SAXSdb — 9rsw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N6-adenosine-methyltransferase catalytic subunit

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	N(6)-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit METTL14 × 1 （Q9HCE5） 8-[4-[(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenyl]-2-[6-(methylamino)pyrimidin-4-yl]-2,5,8-triazaspiro[3.5]nonan-6-one × 1 ACETATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTA70_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–228； UniProt 354–580

N(6)-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit METTL14

Homo sapiens

UniProt Q9HCE5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	N6-adenosine-methyltransferase catalytic subunit × 1 （Q86U44） 8-[4-[(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenyl]-2-[6-(methylamino)pyrimidin-4-yl]-2,5,8-triazaspiro[3.5]nonan-6-one × 1 ACETATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MET14_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 19–307； UniProt 107–395

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9rsw
沉积日期 deposition_date	2025-07-01
结构标题 title	Crystal structure of the human METTL3-METTL14 in complex with compound 4
关键词 keywords	METTL3, inhibitor, complex, m6A, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rsw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rsw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rsw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.73 Å
Rg（电子密度）	23.94 Å
总 Rg	24.61 Å
原子数	3394
残基数	441
排除体积	59964 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9rsw__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	N6-adenosine-methyltransferase catalytic subunit
分子量 formula_weight	26017.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.348
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3402

MALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGRAMELGRECLNLWGYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVGVKGNPQGFNQGLDCDVIVAEVRSTSHKPDEIYGMIERLSPGTRKIELFGRPHNVQPNWITLGNQLDGIHLLDPDVVARFKQRYPDGIISKPKNL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	N(6)-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit METTL14
分子量 formula_weight	35690.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MHHHHHHSSGRENLYFQGLKGTQSLNPHNDYCQHFVDTGHRPQNFIRDVGLADRFEEYPKLRELIRLKDELIAKSNTPPMYLQADIEAFDIRELTPKFDVILLEPPLEEYYRETGITANEKCWTWDDIMKLEIDEIAAPRSFIFLWCGSGEGLDLGRVCLRKWGYRRCEDICWIKTNKNNPGKTKTLDPKAVFQRTKEHCLMGIKGTVKRSTDGDFIHANVDIDLIITEEPEIGNIEKPVEIFHIIEHFCLGRRRLHLFGRDSTIRPGWLTVGPTLTNSNYNAETYASYFSAPNSYLTGCTEEIERL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	8-[4-[(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenyl]-2-[6-(methylamino)pyrimidin-4-yl]-2,5,8-triazaspiro[3.5]nonan-6-one
分子量 formula_weight	465.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

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晶胞边长 a length_a	64.190 Å
晶胞边长 b length_b	64.190 Å
晶胞边长 c length_c	227.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	2.560 Å
最低分辨率 resolution_low	44.820 Å
R 因子 r_factor	0.2195
R_work r_work	0.2178
R_free r_free	0.2510

Crystal structure of the human METTL3-METTL14 in complex with compound 4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N6-adenosine-methyltransferase catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

N(6)-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit METTL14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9rsw__assembly_1__model_1

9rsw__assembly_1__model_1 | I(q)

9rsw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the human METTL3-METTL14 in complex with compound 4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N6-adenosine-methyltransferase catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

N(6)-adenosine-methyltransferase non-catalytic subunit METTL14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9rsw__assembly_1__model_1

9rsw__assembly_1__model_1 | I(q)

9rsw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)