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1TVB
Crystal structure of Melanoma Antigen gp100(209-217) Bound to Human Class I MHC HLA-A2
提交 2004-06-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
209–217(9 aa)
片段:residues 209-217
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未记录
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GOL GLYCEROL × 9
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
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1TVB
Crystal structure of Melanoma Antigen gp100(209-217) Bound to Human Class I MHC HLA-A2
提交 2004-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 F
209–217(9 aa)
片段:residues 209-217
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未记录
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GOL GLYCEROL × 13
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
|
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1TVH
Crystal structure of Modified Melanoma Antigen gp100(209-T2M) Bound to Human Class I MHC HLA-A2
提交 2004-06-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
209–217(9 aa)
片段:residues 209-217
|
未记录
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GOL GLYCEROL × 13
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.247
|
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1TVH
Crystal structure of Modified Melanoma Antigen gp100(209-T2M) Bound to Human Class I MHC HLA-A2
提交 2004-06-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 F
209–217(9 aa)
片段:residues 209-217
|
未记录
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GOL GLYCEROL × 15
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 3350, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.247
|
|
3CC5
H-2Db complex with human gp100
提交 2008-02-24
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
25–33(9 aa)
片段:Extracellular part, UNP residues 25-33
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% PEG 6000, 0.1M Ammonium sulfate, 0.1M Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.268
|
|
3CC5
H-2Db complex with human gp100
提交 2008-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 F
25–33(9 aa)
片段:Extracellular part, UNP residues 25-33
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% PEG 6000, 0.1M Ammonium sulfate, 0.1M Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.268
|
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4IS6
Crystal structure of HLA-DR4 bound to GP100 peptide
提交 2013-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
44–59(16 aa)
片段:UNP residues 44-59
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG8000, magnesium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.298
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6VM7
SILv44 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100 peptide (ITDQVPFSV)
提交 2020-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
209–217(9 aa)
片段:epitope (UNP residues 209-217)
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未记录
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GOL GLYCEROL × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;16% v/v PEG3350, 280 mM ammonium citrate dibasic
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.241
|
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6VM8
SILv44 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2M peptide (IMDQVPFSV)
提交 2020-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
209–217(9 aa)
片段:epitope (UNP residues 209-217)
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突变:T210M
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FLC CITRATE ANION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;20% v/v PEG3350, 236 mM ammonium citrate dibasic
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分辨率 2.41 Å
R-free 0.221
|
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6VM9
T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2M peptide (IMDQVPFSV)
提交 2020-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
209–217(9 aa)
片段:epitope (UNP residues 209-217)
|
突变:T210M
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;296 K;18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 250 mM Tris pH 8.5, 60 mM sodium chloride, seeded with crushed crystals
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.250
|
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6VMA
T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100 peptide (ITDQVPFSV)
提交 2020-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
209–217(9 aa)
片段:epitope (UNP residues 209-217)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;296 K;18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 100 mM Tris pH 8.5, 100 mM sodium chloride
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分辨率 2.75 Å
R-free 0.219
|
|
6VMC
T4H2 T cell receptor bound to HLA-A2 presenting gp100T2L peptide (ILDQVPFSV)
提交 2020-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
209–217(9 aa)
片段:epitope (UNP residues 209-217)
|
突变:T210L
|
GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;296 K;18% v/v PEG10000, 16% v/v glycerol, 250 mM Tris pH 8.5, 60 mM sodium chloride
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.238
|
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7PHR
Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I
提交 2021-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:undecameric
|
链 P
280–288(9 aa)
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突变:A9V
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å
|
|
9JST
Wild-type native PMEL amyloid - polymorph 1
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
148–182(35 aa)
链 B
148–182(35 aa)
链 C
148–182(35 aa)
链 D
148–182(35 aa)
链 E
148–182(35 aa)
链 F
148–182(35 aa)
链 G
148–182(35 aa)
链 H
148–182(35 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 4.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å
|
|
9JSU
Wild-type native PMEL amyloid - polymorph 2
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
151–183(33 aa)
链 B
151–183(33 aa)
链 C
151–183(33 aa)
链 D
151–183(33 aa)
链 E
151–183(33 aa)
链 F
151–183(33 aa)
链 G
151–183(33 aa)
链 H
151–183(33 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 4.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å
|
|
9JSV
G175S mutant native PMEL amyloid
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
149–182(34 aa)
链 B
149–182(34 aa)
链 C
149–182(34 aa)
链 D
149–182(34 aa)
链 E
149–182(34 aa)
链 F
149–182(34 aa)
链 G
149–182(34 aa)
链 H
149–182(34 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 4.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å
|
|
9JSW
Wild-type PMEL CAF amyloid -in vitro polymerized
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
148–182(35 aa)
链 B
148–182(35 aa)
链 C
148–182(35 aa)
链 D
148–182(35 aa)
链 E
148–182(35 aa)
链 F
148–182(35 aa)
链 G
148–182(35 aa)
链 H
148–182(35 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 4.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.94 Å
|
|
9JSX
G175S PMEL CAF amyloid - in vitro polymerized
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
149–182(34 aa)
链 B
149–182(34 aa)
链 C
149–182(34 aa)
链 D
149–182(34 aa)
链 E
149–182(34 aa)
链 F
149–182(34 aa)
链 G
149–182(34 aa)
链 H
149–182(34 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 4.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.79 Å
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