SAXSdb — 9q75

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5

Trypanosoma cruzi Dm28c

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 × 1 （A0A2V2UXK5） SULFATE ION × 3 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 × 1 （A0A2V2UXK5） SULFATE ION × 1 ;2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(S)-({(2R,3R,4R,5R)-3-{[(R)-{[(2R,3R,4R,5R)-3-{[(S)-{[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-{[(S)-hydroxy{[(2R,3R,4R,5R)-3-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy}phosphoryl]oxy}-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-[6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl]-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl}methoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-7-methyl-6-oxo-6,9-dihydro-3H-purin-7-ium ; × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 × 1 （A0A2V2UXK5） SULFATE ION × 1 ;2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(S)-({(2R,3R,4R,5R)-3-{[(R)-{[(2R,3R,4R,5R)-3-{[(S)-{[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-{[(S)-hydroxy{[(2R,3R,4R,5R)-3-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy}phosphoryl]oxy}-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-[6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl]-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl}methoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-7-methyl-6-oxo-6,9-dihydro-3H-purin-7-ium ; × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2V2XI07_TRYCR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200 作者链 C； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200 作者链 E； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200

Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1

Trypanosoma cruzi Dm28c

UniProt A0A2V2UXK5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5 × 1 （A0A2V2XI07） SULFATE ION × 3 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5 × 1 （A0A2V2XI07） SULFATE ION × 1 ;2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(S)-({(2R,3R,4R,5R)-3-{[(R)-{[(2R,3R,4R,5R)-3-{[(S)-{[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-{[(S)-hydroxy{[(2R,3R,4R,5R)-3-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy}phosphoryl]oxy}-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-[6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl]-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl}methoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-7-methyl-6-oxo-6,9-dihydro-3H-purin-7-ium ; × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5 × 1 （A0A2V2XI07） SULFATE ION × 1 ;2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(S)-({(2R,3R,4R,5R)-3-{[(R)-{[(2R,3R,4R,5R)-3-{[(S)-{[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-{[(S)-hydroxy{[(2R,3R,4R,5R)-3-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy}phosphoryl]oxy}-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-[6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl]-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl}methoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-7-methyl-6-oxo-6,9-dihydro-3H-purin-7-ium ; × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2V2UXK5_TRYCR
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–42； UniProt 108–147 作者链 D； PDB构建体 3–42； UniProt 108–147 作者链 F； PDB构建体 3–42； UniProt 108–147

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9q75
沉积日期 deposition_date	2025-08-22
最后修订 last_revision	2026-01-21
结构标题 title	Crystal structure of T. cruzi EIF4E5 in complex with EIF4G1 peptide and cap-4.
关键词 keywords	TRANSLATION INITIATION FACTOR, EIF4E FAMILY, EIF4E5, EIF4G1, CAP-4, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9q75__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9q75__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9q75__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.62 Å
Rg（电子密度）	17.40 Å
总 Rg	18.42 Å
原子数	1959
残基数	227
排除体积	34493 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9q75__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`9q75__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`9q75__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5
分子量 formula_weight	22611.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	6748

MKETAHALKDPWFLSYIPQLTPDTVKYDFKGDWNKAKQALQQPLDYIRTVEEFWSTINSLPKLHQLGNGSTFIFARNNVDASYEAFPNGTRVLVDLYKASVAEKGMDFVLSSVLGEGLTYDVFNGKKVCDVVRLSSRPNQESPELVRLEVWLSDQLYAKDVIPYIRKGLNEAGLSFTDFIMGESTFEKDKKKPSVSGAKS

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma cruzi Dm28c
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1416333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1
分子量 formula_weight	5798.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

MGFTEAATEKRVYPPEMFLSARRDAAHTPYGVLRWVVRHYLHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma cruzi Dm28c
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1416333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(S)-({(2R,3R,4R,5R)-3-{[(R)-{[(2R,3R,4R,5R)-3-{[(S)-{[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-{[(S)-hydroxy{[(2R,3R,4R,5R)-3-hydroxy-4-methoxy-5-(3-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy}phosphoryl]oxy}-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-[6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl]-4-methoxytetrahydrofuran-2-yl}methoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-7-methyl-6-oxo-6,9-dihydro-3H-purin-7-ium ;
分子量 formula_weight	1826.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	572

▶

晶胞边长 a length_a	88.380 Å
晶胞边长 b length_b	88.889 Å
晶胞边长 c length_c	110.165 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.770 Å
最低分辨率 resolution_low	25.210 Å
R 因子 r_factor	0.1605
R_work r_work	0.1576
R_free r_free	0.2150

Crystal structure of T. cruzi EIF4E5 in complex with EIF4G1 peptide and cap-4.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9q75__assembly_2__model_1

9q75__assembly_2__model_1 | I(q)

9q75__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of T. cruzi EIF4E5 in complex with EIF4G1 peptide and cap-4.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Eukaryotic translation initiation factor 4E type 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9q75__assembly_2__model_1

9q75__assembly_2__model_1 | I(q)

9q75__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)