1–691

Protein AC109

物种未注明

UniProt P41662

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 224	Occlusion-derived virus envelope protein E27 × 42 （P41702） Protein C42 × 42 （P25695） Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region × 14 （P24745） Protein AC142 × 14 （P41700） Major capsid protein × 56 （P17499） Capsid-associated protein VP80 × 42 （Q00733） ZINC ION × 56	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AC109_NPVAC
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–390； UniProt 1–390 作者链 d； PDB构建体 1–390； UniProt 1–390

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9h2a
沉积日期 deposition_date	2024-10-11
最后修订 last_revision	2025-06-04
结构标题 title	AcMNPV complete basal cap
关键词 keywords	nucleocapsid, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9h2a__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9h2a__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9h2a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	164.90 Å
总 Rg	164.70 Å
原子数	467005
残基数	56910
排除体积	8373100 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9h2a__assembly_1__model_1`	224-meric （224）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Occlusion-derived virus envelope protein E27
分子量 formula_weight	33568.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,O,P,Q,R
原子数 atom_count	66715

MKRIKCNKVRTVTEIVNSDEKIQKTYELAEFDLKNLSSLESYETLKIKLALSKYMAMLSTLEMTQPLLEIFRNKADTRQIAAVVFSTLAFIHNRFHPLVTNFTNKMEFVVTETNDTSIPGEPILFTENEGVLLCSVDRPSIVKMLSREFDTEALVNFENDNCNVRIAKTFGASKRKNTTRSDDYESNKQPNYDMDLSDFSITEVEATQYLTLLLTVEHAYLHYYIFKNYGVFEYCKSLTDHSLFTNKLRSTMSTKTSNLLLSKFKFTIEDFDKINSNSVTSGFNIYNFNK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein C42
分子量 formula_weight	41583.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,S,T,U,V

MSAIALYLEINKLRLKIDEPMQLAIWPQLFPLLCDEHQSVQLNTDVLINFMMHVARKSQNTILNNNAAIASQYAAGNADVVAAPASAQPTPRPVINLFARANAAAPAQPSEELINMRRYRNAARKLIHHYSLNSTSSTEYKISDVVMTMIFLLRSEKYHSLFKLLETTFDDYTCRPQMTQVQTDTLLDAVRSLLEMPSTTIDLTTVDIMRSSFARCFNSPIMRYAKIVLLQNVALQRDKRTTLEELLIERGEKIQMLQPQQYINSGTEIPFCDDAEFLNRLLKHIDPYPLSRMYYNAANTMFYTTMENYAVSNCKFNIEDYNNIFKVMENIRKHSNKNSNDQDELNIYLGVQSSNAKRKKY

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region
分子量 formula_weight	38070.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,W

MASSLQSKWICLRLNDAIIKRHVLVLSEYADLKYLGFEKYKFFEYVIFQFCNDPQLCKIIENNYNYCMQIFKAPADDMRDIRHNIKRAFKTPVLGHMCVLSNKPPMYSFLKEWFLLPHYKVVSLKSESLTWGFPHVVVFDLDSTLITEEEQVEIRDPFVYDSLQELHEMGCVLVLWSYGSRDHVAHSMRDVDLEGYFDIIISEGSTVQEERSDLVQNSHNAIVDYNLKKRFIENKFVFDIHNHRSDNNIPKSPKIVIKYLSDKNVNFFKSITLVDDLPTNNYAYDFYVKVKRCPTPVQDWEHYHNEIIQNIMDYEQYFIK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Protein AC142
分子量 formula_weight	55480.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,X

MSGGGNLLTLERDHFKYLFLTSYFDLKDNEHVPSEPMAFIRNYLNCTFDLLDDAVLMNYFNYLQSMQLKHLVGSTSTNIFKFVKPQFRFVCDRTTVDILEFDTRMYIKPGTPVYATNLFTSNPRKMMAFLYAEFGKVFKNKIFVNINNYGCVLAGSAGFLFDDAYVDWNGVRMCAAPRLDNNMHPFRLYLLGEDMAKHFVDNNILPPHPSNAKTRKINNSMFMLKNFYKGLPLFKSKYTVVNSTKIVTRKPNDIFNEIDKELNGNCPFIKFIQRDYIFDAQFPPDLLDLLNEYMTKSSIMKIITKFVIEENPAMSGEMSREIILDRYSVDNYRKLYIKMEITNQFPVMYDHESSYIFVSKDFLQLKGTMNAFYAPKQRILSILAVNRLFGATETIDFHPNLLVYRQSSPPVRLTGDVYVVDKNEKVFLVKHVFSNTVPAYLLIRGDYESSSDLKSLRDLNPWVQNTLLKLLIPDSVQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Major capsid protein
分子量 formula_weight	38991.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,M,N,Y,Z,e,f

