9qts

Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A

Methanosarcina mazei Go1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRA_METMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 B； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 C； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80655

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRB_METMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108 作者链 E； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108 作者链 F； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C

Methanosarcina mazei Go1

UniProt O59638

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRC_METMA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–267； UniProt 1–267 作者链 H； PDB构建体 1–267； UniProt 1–267 作者链 I； PDB构建体 1–267； UniProt 1–267

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80653

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRD_METMA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 K； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 L； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80651

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRE_METMA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304 作者链 N； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304 作者链 O； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80654

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRF_METMA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72 作者链 Q； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72 作者链 R； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80656

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRG_METMA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72 作者链 T； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72 作者链 U； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Conserved protein

Methanosarcina mazei Go1

UniProt Q8PUD4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H × 6 （P80650） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q8PUD4_METMA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 i； PDB构建体 1–68； UniProt 1–68

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H

Methanosarcina mazei Go1

UniProt P80650

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A × 3 （O59640） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B × 3 （P80655） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C × 3 （O59638） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D × 3 （P80653） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E × 3 （P80651） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F × 3 （P80654） Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G × 3 （P80656） Conserved protein × 1 （Q8PUD4） 5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE × 1 2-Hydroxy-archaetidylinositol × 6 3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL × 3 Archaetidylinositol × 3 SODIUM ION × 3 Archaetidylethanolamine × 3 water × 22	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MTRH_METMA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 m； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 n； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 o； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 p； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 q； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316 作者链 r； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9qts
沉积日期 deposition_date	2025-04-09
结构标题 title	Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder
关键词 keywords	;Sodium-pumping, membrane-bound, methyltransferase complex, methanogen, methanogenic, methylotrophic, archaeon, archaea, methanosarcina, methanosarcina mazei, Vitamin B12, corrinoid, cobalt, 5-hydroxybenzimidazole, small protein, oxygen-sensitive, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9qts__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9qts__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9qts__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	58.06 Å
Rg（电子密度）	58.05 Å
总 Rg	58.25 Å
原子数	42783
残基数	5432
排除体积	747980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9qts__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A
分子量 formula_weight	25395.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	45424

MADKREPAPGWPILKGEYEVGDVKNSVLVITCGSHLPGKPILDAGAACTGSCKTENLGIEKVVAHIISNPNIRYLLVTGSEVKGHITGQSMMSLHANGVKENRIAGALGAIPYVENLNAAAVARFQEQVQVVNLLDTEDMGAITSKVRELASKDPGAFDADPLVVEISEEGEEEEEGGVVRPVSGEIAVLRSRLKAIEARMMDIGNLNKFHSGVHAGKVEGAMIGLTITISLLGLLLLGR

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrA
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B
分子量 formula_weight	11879.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MSIVRIAPEINLVMDTESGTVTQERKDSIQYSMEPVFERVDKLDAIADDLVNSLSPSKPLLNTWPGRENTSYIAGIYSNSFYGIIVGLAFSGLLALIIYITRLMGGVV

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrB
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C
分子量 formula_weight	26953.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I

MSAGGAGGEAKGAYPQQTLMALGIVGGLVGIYLGHFMPPAYSFFGGIGAICATVWGADAVRRVASYGLGTGVPSIGMLALGMGILAALFGLALGGIAGPILAVVVAAIIGGVIGALANKVIGMGIPIMEQAMIEISCAGTLVILGLSVVIAGSFDYAAIIENVIANGYIALIFIIGGMGILHPFNACLGPDESQDRTLILAVEKAAIALIITGFASSLHEGLMTAGINILVGLVIWYVAFSKYYALIKRDAYAVVGTGLLPSAEELQ

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D
分子量 formula_weight	25279.8 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,K,L

MIDAILGNILWMVFIIIGGVLISWGVHFVPVGGAPAAMAQATGVGTGTVQLATGAGLTGLVSAGFMMNVTDNFPLIVASGAVGAMIMIAVTMIVGTWIYVYGVGCVPSSAKVKVDPITKYRQDLYVSQGTEGHGIPTVSFVSGVIGAALGGIGGSLIYYSLIEVGVSVGLERVGVTSAVTGNSLVAVAAIFAIGIFLVNAVIPSYNIGGTIEGFHDPKFKKWPKAVISSVVASILCAIVAVIAIAQLGGI

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrD
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E
分子量 formula_weight	35539.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N,O

MEPLIGMGVLALIGVAATIAGASEDLESDIGSQSNPNSQVQLAPQMMFPHRIFNKAISGEPPSNALMCSIGAAIATVLISEFTVSPLFALVFGSVIAASVHATFAVTATMGRCASQSRFKQPIYLDMIRSHTPAIMGYAFITTFCVLIVSYLMTVVLGHPFPLTMLAFIWGITIGAIGSSTGDVHYGAEREFQQFEFGSGLNASNSGNIVRYAESGLRNGFDNSWFCSKFGGPTTGIAFGMTVFLGSWITTIFDPAQGLSMGWLSVIAGVIIVLILIIWNWKIEVQARKAYGPYKEDKAEEASASAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F
分子量 formula_weight	7574.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,R

MAEEHEKGVPMVLAPQMGAIDATVESIRYRAQLIARNQKLDSGVAATGIIGFAAGFLFSLLMVIVLPVAVGL

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrF
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G
分子量 formula_weight	8030.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,T,U

MDGKAPAAFVEPGEFNEVMKRLDQIDEKVEFVNSEVAQRIGKKVGRDIGILYGGVIGLLLFLIYVQISSMFM

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrG
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Conserved protein
分子量 formula_weight	7623.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MKCEACGRESDTKYCNDCGKVMDEVVRRVGEARWAAIDDCSFIYPLVQRVGRGEATVNDIIQALDVED

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H
分子量 formula_weight	34075.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,n,o,p,q,r

MFKFDKKQEVFELGGVKFGGQPGENPTVLVSTMFYARHKIVTDEDKGIFDRAAAETLWNTQVSLSDATGLPYVNQIVGETPESIKRYIEWFVGIDDRTPFLIDSSAGNVRAAAAQYCTEIGVADRAIHNSINASIEQSEIDVLTESDVSAAIVLAFNATDPTVKGKIDILEVGGSGQTKGMLQVAKECGIKYPIIDVAAMPLGAGSGATIRSVPTLKGKFGLPIGGGYHNMASAWDWLRKFKKTQPDPKAIYMPTDIGTNLVAQIAGSDYLLYGPIENVNQIFPAVAMVDIMLGETAKELGVEIADLENHPVTKLT

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina mazei Go1
通用名 common_name	MtrH
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	192952
宿主生物 host_organism	Methanosarcina mazei Go1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	5-HYDROXYBENZIMIDAZOLYLCOB(III)AMIDE
分子量 formula_weight	1321.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-Hydroxy-archaetidylinositol
分子量 formula_weight	836.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	3-PHOSPHORYL-[1,2-DI-PHYTANYL]GLYCEROL
分子量 formula_weight	733.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	Archaetidylinositol
分子量 formula_weight	911.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	Archaetidylethanolamine
分子量 formula_weight	776.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 16 Entity 16 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2641

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	150000

Structure of the energy converting methyltransferase (Mtr) of Methanosarcina mazei in complex with a novel protein binder

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Conserved protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9qts__assembly_1__model_1

9qts__assembly_1__model_1 | I(q)

9qts__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment