SAXSdb — 9qtp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 1 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 2 （P80650）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTRB_METMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F

物种未注明

UniProt P80654

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 1 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 2 （P80650）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTRF_METMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H

物种未注明

UniProt P80650

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 1 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 1 （P80654）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTRH_METMA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 o； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 p； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9qtp
沉积日期 deposition_date	2025-04-09
结构标题 title	Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder
关键词 keywords	;Sodium-pumping, membrane-bound, methyltransferase complex, methanogen, methanogenic, methylotrophic, archaeon, archaea, methanosarcina, methanosarcina mazei, Vitamin B12, corrinoid, cobalt, 5-hydroxybenzimidazole, small protein, oxygen-sensitive, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9qtp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9qtp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9qtp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.97 Å
Rg（电子密度）	25.81 Å
总 Rg	26.62 Å
原子数	5082
残基数	670
排除体积	91021 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9qtp__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B
分子量 formula_weight	11879.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	5082

MSIVRIAPEINLVMDTESGTVTQERKDSIQYSMEPVFERVDKLDAIADDLVNSLSPSKPLLNTWPGRENTSYIAGIYSNSFYGIIVGLAFSGLLALIIYITRLMGGVV

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F
分子量 formula_weight	7574.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MAEEHEKGVPMVLAPQMGAIDATVESIRYRAQLIARNQKLDSGVAATGIIGFAAGFLFSLLMVIVLPVAVGL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H
分子量 formula_weight	34075.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o,p

MFKFDKKQEVFELGGVKFGGQPGENPTVLVSTMFYARHKIVTDEDKGIFDRAAAETLWNTQVSLSDATGLPYVNQIVGETPESIKRYIEWFVGIDDRTPFLIDSSAGNVRAAAAQYCTEIGVADRAIHNSINASIEQSEIDVLTESDVSAAIVLAFNATDPTVKGKIDILEVGGSGQTKGMLQVAKECGIKYPIIDVAAMPLGAGSGATIRSVPTLKGKFGLPIGGGYHNMASAWDWLRKFKKTQPDPKAIYMPTDIGTNLVAQIAGSDYLLYGPIENVNQIFPAVAMVDIMLGETAKELGVEIADLENHPVTKLT

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	136531

Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9qtp__assembly_1__model_1

9qtp__assembly_1__model_1 | I(q)

9qtp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9qtp__assembly_1__model_1

9qtp__assembly_1__model_1 | I(q)

9qtp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)