MALVPVGMAPRQMRVNRCIFASIVSFDACITYKSPCSPDAYHDDGWFICNNHLIKRFKMSKMVLPIFDEDDNQFKMTIARHLVGNKERGIKRILIPSATNYQDVFNLNSMMQAEQLIFHLIYNNENAVNTICDNLKYTEGFTSNTQRVIHSVYATTKSILDTTNPNTFCSRVSRDELRFFDVTNARALRGGAGDQLFNNYSGFLQNLIRRAVAPEYLQIDTEELRFRNCATCIIDETGLVASVPDGPELYNPIRSSDIMRSQPNRLQIRNVLKFEGDTRELDRTLSGYEEYPTYVPLFLGYQIINSENNFLRNDFIPRANPNATLGGGAVAGPAPGVAGEAGGGIAV

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Capsid-associated protein VP80
分子量 formula_weight	79974.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,a,b,c

MNDSNSLLITRLAAQILSRNMQTVDVIVDDKTLSLEEKIDTLTSMVLAVNSPPQSPPRVTSSDLAASIIKNNSKMVGNDFEMRYNVLRMAVVFVKHYPKYYNETTAGLVAEIESNLLQYQNYVNQGNYQNIEGYDSLLNKAEECYVKIDRLFKESIKKIMDDTEAFEREQEAERLRAEQTAANALLERRAQTSADDVVNRADANIPTAFSDPLPGPSAPRYMYESSESDTYMETARRTAEHYTDQDKDYNAAYTADEYNSLVKTVLLRLIEKALATLKNRLHITTIDQLKKFRDYLNSDADAGEFQIFLNQEDCVILKNLSNLASKFFNVRCVADTLEVMLEALRNNIELVQPESDAVRRIVIKMTQEIKDSSTPLYNIAMYKSDYDAIKNKNIKTLFDLYNDRLPINFLDTSATSPVRKTSGKRSAEDDLLPTRSSKRANRPEINVISSEDEQEDDDVEDVDYEKESKRRKLEDEDFLKLKALEFSKDIVNEKLQKIIVVTDGMKRLYEYCNCKNSLETLPSAANYGSLLKRLNLYNLDHIEMNVNFYELLFPLTLYNDNDNSDKTLSHQLVNYIFLASNYFQNCAKNFNYMRETFNVFGPFKQIDFMVMFVIKFNFLCDMRNFAKLIDELVPNKQPNMRIHSVLVMRDKIVKLAFSNLQFQTFSKKDKSRNTKHLQRLIMLMNANYNVI

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Protein AC109
分子量 formula_weight	44851.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,d

MECPFQIQVCISDRFFAFPHNLVEPQSDVGNKLIENLIVYVPTDDDRLYIDKKQFPKFNSVLVYRHEHDVNIDSRSPKKTASATIVYWNPLVPITEIGAGETRVFSVLLTNNLFYCNTMIVHHENPKCPIEFTYPETDMQSACSALLKNRNGQSVPPPIKSNLRPIACEIPLSHFKELVESNDFLLCFNLETSTMVKILSLKRIFCIFQYRKQPARYVINLPHEEIDNLYNKLNWERTRRLMKGDVPSNCATVNRSSLKYIKQAQSLLGIPDYSQTVVDFVKMFQKIIFPYQLVPNVIIKLNNFDQMVSSAPNKAEPYKKIRLFCKNDSIAISSSGIVPINMPDFSPPNTFDYSDYANRTNINFVTQRVLTDGGFSSGITVTPVKYNYYL

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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分辨率 resolution	5.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	35066

AcMNPV complete basal cap

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Occlusion-derived virus envelope protein E27

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein C42

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized 38.0 kDa protein in P143-LEF5 intergenic region

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein AC142

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Major capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Capsid-associated protein VP80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein AC109

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9h2a__assembly_1__model_1

9h2a__assembly_1__model_1 | I(q)

9h2a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer