SAXSdb — 9m1k

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin-specific chaperone E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–527	未记录	Tubulin-specific chaperone D × 1 （Q9BTW9） ADP-ribosylation factor-like protein 2 × 1 （P36404） Tubulin beta chain × 1 （Q767L7） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9M1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4ICU Ubiquitin-like domain of human tubulin folding cofactor E - crystal from A 提交 2012-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 443–527（85 aa）片段：Ubiquitin-like domain, UNP residues 443-527	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate and 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
4ICU Ubiquitin-like domain of human tubulin folding cofactor E - crystal from A 提交 2012-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 443–527（85 aa）片段：Ubiquitin-like domain, UNP residues 443-527	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate and 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
4ICU Ubiquitin-like domain of human tubulin folding cofactor E - crystal from A 提交 2012-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 443–527（85 aa）片段：Ubiquitin-like domain, UNP residues 443-527	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate and 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
4ICU Ubiquitin-like domain of human tubulin folding cofactor E - crystal from A 提交 2012-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 443–527（85 aa）片段：Ubiquitin-like domain, UNP residues 443-527	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate and 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
4ICV Ubiquitin-like domain of human tubulin folding cofactor E - crystal form B 提交 2012-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 443–527（85 aa）片段：Ubiquitin-like domain, UNP residues 443-527	未记录	PR PRASEODYMIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；100 mM Bis Tris pH 6.5 and 43 % (v/v) PEG 400 and 10 mM praseodymium (III) acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.45 Å R-free 0.189
9M1J Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 129–527（399 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
9M1L Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–527（527 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å
9M1M Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–527（527 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.21 Å

共 5 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBCE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527

Tubulin-specific chaperone D

Homo sapiens

UniProt Q9BTW9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–1192	未记录	Tubulin-specific chaperone E × 1 （Q15813） ADP-ribosylation factor-like protein 2 × 1 （P36404） Tubulin beta chain × 1 （Q767L7） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9M1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9M1I Cryo-EM structure of the TBC-D-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1192（1192 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
9M1J Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 19–1186（1168 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
9M1L Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–1192（1192 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å
9M1M Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–1192（1192 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.21 Å
9M1N Cryo-EM structure of the TBC-DC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–1192（1192 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.24 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBCD_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1192； UniProt 1–1192

ADP-ribosylation factor-like protein 2

Homo sapiens

UniProt P36404

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–184	未记录	Tubulin-specific chaperone E × 1 （Q15813） Tubulin-specific chaperone D × 1 （Q9BTW9） Tubulin beta chain × 1 （Q767L7） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9M1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3DOE Complex of ARL2 and BART, Crystal Form 1 提交 2008-07-04	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–184（184 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；0.1M bicine, 10% PEG 6000, 20mM hexammine cobalt (III) chloride, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.25 Å R-free 0.261
3DOF Complex of ARL2 and BART, Crystal Form 2 提交 2008-07-04	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–184（184 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；0.2M MgCl2, 20% PEG 3350, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.294
9M1I Cryo-EM structure of the TBC-D-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–184（184 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
9M1J Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–184（184 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
9M1L Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–184（184 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å
9M1M Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–184（184 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.21 Å
9M1N Cryo-EM structure of the TBC-DC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–184（184 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.24 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARL2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184

Tubulin beta chain

Sus scrofa

UniProt Q767L7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 1–444	未记录	Tubulin-specific chaperone E × 1 （Q15813） Tubulin-specific chaperone D × 1 （Q9BTW9） ADP-ribosylation factor-like protein 2 × 1 （P36404） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9M1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8YY2 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8YY3 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
8YY4 Kinesin-14 with AlF3 bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
8YY5 Kinesin-14 with AlF3 bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.99 Å
9M1I Cryo-EM structure of the TBC-D-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 b 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
9M1J Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex 提交 2025-02-26	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 b 1–431（431 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
9M1L Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 b 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å
9M1M Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 b 1–444（444 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.21 Å
9M1N Cryo-EM structure of the TBC-DC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 b 1–444（444 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.24 Å
9UMU Giraffe KIF5A motor domain in nucleotide free state bound to microtubule 提交 2025-04-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBB5_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–444； UniProt 1–444

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9m1k
沉积日期 deposition_date	2025-02-26
结构标题 title	Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex with GTP
关键词 keywords	chaperone, complex; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.63 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.33 Å
零角强度 I(0) i0	613515000.00
分子量 molecular_weight	203470.0 kDa
排除体积 excluded_volume	254860 Å³
包络体积 envelope_volume	339230 Å³
水化壳体积 shell_volume	67828 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.4 Å
壳层 Rg shell_rg	47.38 Å
包络 Rg envelope_rg	40.88 Å
形状 Rg shape_rg	41.32 Å
总 Rg total_rg	41.68 Å
总原子数 total_atoms	14281
残基数 n_residues	1807
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	136.3 Å
Rg (实空间) rg_real	41.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.97 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.1350e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1790e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.63 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	613500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8911
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	46.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.302
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.481
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	81840000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.897; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.890

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tubulin-specific chaperone E
分子量 formula_weight	59422.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	14281

MSDTLTADVIGRRVEVNGEHATVRFAGVVPPVAGPWLGVEWDNPERGKHDGSHEGTVYFKCRHPTGGSFIRPNKVNFGTDFLTAIKNRYVLEDGPEEDRKEQIVTIGNKPVETIGFDSIMKQQSQLSKLQEVSLRNCAVSCAGEKGGVAEACPNIRKVDLSKNLLSSWDEVIHIADQLRHLEVLNVSENKLKFPSGSVLTGTLSVLKVLVLNQTGITWAEVLRCVAGCPGLEELYLESNNIFISERPTDVLQTVKLLDLSSNQLIDENQLYLIAHLPRLEQLILSDTGISSLHFPDAGIGCKTSMFPSLKYLVVNDNQISQWSFFNELEKLPSLRALSCLRNPLTKEDKEAETARLLIIASIGQLKTLNKCEILPEERRRAELDYRKAFGNEWKQAGGHKDPEKNRLSEEFLTAHPRYQFLCLKYGAPEDWELKTQQPLMLKNQLLTLKIKYPHQLDQKVLEKQLPGSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSDLLLSYESPKKPGREIELENDLKSLQFYSVENGDCLLVRW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tubulin-specific chaperone D
分子量 formula_weight	132752.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MALSDEPAAGGPEEEAEDETLAFGAALEAFGESAETRALLGRLREVHGGGAEREVALERFRVIMDKYQEQPHLLDPHLEWMMNLLLDIVQDQTSPASLVHLAFKFLYIITKVRGYKTFLRLFPHEVADVEPVLDLVTIQNPKDHEAWETRYMLLLWLSVTCLIPFDFSRLDGNLLTQPGQARMSIMDRILQIAESYLIVSDKARDAAAVLVSRFITRPDVKQSKMAEFLDWSLCNLARSSFQTMQGVITMDGTLQALAQIFKHGKREDCLPYAATVLRCLDGCRLPESNQTLLRKLGVKLVQRLGLTFLKPKVAAWRYQRGCRSLAANLQLLTQGQSEQKPLILTEDDDEDDDVPEGVERVIEQLLVGLKDKDTVVRWSAAKGIGRMAGRLPRALADDVVGSVLDCFSFQETDKAWHGGCLALAELGRRGLLLPSRLVDVVAVILKALTYDEKRGACSVGTNVRDAACYVCWAFARAYEPQELKPFVTAISSALVIAAVFDRDINCRRAASAAFQENVGRQGTFPHGIDILTTADYFAVGNRSNCFLVISVFIAGFPEYTQPMIDHLVTMKISHWDGVIRELAARALHNLAQQAPEFSATQVFPRLLSMTLSPDLHMRHGSILACAEVAYALYKLAAQENRPVTDHLDEQAVQGLKQIHQQLYDRQLYRGLGGQLMRQAVCVLIEKLSLSKMPFRGDTVIDGWQWLINDTLRHLHLISSHSRQQMKDAAVSALAALCSEYYMKEPGEADPAIQEELITQYLAELRNPEEMTRCGFSLALGALPGFLLKGRLQQVLTGLRAVTHTSPEDVSFAESRRDGLKAIARICQTVGVKAGAPDEAVCGENVSQIYCALLGCMDDYTTDSRGDVGTWVRKAAMTSLMDLTLLLARSQPELIEAHTCERIMCCVAQQASEKIDRFRAHAASVFLTLLHFDSPPIPHVPHRGELEKLFPRSDVASVNWSAPSQAFPRITQLLGLPTYRYHVLLGLVVSLGGLTESTIRHSTQSLFEYMKGIQSDPQALGSFSGTLLQIFEDNLLNERVSVPLLKTLDHVLTHGCFDIFTTEEDHPFAVKLLALCKKEIKNSKDIQKLLSGIAVFCEMVQFPGDVRRQALLQLCLLLCHRFPLIRKTTASQVYETLLTYSDVVGADVLDEVVTVLSDTAWDAELAVVREQRNRLCDLLGVPRPQLVPQPGAC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ADP-ribosylation factor-like protein 2
分子量 formula_weight	20904.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MGLLTILKKMKQKERELRLLMLGLDNAGKTTILKKFNGEDIDTISPTLGFNIKTLEHRGFKLNIWDVGGQKSLRSYWRNYFESTDGLIWVVDSADRQRMQDCQRELQSLLVEERLAGATLLIFANKQDLPGALSSNAIREVLELDSIRSHHWCIQGCSAVTGENLLPGIDWLLDDISSRIFTAD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Tubulin beta chain
分子量 formula_weight	49717.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Sus scrofa

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.45 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	515321

fit	/app/data/saxs_computation/m1/9m1k/9m1k.fit
pddf	/app/data/pr_computation/m1/9m1k/9m1k.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/m1/9m1k/9m1k.dat

Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-beta-tubulin complex with GTP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin-specific chaperone E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin-specific chaperone D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ADP-ribosylation factor-like protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)