SAXSdb — 9ofs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin heavy constant alpha 2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 4 其他聚合物 2 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 109–322	未记录	Immunoglobulin alpha Fc receptor × 2 （P24071） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.15M sodium chloride 0.1M Tris-HCl pH 8.0 20% PEG 1000	分辨率 1.95 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9OFS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6UE8 Structure of tetrameric sIgA complex (Class 1) 提交 2019-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 B 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 E 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 F 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 G 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 H 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 K 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 L 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6UE9 Structure of tetrameric sIgA complex (Class 2) 提交 2019-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 B 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 E 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 F 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 G 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 H 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 K 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 L 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6UEA Structure of pentameric sIgA complex 提交 2019-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 B 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 E 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 F 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 G 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 H 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 I 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 J 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 K 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340 链 L 110–340（231 aa）片段：UNP residues 110-340	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IGHA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 109–322

Immunoglobulin alpha Fc receptor

Homo sapiens

UniProt P24071

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 4 其他聚合物 2 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 22–216	未记录	Immunoglobulin heavy constant alpha 2 × 2 （P01877） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.15M sodium chloride 0.1M Tris-HCl pH 8.0 20% PEG 1000	分辨率 1.95 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9OFS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1OVZ Crystal structure of human FcaRI 提交 2003-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–216（195 aa）片段：ectodomain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；296 K；PEG 8000, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 3.00 Å R-free 0.292
1OVZ Crystal structure of human FcaRI 提交 2003-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 22–216（195 aa）片段：ectodomain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；296 K；PEG 8000, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 3.00 Å R-free 0.292
1OW0 Crystal structure of human FcaRI bound to IgA1-Fc 提交 2003-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 22–216（195 aa）片段：ectodomain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；magnesium sulfate heptahydrate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 3.10 Å R-free 0.284
1OW0 Crystal structure of human FcaRI bound to IgA1-Fc 提交 2003-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 22–216（195 aa）片段：ectodomain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；magnesium sulfate heptahydrate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 3.10 Å R-free 0.284
1OW0 Crystal structure of human FcaRI bound to IgA1-Fc 提交 2003-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–216（195 aa）片段：ectodomain 链 D 22–216（195 aa）片段：ectodomain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；magnesium sulfate heptahydrate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 3.10 Å R-free 0.284
1UCT Crystal structure of the extracellular fragment of Fc alpha Receptor I (CD89) 提交 2003-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–229（210 aa）片段：RESIDUES 0-217	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG4000, sodium citrate, ethanol glycol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8SKU Structure of human SIgA1 in complex with human CD89 (FcaR1) 提交 2023-04-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 R 22–216（195 aa）链 S 22–216（195 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9OFR CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN IGA1 FC FRAGMENT-FC-ALPHA RECEPTOR (CD89) COMPLEX 提交 2025-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 22–216（195 aa）链 D 22–216（195 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.15M sodium chloride 0.1M Tris-HCl pH 8.0 8% PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.264
9OFR CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN IGA1 FC FRAGMENT-FC-ALPHA RECEPTOR (CD89) COMPLEX 提交 2025-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 22–216（195 aa）链 H 22–216（195 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.15M sodium chloride 0.1M Tris-HCl pH 8.0 8% PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.264

共 5 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FCAR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–195； UniProt 22–216

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ofs
沉积日期 deposition_date	2025-04-30
最后修订 last_revision	2026-05-13
结构标题 title	Crystal structure of the human IGA2m2 FC fragment-FC-alpha receptor (CD89) complex
关键词 keywords	IMMUNOGLOBULIN, IgAm2, IMMUNE SYSTEM, IMMUNOGLOBULIN-LIKE BETA SANDWICH, FC FRAGMENT, FC alpha RECEPTOR, CD89; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	29.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	29.01 Å
零角强度 I(0) i0	35966600.00
分子量 molecular_weight	46470.0 kDa
排除体积 excluded_volume	58097 Å³
包络体积 envelope_volume	76987 Å³
水化壳体积 shell_volume	24142 Å³
包络直径 envelope_diameter	105.2 Å
壳层 Rg shell_rg	33.30 Å
包络 Rg envelope_rg	28.96 Å
形状 Rg shape_rg	28.99 Å
总 Rg total_rg	29.54 Å
总原子数 total_atoms	3269
残基数 n_residues	404
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	99.8 Å
Rg (实空间) rg_real	29.53 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.98 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.5970e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.1060e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	29.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	35960000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6877
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	29.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.409
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.461
角度范围 angular_range	— – 0.2700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3407000.0000
实空间数据点数 n_real_points	55
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.218; Positv: 1.000; Valcen: 0.829; Smooth: 0.879

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Immunoglobulin heavy constant alpha 2
分子量 formula_weight	23287.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3443

CCHPRLSLHRPALEDLLLGSEANLTCTLTGLRDASGATFTWTPSSGKSAVQGPPERDLCGCYSVSSVLPGCAQPWNHGETFTCTAAHPELKTPLTANITKSGNTFRPEVHLLPPPSEELALNELVTLTCLARGFSPKDVLVRWLQGSQELPREKYLTWASRQEPSQGTTTYAVTSILRVAAEDWKKGETFSCMVGHEALPLAFTQKTIDRLAGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Immunoglobulin alpha Fc receptor
分子量 formula_weight	23615.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

QEGDFPMPFISAKSSPVIPLDGSVKIQCQAIREAYLTQLMIIKNSTYREIGRRLKFWNETDPEFVIDHMDANKAGRYQCQYRIGHYRFRYSDTLELVVTGLYGKPFLSADRGLVLMPGENISLTCSSAHIPFDRFSLAKEGELSLPQHQSGEHPANFSLGPVDLNVSGIYRCYGWYNRSPYLWSFPSNALELVVTAIDGRAHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	748.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	166

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	46.637 Å
晶胞边长 b length_b	128.955 Å
晶胞边长 c length_c	183.355 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	31.690 Å
R 因子 r_factor	0.2287
R_work r_work	0.2273
R_free r_free	0.2533

fit	/app/data/saxs_computation/of/9ofs/9ofs.fit
pddf	/app/data/pr_computation/of/9ofs/9ofs.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/of/9ofs/9ofs.dat

Crystal structure of the human IGA2m2 FC fragment-FC-alpha receptor (CD89) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin heavy constant alpha 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Immunoglobulin alpha Fc receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)