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9rm3

Crystal structure of human CD22 Ig domains 1-3 in complex with modified sialoside 17

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

B-cell receptor CD22

Homo sapiens

UniProt P20273

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SULFATE ION × 1 ;(2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[[(2R,3R,4S,5R,6S)-6-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-(2-azanylethoxy)-2-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-3-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]methoxy]-6-[(1R,2R)-1,2-bis(oxidanyl)-3-[(3-phenoxyphenyl)carbonylamino]propyl]-4-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid ; × 1 与蛋白数一致
2 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SULFATE ION × 1 ;(2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[[(2R,3R,4S,5R,6S)-6-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-(2-azanylethoxy)-2-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-3-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]methoxy]-6-[(1R,2R)-1,2-bis(oxidanyl)-3-[(3-phenoxyphenyl)carbonylamino]propyl]-4-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid ; × 1 与蛋白数一致
3 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SULFATE ION × 1 ;(2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[[(2R,3R,4S,5R,6S)-6-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-(2-azanylethoxy)-2-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-3-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]methoxy]-6-[(1R,2R)-1,2-bis(oxidanyl)-3-[(3-phenoxyphenyl)carbonylamino]propyl]-4-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid ; × 1 与蛋白数一致
4 其他组合 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;(2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[[(2R,3R,4S,5R,6S)-6-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-(2-azanylethoxy)-2-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-3-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]methoxy]-6-[(1R,2R)-1,2-bis(oxidanyl)-3-[(3-phenoxyphenyl)carbonylamino]propyl]-4-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid ; × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
5vkj 5vkm 5vl3 5vl3 5vl3 5vl3 9rm3 9rm3 9rm3 9rm3 9ro7 9ro7

共 16 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CD22_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–314； UniProt 20–330 作者链 B； PDB构建体 4–314； UniProt 20–330 作者链 C； PDB构建体 4–314； UniProt 20–330 作者链 D； PDB构建体 4–314； UniProt 20–330

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9rm3
沉积日期 deposition_date2025-06-17
最后修订 last_revision2026-01-28
结构标题 titleCrystal structure of human CD22 Ig domains 1-3 in complex with modified sialoside 17
关键词 keywordsSiglec, sialic acid, B cell, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rm3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rm3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rm3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）32.72 Å
Rg（电子密度）33.20 Å
总 Rg33.29 Å
原子数2489
残基数300
排除体积43902 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9rm3__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 9rm3__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 9rm3__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 9rm3__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)